日本固有種（植物（維管束））
日本固有種（植物（維管束））
| 植物（維管束） | 苔類 | 鳥類 | 爬虫類 | 哺乳類 | 両生類 | 魚類 | 戻る |
| 名前 | 読み方 | 学名 | 備考 |
| 合飛鳥猪の手 | アイアスカイノデ | Polystichum longifrons Sa.Kurata | |
| 会津菅 | アイズスゲ | Carex hondoensis Ohwi | |
| 会津姫薊 | アイヅヒメアザミ | Cirsium aidzuense Nakai ex Kitam. | |
| アイノコホラシノブ | アイノコホラシノブ | Sphenomeris intermedia S.J.Lin, M.Kato et K.Iwats. | |
| 青鴎蔓 | アオカモメヅル | Cynanchum ambiguum (Maxim.) Kom. | |
| アオグキイヌワラビ | アオグキイヌワラビ | Athyrium viridescentipes Sa.Kurata | シダ植物 |
| 青小空木 | アオコウツギ | Deutzia ogatae Koidz. | |
| 青椨 | アオダモ | Fraxinus lanuginosa Koidz. var. serrata (Nakai) H.Hara | |
| アオツリバナ | アオツリバナ | Euonymus yakushimensis Makino | |
| アオテンナンショウ | アオテンナンショウ | Arisaema tosaense Makino | |
| アオナシ | アオナシ | Pyrus ussuriensis Maxim. var. hondoensis (Nakai et Kikuchi) Rehder | |
| アオナラガシワ | アオナラガシワ | Quercus aliena Blume var. pellucida Blume | |
| アオナリヒラ | アオナリヒラ | Semiarundinaria fastuosa (Mitford) Makino ex Nakai var. viridis Makino | |
| アオバスゲ | アオバスゲ | Carex papillaticulmis Ohwi | |
| アオバナハイノキ | アオバナハイノキ | Symplocos liukiuensis Matsum. var. liukiuensis | |
| アオバノニセゴマゴケ | アオバノニセゴマゴケ | Anisomeridium platypodum G.Thor et al. | 地衣類 |
| アオバノニセゴマゴケ | アオバノニセゴマゴケ | Arthonia biseptella Nyl. | 地衣類 |
| アオバヤマザサ | アオバヤマザサ | Sasaella sawadae (Makino) Makino ex Koidz. var. aobayamana Sad.Suzuki | |
| アオヒエスゲ | アオヒエスゲ | Carex subdita Ohwi | |
| アオフタバラン | アオフタバラン | Neottia makinoana (Ohwi) Szlach. | |
| アオベンケイ | アオベンケイ | Hylotelephium viride (Makino) H.Ohba | |
| アオホオズキ | アオホオズキ | Physaliastrum japonicum (Franch. et Sav.) Honda | |
| アオミヤマカンスゲ | アオミヤマカンスゲ | Carex multifolia Ohwi var. pallidisquama Ohwi | |
| アオモリアザミ | アオモリアザミ | Cirsium aomorense Nakai | |
| アオモリマンテマ | アオモリマンテマ | Silene aomorensis M.Mizush. | |
| アオヤギバナ | アオヤギバナ | Solidago yokusaiana Makino | |
| アカイシコウゾリナ | アカイシコウゾリナ | Picris hieracioides L. subsp. japonica (Thunb.) Krylov var. akaishiensis Kitam. | |
| アカイシヒョウタンボク | アカイシヒョウタンボク | Lonicera mochidzukiana Makino var. filiformis Koidz. | |
| アカイシリンドウ | アカイシリンドウ | Gentianopsis yabei (Takeda et H.Hara) Ma ex Toyok. var. akaisiensis T.Yamaz. | |
| アカイタヤ | アカイタヤ | Acer pictum Thunb. subsp. mayrii (Schwer.) H.Ohashi | |
| アカギイボゴケ | アカギイボゴケ | Bacidia akagiensis (Vain.) Yasuda | 地衣類 |
| アカショウマ | アカショウマ | Astilbe thunbergii (Siebold et Zucc.) Miq. var. thunbergii | |
| アカバナエゾノコギリソウ | アカバナエゾノコギリソウ | Achillea alpina L. subsp. pulchra (Koidz.) Kitam. | |
| アカバナシモツケソウ | アカバナシモツケソウ | Filipendula multijuga Maxim. var. ciliata Koidz. | |
| アカバナヒメイワカガミ | アカバナヒメイワカガミ | Schizocodon ilicifolius Maxim. var. australis T.Yamaz. | |
| アカヒダボタン | アカヒダボタン | Chrysosplenium nagasei Wakab. et H.Ohba var. porphyranthes Wakab. et H.Ohba | |
| アカフユノハナワラビ | アカフユノハナワラビ | Botrychium ternatum (Thunb.) Sw. var. pseudoternatum (Sahashi) M.Kato | シダ植物 |
| アカボシタツナミソウ | アカボシタツナミソウ | Scutellaria rubropunctata Hayata var. rubropunctata | |
| アカミノブドウ | アカミノブドウ | Cayratia yoshimurae (Makino) Honda | |
| アカモノ | アカモノ | Gaultheria adenothrix (Miq.) Maxim. | |
| アカヤシオ | アカヤシオ | Rhododendron pentaphyllum Maxim. var. nikoense Komatsu | |
| アキギリ | アキギリ | Salvia glabrescens (Franch. et Sav.) Makino var. glabrescens | |
| アキザキバケイスゲ | アキザキバケイスゲ | Carex mochomuensis Katsuy. | |
| アキチョウジ | アキチョウジ | Rabdosia longituba (Miq.) H.Hara | |
| アキノハイルリソウ | アキノハイルリソウ | Omphalodes akiensis Kadota | |
| アキハギク | アキハギク | Aster sugimotoi Kitam. | |
| アキヨシアザミ | アキヨシアザミ | Cirsium dipsacolepis (Maxim.) Matsum. var. calcicola (Nakai) Kitam. | |
| アクシバモドキ | アクシバモドキ | Vaccinium yakushimense Makino | |
| アケボノツツジ | アケボノツツジ | Rhododendron pentaphyllum Maxim. var. shikokianum T.Yamaz. | |
| アコウザンショウ | アコウザンショウ | Zanthoxylum ailanthoides Siebold et Zucc. var. boninshimae (Koidz. ex H.Hara) T.Yamaz. ex H.Ohba | |
| アサギスズメノヒエ | アサギスズメノヒエ | Luzula lutescens (Koidz.) Kirschner et Miyam. | |
| アサノハカエデ | アサノハカエデ | Acer argutum Maxim. | |
| アサヒエビネ | アサヒエビネ | Calanthe hattorii Schltr. | |
| アサマヒゴタイ | アサマヒゴタイ | Saussurea savatieri Franch. | |
| アサマリンドウ | アサマリンドウ | Gentiana sikokiana Maxim. | |
| アシカゴケ | アシカゴケ | Graphidastra japonica A.Sakata & H.Harada | 地衣類 |
| アシズリノジギク | アシズリノジギク | Chrysanthemum japonense (Makino) Nakai var. ashizuriense Kitam. | |
| アシダカシコロゴケ | アシダカシコロゴケ | Parmeliella asahinae (R?s?nen) P.M.J?rg. | 地衣類 |
| アシタカジャコウソウ | アシタカジャコウソウ | Chelonopsis yagiharana Hisauti et Matsuno | |
| アシタカツツジ | アシタカツツジ | Rhododendron komiyamae Makino | |
| アシタバ | アシタバ | Angelica keiskei (Miq.) Koidz. | |
| アシノクラアザミ | アシノクラアザミ | Cirsium ashinokuraense Kadota | |
| アシボソスゲ | アシボソスゲ | Carex scita Maxim. var. brevisquama (Koidz.) Ohwi | |
| アスカイノデ | アスカイノデ | Polystichum fibrillosopaleaceum (Kodama) Tagawa var. fibrillosopaleaceum | シダ植物 |
| アスナロ | アスナロ | Thujopsis dolabrata (L.f.) Siebold et Zucc. var. dolabrata | |
| アスナロマルゴケ | アスナロマルゴケ | Porina thujopsicola G.Thor et al. | 地衣類 |
| アズマイバラ | アズマイバラ | Rosa onoei Makino var. oligantha (Franch. et Sav.) H.Ohba | |
| アズマギク | アズマギク | Erigeron thunbergii A.Gray subsp. thunbergii | |
| アズマザサ | アズマザサ | Sasaella ramosa (Makino) Makino var. ramosa | |
| アズマシャクナゲ | アズマシャクナゲ | Rhododendron degronianum Carrière var. degronianum | |
| アズマシライトソウ | アズマシライトソウ | Chionographis hisauchiana (Okuyama) N.Tanaka subsp. hisauchiana | |
| アズマシロカネソウ | アズマシロカネソウ | Dichocarpum nipponicum (Franch.) W.T.Wang et P.K.Hsiao | |
| アズマスゲ | アズマスゲ | Carex lasiolepis Franch. | |
| アズマネザサ | アズマネザサ | Pleioblastus chino (Franch. et Sav.) Makino var. chino | |
| アズマホシクサ | アズマホシクサ | Eriocaulon takaii Koidz. | |
| アズマミヤコザサ | アズマミヤコザサ | Sasa chartacea (Makino) Makino et Shibata var. simotsukensis Sad.Suzuki | |
| アズマヤマアザミ | アズマヤマアザミ | Cirsium microspicatum Nakai var. microspicatum | |
| アズマレイジンソウ | アズマレイジンソウ | Aconitum pterocaule Koidz. var. pterocaule | |
| アズミイノデ | アズミイノデ | Polystichum microchlamys (H.Christ) Matsum. var. azumiense Seriz. | |
| アズミトリカブト | アズミトリカブト | Aconitum azumiense Kadota et Hashido | |
| アズミノヘラオモダカ | アズミノヘラオモダカ | Alisma canaliculatum A.Braun et C.D.Bouché var. azuminoense Kadono et Hamashima | |
| アゼトウナ | アゼトウナ | Crepidiastrum keiskeanum (Maxim.) Nakai | |
| アセビ | アセビ | Pieris japonica (Thunb.) D.Don ex G.Don var. japonica | |
| アソシケシダ | アソシケシダ | Deparia otomasui (Sa.Kurata) Seriz. | シダ植物 |
| アソタイゲキ | アソタイゲキ | Euphorbia pekinensis Rupr. subsp. asoensis T.Kuros. et H.Ohashi | |
| アソタカラコウ | アソタカラコウ | Ligularia fischeri (Ledeb.) Turcz. var. takeyukii, nom. nud. | |
| アソノコギリソウ | アソノコギリソウ | Achillea alpina L. subsp. subcartilaginea (Heimerl) Kitam. | |
| アタミシノ | アタミシノ | Sasaella atamiana (Nakai) Sad.Suzuki var. atamiana | |
| アッカゼキショウ | アッカゼキショウ | Tofieldia coccinea Richards. var. akkana (T.Shimizu) T.Shimizu | |
| アッケシアザミ | アッケシアザミ | Cirsium ito-kojianum Kadota | |
| アツバシマザクラ | アツバシマザクラ | Hedyotis pachyphylla Tuyama | |
| アツバシロテツ | アツバシロテツ | Boninia grisea Planch. var. crassifolia (Nakai) T.Yamaz. ex H.Ohba | |
| アツバスミレ | アツバスミレ | Viola mandshurica W.Becker var. triangularis (Franch. et Sav.) M.Mizush. | |
| アツミカンアオイ | アツミカンアオイ | Asarum rigescens F.Maek. var. rigescens | |
| アツミチイ（オオミレプラゴケ） | アツミチイ（オオミレプラゴケ） | Lepraria ohmiensis Kashiw. et al. | 地衣類 |
| アテツマンサク | アテツマンサク | Hamamelis japonica Siebold et Zucc. var. bitchuensis (Makino) Ohwi | |
