日本固有種（爬虫類）
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| アオカナヘビ | アオカナヘビ | Takydromus smaragdinus |
| アオダイショウ | アオダイショウ | Elaphe climacophora |
| アカマタ | アカマタ | Dinodon semicarinatum |
| アマミタカチホヘビ | アマミタカチホヘビ | Achalinus werneri |
| アマミヤモリ | アマミヤモリ | Gekko vertebralis |
| イシガキトカゲ | イシガキトカゲ | Plestiodon stimpsonii |
| イワサキセダカヘビ | イワサキセダカヘビ | Pareas iwasakii |
| イワサキワモンベニヘビ | イワサキワモンベニヘビ | Sinomicrurus macclellandi iwasakii |
| オオシマトカゲ | オオシマトカゲ | Plestiodon oshimensis |
| オガサワラトカゲ | オガサワラトカゲ | Cryptoblepharus nigropunctatus |
| オカダトカゲ | オカダトカゲ | Plestiodon latiscutatus |
| オキナワキノボリトカゲ | オキナワキノボリトカゲ | Japalura polygonata polygonata |
| オキナワトカゲ | オキナワトカゲ | Plestiodon marginatus |
| オビトカゲモドキ | オビトカゲモドキ | Goniurosaurus splendens |
| ガラスヒバァ | ガラスヒバァ | Hebius pryeri |
| キクザトサワヘビ | キクザトサワヘビ | Opisthotropis kikuzatoi |
| キシノウエトカゲ | キシノウエトカゲ | Plestiodon kishinouyei |
| クチノシマトカゲ | クチノシマトカゲ | Plestiodon kuchinoshimensis |
| クロイワトカゲモドキ | クロイワトカゲモドキ | Goniurosaurus kuroiwae |
| サキシマアオヘビ | サキシマアオヘビ | Cyclophiops herminae |
| サキシマカナヘビ | サキシマカナヘビ | Takydromus dorsalis |
| サキシマキノボリトカゲ | サキシマキノボリトカゲ | Japalura polygonata ishigakiensis |
| サキシマスジオ | サキシマスジオ | Elaphe taeniura schmackeri |
| サキシマスベトカゲ | サキシマスベトカゲ | Scincella boettgeri |
| サキシマバイカダ | サキシマバイカダ | Lycodon ruhstrati multifasciatus |
| サキシマハブ | サキシマハブ | Protobothrops elegans |
| サキシママダラ | サキシママダラ | Dinodon rufozonatum walli |
| シマヘビ | シマヘビ | Elaphe quadrivirgata |
| ジムグリ | ジムグリ | Euprepiophis conspicillatus |
| シロマダラ | シロマダラ | Dinodon orientale |
| センカクトカゲ | センカクトカゲ | Plestiodon takarai |
| タカラヤモリ | タカラヤモリ | Gekko shibatai |
| タワヤモリ | タワヤモリ | Gekko tawaensis |
| ダンジョヒバカリ | ダンジョヒバカリ | Hebius vibakari danjoensis |
| ツシママムシ | ツシママムシ | Gloydius tsushimaensis |
| トカラハブ | トカラハブ | Protobothrops tokarensis |
| ニホンイシガメ | ニホンイシガメ | Mauremys japonica |
| ニホンカナヘビ | ニホンカナヘビ | Takydromus tachydromoides |
| ニホントカゲ | ニホントカゲ | Plestiodon japonicus |
| ニホンマムシ | ニホンマムシ | Gloydius blomhoffii |
| バーバートカゲ | バーバートカゲ | Plestiodon barbouri |
| ハブ | ハブ | Protobothrops flavoviridis |
| ヒバカリ | ヒバカリ | Hebius vibakari vibakari |
| ヒメハブ | ヒメハブ | Ovophis okinavensis |
| ヒャン | ヒャン | Sinomicrurus japonicus |
| ヘリグロヒメトカゲ | ヘリグロヒメトカゲ | Ateuchosaurus pellopleurus |
| ミヤコカナヘビ | ミヤコカナヘビ | Takydromus toyamai |
| ミヤコヒバァ | ミヤコヒバァ | Hebius concelarus |
| ミヤコヒメヘビ | ミヤコヒメヘビ | Calamaria pfefferi |
| ミヤラヒメヘビ | ミヤラヒメヘビ | Calamaria pavimentata miyarai |
| ヤエヤマイシガメ | ヤエヤマイシガメ | Mauremys mutica kami |
| ヤエヤマセマルハコガメ | ヤエヤマセマルハコガメ | Cuora flavomarginata evelynae |
| ヤエヤマタカチホヘビ | ヤエヤマタカチホヘビ | Achalinus formosanus chigirai |
| ヤエヤマヒバァ | ヤエヤマヒバァ | Hebius ishigakiensis |
| ヤクヤモリ | ヤクヤモリ | Gekko yakuensis |
| ヤマカガシ | ヤマカガシ | Rhabdophis tigrinus |
| ヨナグニキノボリトカゲ | ヨナグニキノボリトカゲ | Japalura polygonata donan |
| ヨナグニシュウダ | ヨナグニシュウダ | Elaphe carinata yonaguniensis |
| リュウキュウアオヘビ | リュウキュウアオヘビ | Cyclophiops semicarinatus |
| リュウキュウヤマガメ | リュウキュウヤマガメ | Geoemyda japonica |