| アナゴケ | アナゴケ | Rhabdodiscus inalbescens (Nyl.) Frisch | 地衣類 |
| アナゴケ | アナゴケ | Rhabdospora haematommatum Kalb & Hafellner | 地衣類 |
| アナゴケ | アナゴケ | Rhizocarpon atrobrunnescens (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| アナゴマゴケ（ヤマトゴマシオゴケ） | アナゴマゴケ（ヤマトゴマシオゴケ） | Arthothelium japonicum (Vain. ex Yasuda) H.Harada | 地衣類 |
| アブクマトラノオ | アブクマトラノオ | Bistorta abukumensis Yonek., Iketsu et H.Ohashi | |
| アブラチャン | アブラチャン | Lindera praecox (Siebold et Zucc.) Blume | |
| アブラツツジ | アブラツツジ | Enkianthus subsessilis (Miq.) Makino | |
| アベトウヒレン | アベトウヒレン | Saussurea kurosawae Kitam. | |
| アポイアザミ | アポイアザミ | Cirsium apoense Nakai | |
| アポイアズマギク | アポイアズマギク | Erigeron thunbergii A.Gray subsp. glabratus (A.Gray) H.Hara var. angustifolius (Tatew.) H.Hara | |
| アポイカンバ | アポイカンバ | Betula apoiensis Nakai | |
| アポイキンバイ | アポイキンバイ | Potentilla matsumurae Th.Wolf var. apoiensis (Nakai) H.Hara | |
| アポイザサ | アポイザサ | Sasa samaniana Nakai var. samaniana | |
| アポイタヌキラン | アポイタヌキラン | Carex apoiensis Akiyama | |
| アポイツメクサ | アポイツメクサ | Arenaria katoana Makino var. lanceolata Tatew. | |
| アポイマンテマ | アポイマンテマ | Silene repens Patrin var. apoiensis H.Hara | |
| アマギアマチャ | アマギアマチャ | Hydrangea serrata (Thunb.) Ser. var. angustata (Franch. et Sav.) H.Ohba | |
| アマギウメノキゴケ | アマギウメノキゴケ | Myelochroa amagiensis (Asahina) Elix & Hale | 地衣類 |
| アマギカンアオイ | アマギカンアオイ | Asarum muramatsui Makino | |
| アマギシャクナゲ | アマギシャクナゲ | Rhododendron degronianum Carrière var. amagianum (T.Yamaz.) T.Yamaz. | |
| アマギツツジ | アマギツツジ | Rhododendron amagianum (Makino) Makino ex Nemoto | |
| アマギテンナンショウ | アマギテンナンショウ | Arisaema kuratae Seriz. | |
| アマギベニウツギ | アマギベニウツギ | Weigela decora (Nakai) Nakai var. amagiensis (Nakai) H.Hara | |
| アマクサミツバツツジ | アマクサミツバツツジ | Rhododendron amakusaense (K.Takada ex T.Yamaz.) T.Yamaz. | |
| アマシバ | アマシバ | Symplocos microcalyx Hayata | |
| アマチャ | アマチャ | Hydrangea serrata (Thunb.) Ser. var. thunbergii (Siebold) H.Ohba | |
| アマヅル | アマヅル | Vitis saccharifera Makino var. saccharifera | |
| アマミアオネカズラ | アマミアオネカズラ | Polypodium amamianum Tagawa | シダ植物 |
| アマミアオネカズラ | アマミアオネカズラ | Goniophlebium amamianum (Tagawa) Nakaike | シダ植物 |
| アマミアセビ | アマミアセビ | Pieris amamioshimensis Setoguchi et Y. Maeda | |
| アマミアラカシ | アマミアラカシ | Quercus glauca Thunb. var. amamiana (Hatus.) Hatus. ex H.Ohba | |
| アマミアワゴケ | アマミアワゴケ | Ophiorrhiza yamashitae (T.Yamaz.) Kokub., Koh Nakam. et Yokota | |
| アマミイナモリ | アマミイナモリ | Ophiorrhiza amamiana (Hatus.) Koh Nakam., Denda,. Kameshima et Yokota | |
| アマミエビネ | アマミエビネ | Calanthe amamiana Fukuy. | |
| アマミカタバミ | アマミカタバミ | Oxalis amamiana Hatus. | |
| アマミクサアジサイ | アマミクサアジサイ | Cardiandra amamiohsimensis Koidz. | |
| アマミサネゴケ | アマミサネゴケ | Pyrenula cylindrica Kashiw. | 地衣類 |
| アマミザンショウ | アマミザンショウ | Zanthoxylum amamiense Ohwi | |
| アマミサンショウソウ | アマミサンショウソウ | Elatostema oshimense (Hatus.) T.Yamaz. | |
| アマミシダ | アマミシダ | Diplazium amamianum Tagawa | シダ植物 |
| アマミスミレ | アマミスミレ | Viola amamiana Hatus. | |
| アマミセイシカ | アマミセイシカ | Rhododendron latoucheae Franch. var. amamiense (Ohwi) T.Yamaz. | |
| アマミタツナミソウ | アマミタツナミソウ | Scutellaria rubropunctata Hayata var. naseana T.Yamaz. | |
| アマミタムラソウ | アマミタムラソウ | Salvia pygmaea Matsum. var. simplicior Hatus. ex T.Yamaz. | |
| アマミデンダ | アマミデンダ | Polystichum obae Tagawa | シダ植物 |
| アマミテンナンショウ | アマミテンナンショウ | Arisaema heterocephalum Koidz. subsp. heterocephalum | |
| アマミトンボ | アマミトンボ | Platanthera mandarinorum Rchb.f. subsp. hachijoensis (Honda) Murata var. amamiana (Ohwi) K.Inoue | |
| アマミヒイラギモチ | アマミヒイラギモチ | Ilex dimorphophylla Koidz. | |
| アマミヒサカキ | アマミヒサカキ | Eurya osimensis Masam. | |
| アマミフユイチゴ | アマミフユイチゴ | Rubus amamianus Hatus. et Ohwi | |
| アラカワカンアオイ | アラカワカンアオイ | Asarum ikegamii (F.Maek. ex Y.Maek.) T.Sugaw. var. fujimakii T.Sugaw. | |
| アラゲサクラツツジ | アラゲサクラツツジ | Rhododendron tashiroi Maxim. var. lasiophyllum Hatus. ex T.Yamaz. | |
| アラゲナツハゼ | アラゲナツハゼ | Vaccinium ciliatum Thunb. | |
| アラゲネザサ | アラゲネザサ | Pleioblastus hattorianus Koidz. | |
| アラゲヒョウタンボク | アラゲヒョウタンボク | Lonicera strophiophora Franch. var. strophiophora | |
| アラシグサ | アラシグサ | Boykinia lycoctonifolia (Maxim.) Engl. | |
| アリマイトスゲ | アリマイトスゲ | Carex alterniflora Franch. var. arimaensis Ohwi | |
| アリマグミ | アリマグミ | Elaeagnus murakamiana Makino | |
| アリマコスズ | アリマコスズ | Neosasamorpha kagamiana (Makino et Uchida) Koidz. subsp. yoshinoi (Koidz.) Sad.Suzuki | |
| アリマシノ | アリマシノ | Sasaella kogasensis (Nakai) Nakai ex Koidz. var. yoshinoi (Koidz.) Sad.Suzuki | |
| アワギボウシ | アワギボウシ | Hosta kikutii F.Maek. var. densinervia N.Fujita et M.N.Tamura | |
| アワコバイモ | アワコバイモ | Fritillaria muraiana Ohwi | |
| アワサビイボゴケ | アワサビイボゴケ | Lopadium japonicum Zahlbr. | 地衣類 |
| アワチドリ | アワチドリ | Ponerorchis graminifolia Rchb.f. var. suzukiana (Ohwi) Soó | |
| アワノミネザサ | アワノミネザサ | Sasa minensis Sad.Suzuki var. awaensis Sad.Suzuki | |
| アワムヨウラン | アワムヨウラン | Lecanorchis trachycaula Ohwi | |
| アワモリショウマ | アワモリショウマ | Astilbe japonica (C.Morren et Decne.) A.Gray | |
| アンドウチャシブゴケ | アンドウチャシブゴケ | Lecanora andoi H.Miyawaki | 地衣類 |
| アンドウチャシブゴケ | アンドウチャシブゴケ | Lecanora atrolactea R?s?nen | 地衣類 |
| イイデトリカブト | イイデトリカブト | Aconitum iidemontanum Kadota, Y.Kita et K.Ueda | |
| イイデリンドウ | イイデリンドウ | Gentiana nipponica Maxim. var. robusta H.Hara | |
| イイヌマムカゴ | イイヌマムカゴ | Platanthera iinumae (Makino) Makino | |
| イエジマチャセンシダ | イエジマチャセンシダ | Asplenium oligophlebium Baker var. iezimaense (Tagawa) Tagawa | シダ植物 |
| イオウトウキイチゴ | イオウトウキイチゴ | Rubus boninensis Koidz. | |
| イオウトウフヨウ | イオウトウフヨウ | Hibiscus pacificus Nakai ex Jotani et H.Ohba | |
| イオウノボタン | イオウノボタン | Melastoma candidum D.Don var. alessandrense S. Kobay. | |
| イガタツナミ | イガタツナミ | Scutellaria laeteviolacea Koidz. var. kurokawae (H.Hara) H.Hara | |
| イカリソウ | イカリソウ | Epimedium grandiflorum C.Morren var. thunbergianum (Miq.) Nakai | |
| イギサワイボゴケ | イギサワイボゴケ | Verrucaria igii H.Harada | 地衣類 |
| イクノゴマゴケ（イクノホシゴケモドキ） | イクノゴマゴケ（イクノホシゴケモドキ） | Arthopyrenia ikouno?nsis M?ll.Arg. | 地衣類 |
| イシガキカラスウリ | イシガキカラスウリ | Trichosanthes ishigakiensis E.Walker | |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Calicium muriformis Tibell | 地衣類 |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Caloplaca atricolor (Hue) Zahlbr. | 地衣類 |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Caloplaca citrina (Hoffm.) Th.Fr. var. vulcanica (R?s?nen) Cretz. var. vulcanica (R?s?nen) Cretz. | 地衣類 |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Caloplaca commutans (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Caloplaca dyseimata (Hue) Zahlbr. | 地衣類 |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Caloplaca ferruginea (Huds.) Th. Fr. var. bungo?nsis (R?s?nen) Cretz. var. bungo?nsis (R?s?nen) Cretz. | 地衣類 |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Caloplaca fumosa (Vain.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Caloplaca gilvofumosa (Vain.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Caloplaca hakkodensis (R?s?nen) T.Okamoto | 地衣類 |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Caloplaca kobeana (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Caloplaca leptopisma (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Caloplaca leucerythrella (Nyl.) Zahlbr. var. caesiorufescens (Nyl.) Zahlbr. var. caesiorufescens (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Caloplaca phacodes (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Caloplaca phaeocarpodes (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Caloplaca rubeola (Hue) Zahlbr. | 地衣類 |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Caloplaca septella (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Caloplaca tabidella (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イシガキピンゴケ | イシガキピンゴケ | Candelaria fibrosa var. placodiomorpha (R?s?nen) M.Sat? var. placodiomorpha (R?s?nen) M.Sat? | 地衣類 |
| イシダテクサタチバナ | イシダテクサタチバナ | Cynanchum ascyrifolium (Franch. et Sav.) Matsum. var. calcareum (H.Ohashi) T.Yamaz. | |
| イシヅチウスバアザミ | イシヅチウスバアザミ | Cirsium ishizuchiense (Kitam.) Kadota | |
| イシヅチカラマツ | イシヅチカラマツ | Thalictrum minus L. var. yamamotoi (Honda) Sugim. ex Kadota | |
| イシヅチコザクラ | イシヅチコザクラ | Primula modesta Bisset et S.Moore var. shikokumontana Miyabe et Tatew. | |
| イシヅチテンナンショウ | イシヅチテンナンショウ | Arisaema ishizuchiense Murata | |
| イシヅチボウフウ | イシヅチボウフウ | Angelica saxicola Makino ex Y.Yabe var. saxicola | |
| イズアサツキ | イズアサツキ | Allium schoenoprasum L. var. idzuense (H.Hara) H.Hara | |
| イズイワギボウシ | イズイワギボウシ | Hosta longipes (Franch. et Sav.) Matsum. var. latifolia F.Maek. | |
| イズカニコウモリ | イズカニコウモリ | Parasenecio amagiensis (Kitam.) H.Koyama | |
| イズコゴメグサ | イズコゴメグサ | Euphrasia insignis Wettst. subsp. iinumae (Takeda) T.Yamaz. var. idzuensis (Takeda) T.Yamaz. | |
| イズコザラゴケ | イズコザラゴケ | Gyalidea izuensis H.Harada | 地衣類 |
| イズサワイボゴケ | イズサワイボゴケ | Verrucaria izuensis H.Harada | 地衣類 |
| イズノシマウメバチソウ | イズノシマウメバチソウ | Parnassia palustris L. var. izuinsularis H.Ohba | |
| イズノシマダイモンジソウ | イズノシマダイモンジソウ | Saxifraga fortunei Hook.f. var. jotanii (Honda) Wakab. | |
| イズノシマホシクサ | イズノシマホシクサ | Eriocaulon zyotanii Satake | |
| イズハイホラゴケ | イズハイホラゴケ | Vandenboschia orientalis (C.Chr.) Ching | シダ植物 |
| イズマルミゴケ | イズマルミゴケ | Thelidium izuense H.Harada | 地衣類 |
| イズモコバイモ | イズモコバイモ | Fritillaria ayakoana Maruy. et Naruh. | |
| イズヤブソテツ | イズヤブソテツ | Cyrtomium fortunei J.Sm. var. atropunctatum (Sa.Kurata) K.Iwats. | |
| イセアオスゲ | イセアオスゲ | Carex karashidaniensis Akiyama | |
| イセノカンアオイ | イセノカンアオイ | Asarum savatieri F.Maek. subsp. pseudosavatieri (F.Maek.) T.Sugaw. var. iseanum T.Sugaw. | |
| イソアオスゲ | イソアオスゲ | Carex leucochlora Bunge var. meridiana Akiyama | |
| イソギク | イソギク | Chrysanthemum pacificum Nakai | |
| イソスミレ | イソスミレ | Viola grayi Franch. et Sav. | |
| イソテンツキ | イソテンツキ | Fimbristylis pacifica Ohwi | |
| イソニガナ | イソニガナ | Ixeris dentata (Thunb.) Nakai subsp. nipponica (Nakai) Kitam. | |
| イチョウバイカモ | イチョウバイカモ | Ranunculus nipponicus Nakai var. nipponicus | |
| イチリンソウ | イチリンソウ | Anemone nikoensis Maxim. | |
| イツキカナワラビ | イツキカナワラビ | Arachniodes cantilenae Sa.Kurata | シダ植物 |
| イッショウチザサ | イッショウチザサ | Neosasamorpha magnifica (Nakai) Sad.Suzuki subsp. maginifica | |
| イッスンキンカ | イッスンキンカ | Solidago minutissima (Makino) Kitam. | |
| イッスンテンツキ | イッスンテンツキ | Fimbristylis kadzusana Ohwi | |
| イトイバラモ | イトイバラモ | Najas yezoensis Miyabe | |
| イトスナヅル | イトスナヅル | Cassytha pergracilis (Hatus.) Hatus. | |
| イトマキイタヤ | イトマキイタヤ | Acer pictum Thunb. subsp. savatieri (Pax) H.Ohashi | |
| イトラッキョウ | イトラッキョウ | Allium virgunculae F.Maek. et Kitam. var. virgunculae | |
| イナカギク | イナカギク | Aster semiamplexicaulis (Makino) Makino ex Koidz. | |
| イナコゴメグサ | イナコゴメグサ | Euphrasia multifolia Wettst. var. inaensis Hid.Takah. | |
| イナコスズ | イナコスズ | Neosasamorpha tsukubensis (Nakai) Sad.Suzuki subsp. pubifolia (Koidz.) Sad.Suzuki | |
| イナサツキヒナノウスツボ | イナサツキヒナノウスツボ | Scrophularia musashiensis Bonati var. ina-vallicola Hid.Takah. | |
| イナデンダ | イナデンダ | Polystichum inaense (Tagawa) Tagawa | |
| イナトウヒレン | イナトウヒレン | Saussurea inaensis Kitam. | |
| イナヒロハテンナンショウ | イナヒロハテンナンショウ | Arisaema inaense (Seriz.) Seriz. ex K.Sasam. et J.Murata | |
| イナベアザミ | イナベアザミ | Cirsium magofukui Kitam. | |
| イナモリソウ | イナモリソウ | Pseudopyxis depressa Miq. | |
| イヌクテガワザサ | イヌクテガワザサ | Sasa heterotricha Koidz. var. nagatoensis Sad.Suzuki | |
| イヌトウキ | イヌトウキ | Angelica shikokiana Makino ex Y.Yabe | |
| イヌドウナ | イヌドウナ | Parasenecio tanakae (Franch. et Sav.) Kadota | |
| イヌトクガワザサ | イヌトクガワザサ | Sasa scytophylla Koidz. | |
| イヌブナ | イヌブナ | Fagus japonica Maxim. | |
| イヌヤマハッカ | イヌヤマハッカ | Rabdosia umbrosa (Maxim.) H.Hara var. umbrosa | |
| イノデモドキ | イノデモドキ | Polystichum tagawanum Sa.Kurata | |
| イブキクガイソウ | イブキクガイソウ | Veronicastrum japonicum (Nakai) T.Yamaz. var. humile (Nakai) T.Yamaz. | |
| イブキコゴメグサ | イブキコゴメグサ | Euphrasia insignis Wettst. subsp. iinumae (Takeda) T.Yamaz. var. iinumae | |
| イブキザサ | イブキザサ | Sasa tsuboiana Makino | |
| イブキシモツケ | イブキシモツケ | Spiraea nervosa Franch. et Sav. | |
| イブキゼリモドキ | イブキゼリモドキ | Tilingia holopetala (Maxim.) Kitag. | |
| イブキタイゲキ | イブキタイゲキ | Euphorbia lasiocaula Boiss. var. ibukiensis (Hurus.) T.Kuros. et H.Ohashi | |
| イブキトボシガラ | イブキトボシガラ | Festuca parvigluma Steud. var. breviaristata Ohwi | |
| イブキトリカブト | イブキトリカブト | Aconitum japonicum Thunb. subsp. ibukiense (Nakai) Kadota | |
| イブキルリトラノオ | イブキルリトラノオ | Pseudolysimachion subsessile (Miq.) Holub var. ibukiense T.Yamaz. | |
| イブリザサ | イブリザサ | Neosasamorpha pubiculmis (Makino) Sad.Suzuki subsp. pubiculmis var. chitosensis (Nakai) Sad.Suzauki | |
| イブリハナワラビ | イブリハナワラビ | Botrychium microphyllum (Sahashi) K.Iwats. | シダ植物 |
| イボタヒョウタンボク | イボタヒョウタンボク | Lonicera demissa Rehder var. demissa | |
| イヤリトリカブト | イヤリトリカブト | Aconitum japonicum Thunb. subsp. maritimum (Tamura et Namba) Kadota var. iyariense Kadota | |
| イヨアブラギク | イヨアブラギク | Chrysanthemum indicum L. var. iyoense Kitam. | |
| イヨノミツバイワガサ | イヨノミツバイワガサ | Spiraea blumei G.Don var. pubescens (Koidz.) Ohwi | |
| イヨホトトギス | イヨホトトギス | Tricyrtis macropoda Miq. var. nomurae Hir.Takah. | |
| イラモミ | イラモミ | Picea bicolor (Maxim.) Mayr | |
| イリオモテアザミ | イリオモテアザミ | Cirsium irumtiense Kitam. | |
| イリオモテガヤ | イリオモテガヤ | Chikusichloa brachyanthera Ohwi | |
| イリオモテシロコナモジゴケ | イリオモテシロコナモジゴケ | Carbacanthographis iriomotensis (M.Nakan.) M.Nakan. & Kashiw. | 地衣類 |
| イリオモテシロコナモジゴケ | イリオモテシロコナモジゴケ | Catillaria afferens (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イリオモテシロコナモジゴケ | イリオモテシロコナモジゴケ | Catillaria circumpallescens (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イリオモテシロコナモジゴケ | イリオモテシロコナモジゴケ | Catillaria efferens (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イリオモテシロコナモジゴケ | イリオモテシロコナモジゴケ | Catillaria eupodia (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イリオモテシロコナモジゴケ | イリオモテシロコナモジゴケ | Catillaria inopinula (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イリオモテシロコナモジゴケ | イリオモテシロコナモジゴケ | Catillaria melanocarpa Zahlbr. | 地衣類 |
| イリオモテシロコナモジゴケ | イリオモテシロコナモジゴケ | Catillaria peltiformis (M?ll.Arg.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イリオモテシロコナモジゴケ | イリオモテシロコナモジゴケ | Catillaria proferens (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イリオモテシロコナモジゴケ | イリオモテシロコナモジゴケ | Catillaria rudiuscula (M?ll.Arg.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イリオモテシロコナモジゴケ | イリオモテシロコナモジゴケ | Catillaria simodensis (Tuck.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イリオモテシロコナモジゴケ | イリオモテシロコナモジゴケ | Catillaria subprivigna (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| イリオモテシロコナモジゴケ | イリオモテシロコナモジゴケ | Catillaria yeso?nsis Zahlbr. | 地衣類 |
| イリオモテシロコナモジゴケ | イリオモテシロコナモジゴケ | Chapsa boninensis (Tat.Matsumoto) Rivas Plata & Mangold | 地衣類 |
| イリオモテシロコナモジゴケ | イリオモテシロコナモジゴケ | Chapsa grossomarginata (Tat.Matsumoto) Mangold | 地衣類 |
| イリオモテトンボソウ | イリオモテトンボソウ | Platanthera stenoglossa Hayata subsp. iriomotensis (Masam.) K.Inoue | |
| イリオモテハイノキ | イリオモテハイノキ | Symplocos liukiuensis Matsum. var. iriomotensis Nagam. | |
| イリオモテムラサキ | イリオモテムラサキ | Callicarpa oshimensis Hayata var. iriomotensis (Masam.) Hatus. | |
| イワイチョウ | イワイチョウ | Fauria crista-galli (Menzies ex Hook.) Makino subsp. japonica (Franch.) J.M.Gillet | |
| イワイヌワラビ | イワイヌワラビ | Athyrium nikkoense Makino | シダ植物 |
| イワインチン | イワインチン | Chrysanthemum rupestre Matsum. et Koidz. | |
| イワウチワ | イワウチワ | Shortia uniflora (Maxim.) Maxim. var. kantoensis T.Yamaz. | |
| イワウラジロ | イワウラジロ | Cheilanthes krameri Franch. et Sav. | |
| イワオトギリ | イワオトギリ | Hypericum senanense Maxim. subsp. mutiloides (R.Keller) N.Robson | |
| イワカガミ | イワカガミ | Schizocodon soldanelloides Siebold et Zucc. var. soldanelloides | |
| イワカクレホウネンゴケ | イワカクレホウネンゴケ | Sarcogyne endopetrophila Tokiz. & Y.Ohmura | 地衣類 |
| イワカラマツ | イワカラマツ | Thalictrum minus L. var. sekimotoanum (Honda) Kitam. | |
| イワカンスゲ | イワカンスゲ | Carex makinoensis Franch. | |
| イワキヒメアザミ | イワキヒメアザミ | Cirsium yuzawae Kadota | |
| イワギボウシ | イワギボウシ | Hosta longipes (Franch. et Sav.) Matsum. var. longipes | |
| イワギリソウ | イワギリソウ | Opithandra primuloides (Miq.) B.L.Burtt | |
| イワザクラ | イワザクラ | Primula tosaensis Yatabe var. tosaensis | |
| イワザンショウ | イワザンショウ | Zanthoxylum beecheyanum K.Koch | |
| イワシモツケ | イワシモツケ | Spiraea nipponica Maxim. var. nipponica | |
| イワシャジン | イワシャジン | Adenophora takedae Makino var. takedae | |
| イワショウブ | イワショウブ | Tofieldia japonica Miq. | |
| イワスゲ | イワスゲ | Carex stenantha Franch. et Sav. var. stenantha | |
| イワタカンアオイ | イワタカンアオイ | Asarum kurosawae Sugim. | |
| イワタケソウ | イワタケソウ | Hystrix japonica (Hack.) Ohwi | |
| イワタケモドキ | イワタケモドキ | Umbilicaria koidzumii Yasuda ex M.Sat? | 地衣類 |
| イワチドリ | イワチドリ | Amitostigma keiskei (Maxim. ex Franch. et Sav.) Schltr. | |
| イワツキハマイボゴケ | イワツキハマイボゴケ | Verrucaria iwatsukii H.Harada | 地衣類 |
| イワツクバネウツギ | イワツクバネウツギ | Abelia integrifolia Koidz. | |
| イワツメクサ | イワツメクサ | Stellaria nipponica Ohwi var. nipponica | |
| イワテザサ | イワテザサ | Sasa yahikoensis Makino var. rotundissima (Makino et Uchida) Sad.Suzuki | |
| イワテシオガマ | イワテシオガマ | Pedicularis iwatensis Ohwi | |
| イワテシコロゴケ | イワテシコロゴケ | Parmeliella alniphila P.M.J?rg. | 地衣類 |
| イワテヒゴタイ | イワテヒゴタイ | Saussurea brachycephala Franch. | |
| イワナシ | イワナシ | Epigaea asiatica Maxim. | |
| イワナンテン | イワナンテン | Leucothoe keiskei Miq. | |
| イワニンジン | イワニンジン | Angelica hakonensis Maxim. var. hakonensis | |
| イワネコノメソウ | イワネコノメソウ | Chrysosplenium echinus Maxim. | |
| イワホウライシダ | イワホウライシダ | Adiantum ogasawarense Tagawa | シダ植物 |
| イワボタン | イワボタン | Chrysosplenium macrostemon Maxim. var. macrostemon | |
| イワホトトギス | イワホトトギス | Tricyrtis hirta (Thunb.) Hook. var. saxicola Honda | |
| イワマンジュウゴケ | イワマンジュウゴケ | Strigula nipponica H.Harada | 地衣類 |
| イワヤスゲ | イワヤスゲ | Carex tumidula Ohwi | |
| イワユキノシタ | イワユキノシタ | Tanakaea radicans Franch. et Sav. | |
| イワレンゲ | イワレンゲ | Orostachys malacophylla (Pall.) Fisch. subsp. malacophylla var. iwarenge (Makino) H.Ohba | |
| インヨウチク | インヨウチク | Hibanobambusa transquillans (Koidz.) Maruy. et H.Okamura | |
| ウエツアザミ | ウエツアザミ | Cirsium uetsuense Kitam. | |
| ウキガヤ | ウキガヤ | Glyceria depauperata Ohwi var. infirma (Ohwi) Ohwi | |
| ウグイスカグラ | ウグイスカグラ | Lonicera gracilipes Miq. var. glabra Miq. | |
| ウケユリ | ウケユリ | Lilium alexandrae Hort. ex Wallace | |
| ウゴアザミ | ウゴアザミ | Cirsium ugoense Nakai | |
| ウゴツクバネウツギ | ウゴツクバネウツギ | Abelia spathulata Siebold et Zucc. var. stenophylla Honda | |
| ウゴノシロミモジゴケ | ウゴノシロミモジゴケ | Graphis fulvescens M.Nakan. et al. | 地衣類 |
| ウスイハナワラビ | ウスイハナワラビ | Botrychium nipponicum Makino var. minus (H.Hara) K.Iwats. | |
| ウスイロオクノカンスゲ | ウスイロオクノカンスゲ | Carex foliosissima F.Schmidt var. pallidivaginata J.Oda et Nagam. | |
| ウスイロマツゲゴケ | ウスイロマツゲゴケ | Parmotrema subpallescens (Kurok.) Kurok. | 地衣類 |
| ウスカワゴロモ | ウスカワゴロモ | Hydrobryum floribundum Koidz. | |
| ウスギオウレン | ウスギオウレン | Coptis lutescens Tamura | |
| ウスキクダチイ | ウスキクダチイ | Menegazzia squamatica K.H.Moon et al. | 地衣類 |
| ウスゲアキメヒシバ | ウスゲアキメヒシバ | Digitaria violascens Link var. intersita (Ohwi) Ohwi | |
| ウスゲクロモジ | ウスゲクロモジ | Lindera sericea (Siebold et Zucc.) Blume var. glabrata Blume | |
| ウスゲサンカクヅル | ウスゲサンカクヅル | Vitis flexuosa Thunb. var. tsukubana Makino | |
| ウスゲタマブキ | ウスゲタマブキ | Parasenecio farfarifolius (Siebold et Zucc.) H.Koyama var. farfarifolius | |
| ウスノキ | ウスノキ | Vaccinium hirtum Thunb. var. hirtum | |
| ウスバアザミ | ウスバアザミ | Cirsium tenue Kitam. | |
| ウスバエビラゴケ | ウスバエビラゴケ | Lobaria discolor var. inactiva (Asahina) Yoshim. var. inactiva (Asahina) Yoshim. | 地衣類 |
| ウスバシコロゴケ | ウスバシコロゴケ | Lepidocollema adpressum (P.M.J?rg.) P.M.J?rg. | 地衣類 |
| ウスバシコロゴケ | ウスバシコロゴケ | Lepidostroma asianum Yanaga & N.Maek. | 地衣類 |
| ウスバヒョウタンボク | ウスバヒョウタンボク | Lonicera cerasina Maxim. | |
| ウスバミヤマノコギリシダ | ウスバミヤマノコギリシダ | Diplazium deciduum N.Ohta et M.Takamiya | シダ植物 |
| ウスユキトウヒレン | ウスユキトウヒレン | Saussurea yanagisawae Takeda | |
| ウスユキムグラ | ウスユキムグラ | Asperula trifida Makino | |
| ウゼンアザミ | ウゼンアザミ | Cirsium uzenense Kadota | |
| ウゼントリカブト | ウゼントリカブト | Aconitum okuyamae Nakai var. okuyamae | |
| ウゼンヒメアザミ | ウゼンヒメアザミ | Cirsium katoanum Kadota | |
| ウダイカンバ | ウダイカンバ | Betula maximowicziana Regel | |
| ウチキトリハダゴケ | ウチキトリハダゴケ | Pertusaria kashiwadanii Shibuichi | 地衣類 |
| ウチキトリハダゴケ | ウチキトリハダゴケ | Pertusaria leucosora var. violacens (R?s?nen) Oshio var. violacens (R?s?nen) Oshio | 地衣類 |
| ウチキトリハダゴケ | ウチキトリハダゴケ | Pertusaria mendax M?ll.Arg. | 地衣類 |
| ウチキモジゴケ | ウチキモジゴケ | Fissurina flavicans (Kashiw.) M.Nakan. & Kashiw. | 地衣類 |
| ウチダシクロキ | ウチダシクロキ | Symplocos kawakamii Hayata | |
| ウチワダイモンジソウ | ウチワダイモンジソウ | Saxifraga fortunei Hook.f. var. obtusocuneata (Makino) Nakai | |
| ウツギ | ウツギ | Deutzia crenata Siebold et Zucc. var. crenata | |
| ウツクシザサ | ウツクシザサ | Sasa pulcherrima Koidz. | |
| ウバタケギボウシ | ウバタケギボウシ | Hosta pulchella N.Fujita | |
| ウバタケニンジン | ウバタケニンジン | Angelica ubatakensis (Makino) Kitag. var. ubatakensis | |
| ウミノサチスゲ | ウミノサチスゲ | Carex augustini Tuyama | |
| ウメウツギ | ウメウツギ | Deutzia uniflora Shirai | |
| ウメガシマテンナンショウ | ウメガシマテンナンショウ | Arisaema maekawae S.Kakish. et J.Murata | |
| ウメヅハマキクバゴケ | ウメヅハマキクバゴケ | Karoowia umezuana K.H.Moon & Kashiw. | 地衣類 |
| ウモレチャシブゴケ | ウモレチャシブゴケ | Lecanora subgangaliza Nyl. | 地衣類 |
| ウモレチャシブゴケ | ウモレチャシブゴケ | Lecanora tunicata Zahlbr. | 地衣類 |
| ウラゲウコギ | ウラゲウコギ | Eleutherococcus spinosus (L.f.) S.Y.Hu var. nikaianus (Koidz. ex Nakai) H.Ohba | |
| ウラゲスズダケ | ウラゲスズダケ | Sasamorpha borealis (Hack.) Nakai var. pilosa (Uchida) Sad.Suzuki | |
| ウラシマソウ | ウラシマソウ | Arisaema thunbergii Blume subsp. urashima (H.Hara) H.Ohashi et J.Murata | |
| ウラジロイタヤ | ウラジロイタヤ | Acer pictum Thunb. subsp. glaucum (Koidz.) H.Ohashi | |
| ウラジロイワガサ | ウラジロイワガサ | Spiraea blumei G.Don var. hayatae (Koidz.) Ohwi | |
| ウラジロウコギ | ウラジロウコギ | Eleutherococcus hypoleucus (Makino) Nakai | |
| ウラジロウツギ | ウラジロウツギ | Deutzia maximowicziana Makino | |
| ウラジロカガノアザミ | ウラジロカガノアザミ | Cirsium furusei Kitam. | |
| ウラジロギボウシ | ウラジロギボウシ | Hosta hypoleuca Murata | |
| ウラジロコムラサキ | ウラジロコムラサキ | Callicarpa parvifolia Hook. et Arn. | |
| ウラジロシモツケ | ウラジロシモツケ | Spiraea japonica L.f. var. hypoglauca (Koidz.) Kitam. | |
| ウラジロナナカマド | ウラジロナナカマド | Sorbus matsumurana (Makino) Koehne | |
| ウラジロノキ | ウラジロノキ | Aria japonica Decne. | |
| ウラジロヒカゲツツジ | ウラジロヒカゲツツジ | Rhododendron keiskei Miq. var. hypoglaucum Sutô et T.Suzuki | |
| ウラジロミツバツツジ | ウラジロミツバツツジ | Rhododendron osuzuyamense T.Yamaz. | |
| ウラジロモミ | ウラジロモミ | Abies homolepis Siebold et Zucc. | |
| ウラジロヨウラク | ウラジロヨウラク | Menziesia multiflora Maxim. var. multiflora | |
| ウラハグサ | ウラハグサ | Hakonechloa macra (Munro ex S.Moore) Makino ex Honda | |
| ウリカエデ | ウリカエデ | Acer crataegifolium Siebold et Zucc. | |
| ウリハダカエデ | ウリハダカエデ | Acer rufinerve Siebold et Zucc. | |
| ウリュウトウヒレン | ウリュウトウヒレン | Saussurea kudoana Tatew. et Kitam. var. uryuensis Kadota | |
| ウワジマテンナンショウ | ウワジマテンナンショウ | Arisaema undulatifolium Nakai subsp. uwajimense T.Kobay. et J.Murata | |
| ウワミズザクラ | ウワミズザクラ | Padus grayana (Maxim.) C.K.Schneid. | |
| ウンゼンアザミ | ウンゼンアザミ | Cirsium unzenense Kadota et Masami Saito | |
| ウンゼンカンアオイ | ウンゼンカンアオイ | Asarum unzen (F.Maek.) Kitam. et Murata | |
| ウンゼンザサ | ウンゼンザサ | Sasa gracillima Nakai | |
| ウンゼンツツジ | ウンゼンツツジ | Rhododendron serpyllifolium (A.Gray) Miq. var. serpyllifolium | |
| ウンゼンマムシグサ | ウンゼンマムシグサ | Arisaema unzenense Seriz. | |
| エイザンスミレ | エイザンスミレ | Viola eizanensis (Makino) Makino | |
| エキサイゼリ | エキサイゼリ | Apodicarpum ikenoi Makino | |
| エクボサイシン | エクボサイシン | Asarum gelasinum Hatus. | |
| エゾアジサイ | エゾアジサイ | Hydrangea serrata (Thunb.) Ser. var. yesoensis (Koidz.) H.Ohba | |
| エゾイヌノヒゲ | エゾイヌノヒゲ | Eriocaulon perplexum Satake et H.Hara | |
| エゾイワツメクサ | エゾイワツメクサ | Stellaria pterosperma Ohwi | |
| エゾオオケマン | エゾオオケマン | Corydalis curvicalcarata Miyabe et Kudô | |
| エゾオヤマノエンドウ | エゾオヤマノエンドウ | Oxytropis japonica Maxim. var. sericea Koidz. | |
| エゾキスミレ | エゾキスミレ | Viola brevistipulata (Franch. et Sav.) W.Becker var. hidakana (Nakai) S.Watan. | |
| エゾコウゾリナ | エゾコウゾリナ | Hypochaeris crepidioides (Miyabe et Kudô) Tatew. et Kitam. | |
| エゾコウボウ | エゾコウボウ | Hierochloe pluriflora Koidz. var. pluriflora | |
| エゾコゴメグサ | エゾコゴメグサ | Euphrasia maximowiczii Wettst. var. yezoensis (H.Hara) H.Hara ex T.Yamaz. | |
| エゾサイコ | エゾサイコ | Bupleurum nipponicum Koso-Pol. var. yesoense (Nakai ex H.Hara) H.Hara | |
| エゾシオガマ | エゾシオガマ | Pedicularis yezoensis Maxim. var. yezoensis | |
| エゾタカネセンブリ | エゾタカネセンブリ | Swertia tetrapetala Pall. subsp. tetrapetala var. yezoalpina (H.Hara) H.Hara | |
| エゾタカネニガナ | エゾタカネニガナ | Crepis gymnopus Koidz. | |
| エゾトウヒレン | エゾトウヒレン | Saussurea yezoensis Franch. | |
| エゾトリカブト | エゾトリカブト | Aconitum sachalinense F.Schmidt subsp. yezoense (Nakai) Kadota | |
| エゾノクモマグサ | エゾノクモマグサ | Saxifraga nishidae Miyabe et Kudô | |
| エゾノクロウメモドキ | エゾノクロウメモドキ | Rhamnus japonica Maxim. var. japonica | |
| エゾノサワアザミ | エゾノサワアザミ | Cirsium pectinellum A.Gray | |
| エゾノシジミバナ | エゾノシジミバナ | Spiraea faurieana C.K.Schneid. | |
| エゾノダッタンコゴメグサ | エゾノダッタンコゴメグサ | Euphrasia pectinata Ten. var. obtusiserrata (T.Yamaz.) T.Yamaz. | |
| エゾノチャルメルソウ | エゾノチャルメルソウ | Mitella integripetala H.Boissieu | |
| エゾノトウウチソウ | エゾノトウウチソウ | Sanguisorba japonensis (Makino) Kudô | |
| エゾノホソバトリカブト | エゾノホソバトリカブト | Aconitum yuparense Takeda var. yuparense | |
| エゾノミドリサネゴケ | エゾノミドリサネゴケ | Staurothele japonica de Lesd. | 地衣類 |
| エゾノミドリサネゴケ | エゾノミドリサネゴケ | Stereocaulon canescens Kashiw. | 地衣類 |
| エゾノミヤマエンレイソウ | エゾノミヤマエンレイソウ | Trillium tschonoskii Maxim. var. atrorubens Miyabe et Tatew. | |
| エゾハナシノブ | エゾハナシノブ | Polemonium caeruleum L. subsp. yezoense (Miyabe et Kudô) H.Hara var. yezoense | |
| エゾハハコヨモギ | エゾハハコヨモギ | Artemisia trifurcata Stephan ex Spreng. var. pedunculosa (Koidz.) Kitam. | |
| エゾハマチャシブゴケ | エゾハマチャシブゴケ | Lecanora verrucifera Hue | 地衣類 |
| エゾハマチャシブゴケ | エゾハマチャシブゴケ | Lecidea furfuracella Nyl. | 地衣類 |
| エゾハマチャシブゴケ | エゾハマチャシブゴケ | Lecidea homoeochroa Nyl. | 地衣類 |
| エゾハマチャシブゴケ | エゾハマチャシブゴケ | Lecidea inexpectata M?ll.Arg. | 地衣類 |
| エゾハマチャシブゴケ | エゾハマチャシブゴケ | Lecidea praespersa Nyl. | 地衣類 |
| エゾハマチャシブゴケ | エゾハマチャシブゴケ | Lecidea subleucothallina Mas.Inoue | 地衣類 |
| エゾハマチャシブゴケ | エゾハマチャシブゴケ | Lecidea subpaupercula Mas.Inoue | 地衣類 |
| エゾヒメアマナ | エゾヒメアマナ | Gagea vaginata Pascher | |
| エゾフウロ | エゾフウロ | Geranium yesoense Franch. et Sav. var. yesoense | |
| エゾフクロゴケ | エゾフクロゴケ | Hypogymnia hokkaidensis Kurok. | 地衣類 |
| エゾホシクサ | エゾホシクサ | Eriocaulon monococcon Nakai | |
| エゾマツムシソウ | エゾマツムシソウ | Scabiosa japonica Miq. var. acutiloba H.Hara | |
| エゾママコナ | エゾママコナ | Melampyrum yezoense T.Yamaz. | |
| エゾマミヤアザミ | エゾマミヤアザミ | Cirsium pectinellum A.Gray var. fallax Nakai | |
| エゾミヤマクワガタ | エゾミヤマクワガタ | Pseudolysimachion schmidtianum (Regel) T.Yamaz. subsp. yezoalpinum (Koidz. ex H. Hara) Kitam. et Murata | |
| エゾミヤマツメクサ | エゾミヤマツメクサ | Arenaria macrocarpa Pursh var. yezoalpina (H.Hara) H.Hara | |
| エゾヤマアザミ | エゾヤマアザミ | Cirsium albrechtii (Kudo) Kadota, nom. prov. | |
| エゾヤマオトギリ | エゾヤマオトギリ | Hypericum kurodakeanum N.Robson | |
| エゾヤマコウボウ | エゾヤマコウボウ | Hierochloe pluriflora Koidz. var. intermedia (Hack.) Ohwi | |
| エゾヤマゼンコ | エゾヤマゼンコ | Coelopleurum multisectum (Maxim.) Kitag. var. trichocarpum (H.Hara) H.Ohba | |
| エゾユズリハ | エゾユズリハ | Daphniphyllum macropodum Miq. var. humile (Maxim. ex Franch. et Sav.) K.Rosenthal | |
| エゾルリソウ | エゾルリソウ | Mertensia pterocarpa (Turcz.) Tatew. et Ohwi var. yezoensis Tatew. et Ohwi | |
| エゾルリトラノオ | エゾルリトラノオ | Pseudolysimachion ovatum (Nakai) T.Yamaz. subsp. miyabei (Nakai et Honda) T.Yamaz. var. miyabei | |
| エゾレイジンソウ | エゾレイジンソウ | Aconitum gigas H.Lév. et Vaniot | |
| エゾワクノテ | エゾワクノテ | Clematis sibiricoides Nakai | |
| エダウチタニギキョウ | エダウチタニギキョウ | Peracarpa carnosa (Wall.) Hook.f. et Thomson var. kiusiana H.Hara | |
| エダウチフクジュソウ | エダウチフクジュソウ | Adonis ramosa Franch. | |
| エダウチヘゴ | エダウチヘゴ | Cyathea tuyamae H.Ohba | |
| エチゴキゴケ | エチゴキゴケ | Stereocaulon etigo?nse (Asahina) I.M.Lamb | 地衣類 |
| エチゴツルキジムシロ | エチゴツルキジムシロ | Potentilla toyamensis Naruh. et T.Sato | |
| エチゴトラノオ | エチゴトラノオ | Pseudolysimachion ovatum (Nakai) T.Yamaz. subsp. maritimum (Nakai) T.Yamaz. | |
| エチゴボダイジュ | エチゴボダイジュ | Tilia mandshurica Rupr. et Maxim. var. toriiana T.Yamaz. | |
| エチゴメダケ | エチゴメダケ | Pleioblastus pseudosasaoides Sad.Suzuki | |
| エチゴルリソウ | エチゴルリソウ | Omphalodes laevisperma Nakai | |
| エチゼンオニアザミ | エチゼンオニアザミ | Cirsium occidentalinipponense Kadota | |
| エチゼンダイモンジソウ | エチゼンダイモンジソウ | Saxifraga acerifolia Wakab. et Satomi | |
| エチゼンネザサ | エチゼンネザサ | Pleioblastus nagashima (Mitford) Nakai var. koidzumii (Makino ex Koidz.) Sad.Suzuki | |
| エチゼンヒメアザミ | エチゼンヒメアザミ | Cirsium wakasugianum Kadota | |
| エッサシノ | エッサシノ | Sasaella shiobarensis (Nakai) Nakai ex Koidz. var. yessaensis (Koidz.) Sad.Suzuki | |
| エッチュウミセバヤ | エッチュウミセバヤ | Hylotelephium sieboldii (Sweet ex Hook.) H.Ohba var. ettyuense (Tomida) H.Ohba | |
| エビノオオクジャク | エビノオオクジャク | Dryopteris ebinoensis Sa.Kurata, nom. nud. | |
| エヒメテンナンショウ | エヒメテンナンショウ | Arisaema ehimense J.Murata et J.Ohno | |
| エンシュウツリフネソウ | エンシュウツリフネソウ | Impatiens hypophylla Makino var. microhypophylla (Nakai) H.Hara | |
| エンシュウハグマ | エンシュウハグマ | Ainsliaea dissecta Franch. et Sav. | |
| エンシュウムヨウラン | エンシュウムヨウラン | Lecanorchis kiusiana Tuyama var. suginoana (Tuyama) T.Hashim. | |
| オイランアザミ | オイランアザミ | Cirsium spinosum Kitam. | |
| オウギカズラ | オウギカズラ | Ajuga japonica Miq. | |
| オオアカウキクサ | オオアカウキクサ | Azolla japonica (Franch. et Sav.) Franch. et Sav. ex Nakai | シダ植物 |
| オオアマミテンナンショウ | オオアマミテンナンショウ | Arisaema heterocephalum Koidz. subsp. majus (Seriz.) J.Murata | |
| オオイカリソウ | オオイカリソウ | Epimedium sempervirens Nakai ex F.Maek. var. rugosum (Nakai) K.Suzuki | |
| オオイタヤメイゲツ | オオイタヤメイゲツ | Acer shirasawanum Koidz. | |
| オオイヌノハナヒゲ | オオイヌノハナヒゲ | Rhynchospora fauriei Franch. | |
| オオイワウチワ | オオイワウチワ | Shortia uniflora (Maxim.) Maxim. var. uniflora | |
| オオイワカガミ | オオイワカガミ | Schizocodon soldanelloides Siebold et Zucc. var. magnus (Makino) H.Hara | |
| オオイワツメクサ | オオイワツメクサ | Stellaria nipponica Ohwi var. yezoensis H.Hara | |
| オオウバタケニンジン | オオウバタケニンジン | Angelica ubatakensis (Makino) Kitag. var. valida Kitag. | |
| オオウマノアシガタ | オオウマノアシガタ | Ranunculus grandis Honda var. grandis | |
| オオウラジロノキ | オオウラジロノキ | Malus tschonoskii (Maxim.) C.K.Schneid. | |
| オオカニコウモリ | オオカニコウモリ | Parasenecio nikomontanus (Matsum.) H.Koyama | |
| オオカモメヅル | オオカモメヅル | Tylophora aristolochioides Miq. | |
| オオキツネヤナギ | オオキツネヤナギ | Salix futura Seemen | |
| オオキバナムカシヨモギ | オオキバナムカシヨモギ | Blumea conspicua Hayata | |
| オオギョウギシバ | オオギョウギシバ | Cynodon dactylon (L.) Pers. var. nipponicus Ohwi | |
| オオキンレイカ | オオキンレイカ | Patrinia takeuchiana Makino | |
| オオクサボタン | オオクサボタン | Clematis speciosa (Makino) Makino | |
| オオゴカヨウオウレン | オオゴカヨウオウレン | Coptis ramosa (Makino) Tamura | |
| オオコマユミ | オオコマユミ | Euonymus alatus (Thunb.) Siebold var. rotundatus (Makino) H.Hara | |
| オオコメツツジ | オオコメツツジ | Rhododendron tschonoskii Maxim. var. trinerve (Franch. ex H.Boissieu) Makino | |
| オオサクラソウ | オオサクラソウ | Primula jesoana Miq. var. jesoana | |
| オオサビイボゴケ | オオサビイボゴケ | Brigantiaea nipponica (M.Sat?) Hafellner | 地衣類 |
| オオサワトリカブト | オオサワトリカブト | Aconitum senanense Nakai subsp. senanense var. isidzukae (Nakai) Kadota | |
| オオシケシダ | オオシケシダ | Deparia bonincola (Nakai) M.Kato | シダ植物 |
| オオシダザサ | オオシダザサ | Neosasamorpha oshidensis (Makino et Uchida) Tatew. subsp. oshidensis | |
| オオシナノオトギリ | オオシナノオトギリ | Hypericum ovalifolium Koidz. var. ovalifolium | |
| オオシマウツギ | オオシマウツギ | Deutzia naseana Nakai var. naseana | |
| オオシマガマズミ | オオシマガマズミ | Viburnum tashiroi Nakai | |
| オオシマカンスゲ | オオシマカンスゲ | Carex oshimensis Nakai | |
| オオシマガンピ | オオシマガンピ | Diplomorpha phymatoglossa (Koidz.) Nakai | |
| オオシマザクラ | オオシマザクラ | Cerasus speciosa (Koidz.) H.Ohba | |
| オオシマツツジ | オオシマツツジ | Rhododendron kaempferi Planch. var. macrogemma Nakai | |
| オオシマノジギク | オオシマノジギク | Chrysanthemum crassum (Kitam.) Kitam. | |
| オオシマムラサキ | オオシマムラサキ | Callicarpa oshimensis Hayata var. oshimensis | |
| オオシラタマカズラ | オオシラタマカズラ | Psychotria boninensis Nakai | |
| オオシラヒゲソウ | オオシラヒゲソウ | Parnassia foliosa Hook.f. et Thomson var. japonica (Nakai) Ohwi | |
| オオシラビソ | オオシラビソ | Abies mariesii Mast. | |
| オオシロショウジョウバカマ | オオシロショウジョウバカマ | Heloniopsis leucantha (Koidz.) Honda | |
| オオスミコザラゴケ | オオスミコザラゴケ | Gyalidea oosumiensis H.Harada & A.Sakata | 地衣類 |
| オオスミミツバツツジ | オオスミミツバツツジ | Rhododendron mayebarae Nakai et H.Hara var. ohsumiense T.Yamaz. | |
| オオスミモジゴケ | オオスミモジゴケ | Graphis plumbeidisca M.Nakan. et al. | 地衣類 |
| オオスミモジゴケ | オオスミモジゴケ | Graphis subdura M.Nakan. | 地衣類 |
| オオソナレムグラ | オオソナレムグラ | Hedyotis strigulosa (Bartl. ex DC.) Fosberg var. luxurians (Hatus.) T.Yamaz. | |
| オオダイトウヒレン | オオダイトウヒレン | Saussurea nipponica Miq. | |
| オオタマツリスゲ | オオタマツリスゲ | Carex rouyana Franch. | |
| オオチゴザサ | オオチゴザサ | Isachne subglobosa Hatus. et T.Koyama | |
| オオチチッパベンケイ | オオチチッパベンケイ | Hylotelephium sordidum (Maxim.) H.Ohba var. oishii (Ohwi) H.Ohba et M.Amano | |
| オオチャルメルソウ | オオチャルメルソウ | Mitella japonica Maxim. | |
| オオツクバネウツギ | オオツクバネウツギ | Abelia tetrasepala (Koidz.) H.Hara et S.Kuros. | |
| オオトウヒレン | オオトウヒレン | Saussurea sikokiana Makino | |
| オオトキワイヌビワ | オオトキワイヌビワ | Ficus nishimurae Koidz. | |
| オオナルコユリ | オオナルコユリ | Polygonatum macranthum (Maxim.) Koidz. | |
| オオニワトコ | オオニワトコ | Sambucus racemosa L. subsp. sieboldiana (Miq.) H.Hara var. major (Nakai) Murata | |
| オオバアズマザサ | オオバアズマザサ | Sasaella ramosa (Makino) Makino var. latifolia (Nakai) Sad.Suzuki | |
| オオバイケイソウ | オオバイケイソウ | Veratrum oxysepalum Turcz. var. maximum (Nakai) Hir.Tahah. | |
| オオバウマノスズクサ | オオバウマノスズクサ | Aristolochia kaempferi Willd. var. kaempferi | |
| オオバオトギリ | オオバオトギリ | Hypericum pibairense (Miyabe et Y.Kimura) N.Robson | |
| オオバカンアオイ | オオバカンアオイ | Asarum lutchuense T.Itô | |
| オオバキスミレ | オオバキスミレ | Viola brevistipulata (Franch. et Sav.) W.Becker var. brevistipulata | |
| オオバキセガワノリ（オオバキノリ） | オオバキセガワノリ（オオバキノリ） | Thyrea latissima Asahina | 地衣類 |
| オオバキハダ | オオバキハダ | Phellodendron amurense Rupr. var. japonicum (Maxim.) Ohwi | |
| オオバギボウシ | オオバギボウシ | Hosta sieboldiana (Lodd.) Engl. var. sieboldiana | |
| オオハクウンラン | オオハクウンラン | Kuhlhasseltia fissa (F.Maek.) T.Yukawa, comb. ined. | |
| オオハクサンサイコ | オオハクサンサイコ | Bupleurum longiradiatum Turcz. var. pseudonipponicum Kitag. | |
| オオバクロモジ | オオバクロモジ | Lindera umbellata Thunb. var. membranacea (Maxim.) Momiy. ex H.Hara et M.Mizush. | |
| オオバコウモリ | オオバコウモリ | Parasenecio hastatus (L.) H.Koyama subsp. orientalis (Kitam.) H.Koyama var. ramosus (Maxim.) H.Koyama | |
| オオハシカグサ | オオハシカグサ | Neanotis hirsuta (L.f.) W.H.Lewis var. glabra (Honda) H.Hara | |
| オオバシマムラサキ | オオバシマムラサキ | Callicarpa subpubescens Hook. et Arn. | |
| オオバジャノヒゲ | オオバジャノヒゲ | Ophiopogon planiscapus Nakai | |
| オオバシロテツ | オオバシロテツ | Boninia grisea Planch. var. grisea | |
| オオバツツジ | オオバツツジ | Rhododendron nipponicum Matsum. | |
| オオバナオオヤマサギソウ | オオバナオオヤマサギソウ | Platanthera hondoensis (Ohwi) K.Inoue | |
| オオバボダイジュ | オオバボダイジュ | Tilia maximowicziana Shiras. | |
| オオハマギキョウ | オオハマギキョウ | Lobelia boninensis Koidz. | |
| オオハマボッス | オオハマボッス | Lysimachia mauritiana Lam. var. rubida (Koidz.) T.Yamaz. | |
| オオバマンサク | オオバマンサク | Hamamelis japonica Siebold et Zucc. var. megalophylla (Koidz.) Kitam. | |
| オオバミドリゴケ | オオバミドリゴケ | Endocarpon ramulosum H.Harada | 地衣類 |
| オオバミヤマノコギリシダ | オオバミヤマノコギリシダ | Diplazium hayatamae N.Ohta et M.Takamiya | |
| オオバメギ | オオバメギ | Berberis tschonoskyana Regel | |
| オオバヤシャブシ | オオバヤシャブシ | Alnus sieboldiana Matsum. | |
| オオバヨメナ | オオバヨメナ | Aster miquelianus H.Hara | |
| オオバヨモギ | オオバヨモギ | Artemisia koidzumii Nakai var. megaphylla Kitam. | |
| オオハルトラノオ | オオハルトラノオ | Bistorta tenuicaulis (Bisset et S.Moore) Nakai var. chionophila Yonek. et H.Ohashi | |
| オオハンゲ | オオハンゲ | Pinellia tripartita (Blume) Schott | |
| オオヒゲガリヤス | オオヒゲガリヤス | Calamagrostis grandiseta Takeda | |
| オオヒゲナガカリヤスモドキ | オオヒゲナガカリヤスモドキ | Miscanthus intermedius (Honda) Honda | |
| オオヒョウタンボク | オオヒョウタンボク | Lonicera tschonoskii Maxim. | |
| オオヒラウスユキソウ | オオヒラウスユキソウ | Leontopodium miyabeanum (S.Watan.) Tatew. ex S.Watan. | |
| オオヒラタンポポ | オオヒラタンポポ | Taraxacum ohirense S.Watan. et Morita | |
| オオビランジ | オオビランジ | Silene keiskei Miq. | |
| オオボケガヤ | オオボケガヤ | Arundinella riparia Honda subsp. breviaristata Ibaragi | |
| オオホシダ | オオホシダ | Thelypteris boninensis (Kodama ex Koidz.) K.Iwats. | シダ植物 |
| オオマツバシバ | オオマツバシバ | Aristida takeoi Ohwi | |
| オオマムシグサ | オオマムシグサ | Arisaema takedae Makino | |
| オオマルバコンロンソウ | オオマルバコンロンソウ | Cardamine arakiana Koidz. | |
| オオミコゴメグサ | オオミコゴメグサ | Euphrasia insignis Wettst. subsp. insignis var. omiensis (Y.Kimura ex H.Hara) T.Yamaz. | |
| オオミネアザミ | オオミネアザミ | Cirsium ohminense Kadota | |
| オオミネコザクラ | オオミネコザクラ | Primula reinii Franch. et Sav. var. okamotoi (Koidz.) Murata | |
| オオミネテンナンショウ | オオミネテンナンショウ | Arisaema nikoense Nakai subsp. australe (M.Hotta) Seriz. | |
| オオミネヒナノガリヤス | オオミネヒナノガリヤス | Calamagrostis nana Takeda subsp. ohminensis Tateoka | |
| オオミノトベラ | オオミノトベラ | Pittosporum boninense Koidz. var. chichijimense (Nakai ex Tuyama) H.Ohba | |
| オオメノマンネングサ | オオメノマンネングサ | Sedum rupifragum Koidz. | |
| オオモクセイ | オオモクセイ | Osmanthus rigidus Nakai | |
| オオモミジ | オオモミジ | Acer amoenum Carrière var. amoenum | |
| オオモミジガサ | オオモミジガサ | Miricacalia makinoana (Yatabe) Kitam. | |
| オオヤマイチジク | オオヤマイチジク | Ficus iidaiana Rehder et E.H.Wilson | |
| オオヤマツツジ | オオヤマツツジ | Rhododendron transiens Nakai | |
| オオヤマムグラ | オオヤマムグラ | Galium pogonanthum Franch. et Sav. var. trichopetalum (Nakai) H.Hara | |
| オオヨドカワゴロモ | オオヨドカワゴロモ | Hydrobryum koribanum Imamura ex S.Nakayama et Minamit. | |
| オオレイジンソウ | オオレイジンソウ | Aconitum hondoense (Nakai ex Tamura et Lauener) Kadota | |
| オガアザミ | オガアザミ | Cirsium horiianum Kadota | |
| オカイボタ | オカイボタ | Ligustrum ovalifolium Hassk. var. hisauchii (Makino) Noshiro | |
| オカウコギ | オカウコギ | Eleutherococcus spinosus (L.f.) S.Y.Hu var. japonicus (Franch. et Sav.) H.Ohba | |
| オガコウモリ | オガコウモリ | Parasenecio ogamontanus Kadota | |
| オガサワラアオグス | オガサワラアオグス | Machilus boninensis Koidz. | |
| オガサワラアザミ | オガサワラアザミ | Cirsium boninense Koidz. | |
| オガサワラクチナシ | オガサワラクチナシ | Gardenia boninensis (Nakai) Tuyama ex Toyoda | |
| オガサワラグミ | オガサワラグミ | Elaeagnus rotundata Nakai | |
| オガサワラグワ | オガサワラグワ | Morus boninensis Koidz. | |
| オガサワラシコウラン | オガサワラシコウラン | Bulbophyllum boninense (Schltr.) J.J.Sm. | |
| オガサワラシロダモ | オガサワラシロダモ | Neolitsea boninensis Koidz. | |
| オガサワラトリハダゴケ | オガサワラトリハダゴケ | Pertusaria boninensis Shibuichi | 地衣類 |
| オガサワラハチジョウシダ | オガサワラハチジョウシダ | Pteris boninensis H.Ohba | シダ植物 |
| オガサワラビロウ | オガサワラビロウ | Livistona chinensis (Jacq.) R.Br. ex Mart. var. boninensis Becc. | |
| オガサワラボチョウジ | オガサワラボチョウジ | Psychotria homalosperma A.Gray | |
| オガサワラモクレイシ | オガサワラモクレイシ | Geniostoma glabrum Matsum. | |
| オガサワラヤブニッケイ | オガサワラヤブニッケイ | Cinnamomum pseudopedunculatum Hayata | |
| オガタチイチゴツナギ | オガタチイチゴツナギ | Poa ogamontana Mochizuki | |
| オカタツナミソウ | オカタツナミソウ | Scutellaria brachyspica Nakai et H.Hara | |
| オガタテンナンショウ | オガタテンナンショウ | Arisaema ogatae Koidz. | |
| オキシャクナゲ | オキシャクナゲ | Rhododendron japonoheptamerum Kitam. var. okiense T.Yamaz. | |
| オキタンポポ | オキタンポポ | Taraxacum maruyamanum Kitam. | |
| オキナワイボタ | オキナワイボタ | Ligustrum liukiuense Koidz. | |
| オキナワウラジロガシ | オキナワウラジロガシ | Quercus miyagii Koidz. | |
| オキナワカナワラビ | オキナワカナワラビ | Arachniodes amabilis (Blume) Tindale var. okinawensis (Nakaike) Seriz. | |
| オキナワギク | オキナワギク | Aster miyagii Koidz. | |
| オキナワジイ | オキナワジイ | Castanopsis sieboldii (Makino) Hatus. ex T.Yamaz. et Mashiba subsp. lutchuensis (Koidz.) H.Ohba | |
| オキナワジュズスゲ | オキナワジュズスゲ | Carex ischnostachya Steud. var. fastigiata T.Koyama | |
| オキナワスズムシソウ | オキナワスズムシソウ | Strobilanthes tashiroi Hayata | |
| オキナワスミレ | オキナワスミレ | Viola utchinensis Koidz. | |
| オキナワソケイ | オキナワソケイ | Jasminum superfluum Koidz. | |
| オキナワチドリ | オキナワチドリ | Amitostigma lepidum (Rchb.f.) Schltr. | |
| オキナワテンナンショウ | オキナワテンナンショウ | Arisaema heterocephalum Koidz. subsp. okinawense H.Ohashi et J.Murata | |
| オキナワトベラ | オキナワトベラ | Pittosporum boninense Koidz. var. lutchuense (Koidz.) H.Ohba | |
| オキナワハイネズ | オキナワハイネズ | Juniperus taxifolia Hook. et Arn. var. lutchuensis (Koidz.) Satake | |
| オキナワハグマ | オキナワハグマ | Ainsliaea macroclinidioides Hayata var. okinawensis (Hayata) Kitam. | |
| オキナワバライチゴ | オキナワバライチゴ | Rubus okinawensis Koidz. | |
| オキナワヒメウツギ | オキナワヒメウツギ | Deutzia naseana Nakai var. amanoi (Hatus.) Hatus. ex H.Ohba | |
| オキナワヒメナキリスゲ | オキナワヒメナキリスゲ | Carex tamakii T.Koyama | |
| オキナワマツバボタン | オキナワマツバボタン | Portulaca okinawensis E.Walker et Tawada | |
| オキナワヤブムラサキ | オキナワヤブムラサキ | Callicarpa oshimensis Hayata var. okinawensis (Nakai) Hatus. | |
| オキノアブラギク | オキノアブラギク | Chrysanthemum okiense Kitam. | |
| オクウスギタンポポ | オクウスギタンポポ | Taraxacum denudatum H.Koidz. | |
| オクキタアザミ | オクキタアザミ | Saussurea riederi Herder var. japonica Koidz. | |
| オクタマツリスゲ | オクタマツリスゲ | Carex filipes Franch. et Sav. var. kuzakaiensis (M.Kikuchi) T.Koyama | |
| オクチョウジザクラ | オクチョウジザクラ | Cerasus apetala (Siebold et Zucc.) Ohle ex H.Ohba var. pilosa (Koidz.) H.Ohba | |
| オクトリカブト | オクトリカブト | Aconitum japonicum Thunb. subsp. subcuneatum (Nakai) Kadota | |
| オクヤマアザミ | オクヤマアザミ | Cirsium ovalifolium (Franch. et Sav.) Matsum. | |
| オクヤマオトギリ | オクヤマオトギリ | Hypericum gracillimum Koidz. | |
| オクヤマコウモリ | オクヤマコウモリ | Parasenecio maximowiczianus (Nakai et F.Maek. ex H.Hara) H.Koyama var. alatus (F.Maek.) H.Koyama | |
| オグラコウホネ | オグラコウホネ | Nuphar oguraensis Miki var. oguraensis | |
| オグラノフサモ | オグラノフサモ | Myriophyllum oguraense Miki | |
| オサシダ | オサシダ | Blechnum amabile Makino | シダ植物 |
| オサバグサ | オサバグサ | Pteridophyllum racemosum Siebold et Zucc. | |
| オシマオトギリ | オシマオトギリ | Hypericum vulcanicum Koidz. | |
| オゼキンポウゲ | オゼキンポウゲ | Ranunculus subcorymbosus Kom. var. ozensis (H.Hara) Tamura | |
| オゼコウホネ | オゼコウホネ | Nuphar pumila (Timm) DC. var. ozeensis H.Hara | |
| オゼソウ | オゼソウ | Japonolirion osense Nakai | |
| オゼヌマアザミ | オゼヌマアザミ | Cirsium homolepis Nakai | |
| オゼミズギク | オゼミズギク | Inula ciliaris (Miq.) Maxim. var. glandulosa Kitam. | |
| オタルスゲ | オタルスゲ | Carex otaruensis Franch. | |
| オチフジ | オチフジ | Meehania montis-koyae Ohwi | |
| オトコヨウゾメ | オトコヨウゾメ | Viburnum phlebotrichum Siebold et Zucc. | |
| オトメアオイ | オトメアオイ | Asarum savatieri Franch. subsp. savatieri | |
| オトメイチゲ | オトメイチゲ | Anemone flaccida F.Schmidt var. tagawae (Ohwi) Honda | |
| オトメシャジン | オトメシャジン | Adenophora triphylla (Thunb.) A.DC. var. puellaris (Honda) H.Hara | |
| オドリコカグマ | オドリコカグマ | Microlepia izupeninsulae Sa.Kurata | |
| オドリコテンナンショウ | オドリコテンナンショウ | Arisaema aprile J.Murata | |
| オナガカンアオイ | オナガカンアオイ | Asarum minamitanianum Hatus. | |
| オニアザミ | オニアザミ | Cirsium borealinipponense Kitam. | |
| オニオオノアザミ | オニオオノアザミ | Cirsium diabolicum Kitam. | |
| オニオトコヨモギ | オニオトコヨモギ | Artemisia congesta Kitam. | |
| オニカモジグサ | オニカモジグサ | Elymus tsukushiensis Honda var. tsukushiensis | |
| オニカンアオイ | オニカンアオイ | Asarum yakusimense Masam. | |
| オニグジョウシノ | オニグジョウシノ | Sasaella caudiceps (Koidz.) Koidz. var. caudiceps | |
| オニコナスビ | オニコナスビ | Lysimachia tashiroi Makino | |
| オニサネゴケ | オニサネゴケ | Pyrenula gigas Zahlbr. | 地衣類 |
| オニシオガマ | オニシオガマ | Pedicularis nipponica Makino | |
| オニツクバネウツギ | オニツクバネウツギ | Abelia serrata Siebold et Zucc. var. tomentosa (Koidz.) Nakai | |
| オニツルボ | オニツルボ | Barnardia japonica (Thunb.) Schult. et Schult.f. var. major (Uyeki et Tokui) M.N.Tamura, ined. | |
| オニノガリヤス | オニノガリヤス | Calamagrostis gigas Takeda | |
| オニビトノガリヤス | オニビトノガリヤス | Calamagrostis onibitoana Tateoka | |
| オニマンジュウゴケ | オニマンジュウゴケ | Strigula bella G.Thor et al. | 地衣類 |
| オニヤマボクチ | オニヤマボクチ | Synurus pungens (Franch. et Sav.) Kitam. var. giganteus Kitam. | |
| オニレンゲゴケ | オニレンゲゴケ | Cladonia subdecaryana Yoshim. | 地衣類 |
| オヌカザサ | オヌカザサ | Sasa hibaconuca Koidz. | |
| オノエラン | オノエラン | Galearis fauriei (Finet) P.F.Hunt | |
| オノエリンドウ | オノエリンドウ | Gentianella takedae (Kitag.) Satake | |
| オハラメアザミ | オハラメアザミ | Cirsium microspicatum Nakai var. kiotoense Kitam. | |
| オヒガンギボウシ | オヒガンギボウシ | Hosta longipes (Franch. et Sav.) Matsum. var. aequinoctiiantha (Koidz. ex Araki) Kitam. | |
| オヒルギフシアナゴケ | オヒルギフシアナゴケ | Mazosia bruguierae A.Sakata & H.Harada | 地衣類 |
| オモエザサ | オモエザサ | Neosasamorpha pubiculmis (Makino) Sad.Suzuki subsp. pubiculmis var. pubiculmis | |
| オモゴウテンナンショウ | オモゴウテンナンショウ | Arisaema iyoanum Makino subsp. iyoanum | |
| オモロカンアオイ | オモロカンアオイ | Asarum dissitum Hatus. | |
| オヤマソバ | オヤマソバ | Aconogonon nakaii (H.Hara) H.Hara | |
| オヤマノエンドウ | オヤマノエンドウ | Oxytropis japonica Maxim. var. japonica | |
| オヤマボクチ | オヤマボクチ | Synurus pungens (Franch. et Sav.) Kitam. var. pungens | |
| オヤマリンドウ | オヤマリンドウ | Gentiana makinoi Kusn. | |
| オヤリハグマ | オヤリハグマ | Pertya triloba (Makino) Makino | |
| オリーブトリハダゴケモドキ（チビトリハダゴケ） | オリーブトリハダゴケモドキ（チビトリハダゴケ） | Pertusaria obsolescens Nyl. | 地衣類 |
| オリヅルスミレ | オリヅルスミレ | Viola stoloniflora Yokota et Higa | |
| オンタケブシ | オンタケブシ | Aconitum metajaponicum Nakai | |
| オンツツジ | オンツツジ | Rhododendron weyrichii Maxim. var. weyrichii | |
| カイコバイモ | カイコバイモ | Fritillaria kaiensis Naruh. | |
| カイサカネラン | カイサカネラン | Neottia furusei T.Yukawa et Yagame | |
| カイジンドウ | カイジンドウ | Ajuga ciliata Bunge var. villosior A.Gray ex Nakai | |
| カイタカラコウ | カイタカラコウ | Ligularia kaialpina Kitam. | |
| カイナンサラサドウダン | カイナンサラサドウダン | Enkianthus sikokianus (Palib.) Ohwi | |
| カイフウロ | カイフウロ | Geranium shikokianum Matsum. var. kaimontanum (Honda) Honda et H.Hara | |
| カガノアザミ | カガノアザミ | Cirsium kagamontanum Nakai | |
| カガミナンブスズ | カガミナンブスズ | Neosasamorpha kagamiana (Makino et Uchida) Koidz. subsp. kagamiana | |
| カギガタアオイ | カギガタアオイ | Asarum curvistigma F.Maek. | |
| カキノハグサ | カキノハグサ | Polygala reinii Franch. et Sav. | |
| ガクアジサイ | ガクアジサイ | Hydrangea macrophylla (Thunb.) Ser. [f. normalis (E.H.Wilson) H.Hara] | |
| ガクウツギ | ガクウツギ | Hydrangea scandens (L.f.) Ser. | |
| カクレホウネンゴケ | カクレホウネンゴケ | Sarcogyne gibberella (Nyl.) H.Magn. | 地衣類 |
| カケロマカンアオイ | カケロマカンアオイ | Asarum trinacriforme Yamahata | |
| カゴシマスゲ | カゴシマスゲ | Carex kagoshimensis Tak.Shimizu | |
| カジカエデ | カジカエデ | Acer diabolicum Blume ex K.Koch | |
| カシダザサ | カシダザサ | Neosasamorpha shimidzuana (Makino) Koidz. subsp. kashidensis (Makino et Koidz.) Sad.Suzuki | |
| カシワバハグマ | カシワバハグマ | Pertya robusta (Maxim.) Makino var. robusta | |
| カズサイノデ | カズサイノデ | Polystichum polyblepharon (Roem. ex Kunze) C.Presl var. scabiosum Sa.Kurata | |
| カタマリコゴケ | カタマリコゴケ | Spilonema japonicum (Henssen & T?nsberg) T.Sprib. et al. | 地衣類 |
| カッコソウ | カッコソウ | Primula kisoana Miq. var. kisoana | |
| ガッサンチドリ | ガッサンチドリ | Platanthera takedae Makino subsp. uzenensis (Ohwi) K.Inoue | |
| ガッサントリカブト | ガッサントリカブト | Aconitum gassanense Kadota et Shin’ei Kato | |
| カツラカワアザミ | カツラカワアザミ | Cirsium opacum (Kitam.) Kadota | |
| カツラギグミ | カツラギグミ | Elaeagnus takeshitae Makino | |
| カトウハコベ | カトウハコベ | Arenaria katoana Makino var. katoana | |
| カドハリイ | カドハリイ | Eleocharis tsurumachii Ohwi | |
| カナウツギ | カナウツギ | Stephanandra tanakae Franch. et Sav. | |
| カニコウモリ | カニコウモリ | Parasenecio adenostyloides (Franch. et Sav. ex Maxim.) H.Koyama | |
| カニツリノガリヤス | カニツリノガリヤス | Calamagrostis fauriei Hack. var. fauriei | |
| カノコユリ | カノコユリ | Lilium speciosum Thunb. var. speciosum | |
| カノツメソウ | カノツメソウ | Spuriopimpinella calycina (Maxim.) Kitag. | |
| カミガモシダ | カミガモシダ | Asplenium oligophlebium Baker var. oligophlebium | シダ植物 |
| カミガモソウ | カミガモソウ | Gratiola fluviatilis Koidz. | |
| カミコウチテンナンショウ | カミコウチテンナンショウ | Arisaema nikoense Nakai subsp. brevicollum (H.Ohashi et J.Murata) J.Murata | |
| カムイコザクラ | カムイコザクラ | Primula hidakana Miyabe et Kudô ex Nakai var. kamuiana (Miyabe et Tatew.) H.Hara | |
| カメバヒキオコシ | カメバヒキオコシ | Rabdosia umbrosa (Maxim.) H.Hara var. leucantha (Murai) H.Hara | |
| カライトソウ | カライトソウ | Sanguisorba hakusanensis Makino | |
| カラコギカエデ | カラコギカエデ | Acer ginnala Maxim. var. aidzuense (Franch.) K.Ogata | |
| カラスシキミ | カラスシキミ | Daphne miyabeana Makino | |
| カラマツ | カラマツ | Larix kaempferi (Lamb.) Carrière | |
| カラマツソウ | カラマツソウ | Thalictrum aquilegiifolium L. var. intermedium Nakai | |
| カリバオウギ | カリバオウギ | Astragalus yamamotoi Miyabe et Tatew. | |
| カリヤス | カリヤス | Miscanthus tinctorius (Steud.) Hack. | |
| カリヤスモドキ | カリヤスモドキ | Miscanthus oligostachyus Stapf var. oligostachyus | |
| カリワシノ | カリワシノ | Sasaella ikegamii (Nakai) Sad.Suzuki | |
| カワズスゲ | カワズスゲ | Carex omiana Franch. et Sav. var. monticola Ohwi | |
| カワゼンコ | カワゼンコ | Angelica tenuisecta (Makino) Makino var. tenuisecta | |
| カワチブシ | カワチブシ | Aconitum grossedentatum (Nakai) Nakai var. grossedentatum | |
| カワナコザラゴケ | カワナコザラゴケ | Gyalidea kawanae H.Harada & V?zda | 地衣類 |
| カワバタハチジョウシダ | カワバタハチジョウシダ | Pteris kawabatae Sa.Kurata | |
| カワラウスユキソウ | カワラウスユキソウ | Leontopodium japonicum Miq. var. perniveum (Honda) Kitam. | |
| カワラオトギリ | カワラオトギリ | Hypericum kawaranum N.Robson | |
| カワラスゲ | カワラスゲ | Carex incisa Boott | |
| カワラノギク | カワラノギク | Aster kantoensis Kitam. | |
| カワラハハコ | カワラハハコ | Anaphalis margaritacea (L.) Benth. et Hook.f. var. yedoensis (Franch. et Sav.) Ohwi | |
| カワラハンノキ | カワラハンノキ | Alnus serrulatoides Callier | |
| カンアオイ | カンアオイ | Asarum nipponicum F.Maek. var. nipponicum | |
| カンカケイニラ | カンカケイニラ | Allium togashii H.Hara | |
| カンコノキ | カンコノキ | Glochidion obovatum Siebold et Zucc. | |
| ガンジュアザミ | ガンジュアザミ | Cirsium ganjuense Kitam. | |
| カンスゲ | カンスゲ | Carex morrowii Boott var. morrowii | |
| カンダヒメラン | カンダヒメラン | Malaxis kandae T.Hashim. | |
| カンツワブキ | カンツワブキ | Farfugium hiberniflorum (Makino) Kitam. | |
| カントウタンポポ | カントウタンポポ | Taraxacum platycarpum Dahlst. var. platycarpum | |
| カントウミヤマカタバミ | カントウミヤマカタバミ | Oxalis griffithii Edgew. et Hook.f. var. kantoensis (Terao) T.Shimizu | |
| カントウヨメナ | カントウヨメナ | Aster yomena (Kitam.) Honda var. dentatus (Kitam.) H.Hara | |
| ガンピ | ガンピ | Diplomorpha sikokiana (Franch. et Sav.) Honda | |
| キイイトラッキョウ | キイイトラッキョウ | Allium kiiense (Murata) Hir.Takah. et M.Hotta | |
| キイシオギク | キイシオギク | Chrysanthemum shiwogiku Kitam. var. kinokuniense Shimot. et Kitam. | |
| キイジョウロウホトトギス | キイジョウロウホトトギス | Tricyrtis macranthopsis Masam. | |
| キイセンニンソウ | キイセンニンソウ | Clematis ovatifolia T.Itô ex Maxim. | |
| キイトスゲ | キイトスゲ | Carex alterniflora Franch. var. fulva Ohwi | |
| キイハナネコノメ | キイハナネコノメ | Chrysosplenium album Maxim. var. nachiense H.Hara | |
| キイムヨウラン | キイムヨウラン | Lecanorchis japonica Blume var. kiiensis (Murata) T.Hashim. | |
| キイロトゲウメノキゴケ（トゲキウメノキゴケ） | キイロトゲウメノキゴケ（トゲキウメノキゴケ） | Parmotrema pacificum (Kurok.) Kurok. | 地衣類 |
| キカラスウリ | キカラスウリ | Trichosanthes kirilowii Maxim. var. japonica (Miq.) Kitam. | |
| キクガラクサ | キクガラクサ | Ellisiophyllum pinnatum (Wall.) Makino var. reptans (Maxim.) T.Yamaz. | |
| キクバオウレン | キクバオウレン | Coptis japonica (Thunb.) Makino var. anemonifolia (Siebold et Zucc.) H.Ohba | |
| キクバヤマボクチ | キクバヤマボクチ | Synurus palmatopinnatifidus (Makino) Kitam. var. palmatopinnatifidus | |
| キクムグラ | キクムグラ | Galium kikumugura Ohwi | |
| キケンショウマ | キケンショウマ | Cimicifuga japonica (Thunb.) Spreng. var. peltata (Makino) H.Hara | |
| キゴウゴケ | キゴウゴケ | Opegrapha inaequans Nyl. | 地衣類 |
| キゴウゴケ | キゴウゴケ | Opegrapha lichenicola G.Thor et al. | 地衣類 |
| キゴウゴケ | キゴウゴケ | Opegrapha subdiaphora Nyl. | 地衣類 |
| キゴウゴケ | キゴウゴケ | Ophioparma pseudohandelii (Asahina) Printzen & Rambold | 地衣類 |
| キゴウゴケ | キゴウゴケ | Orientophila subscopularis Arup & Frisch (Arup et al. 2013) | 地衣類 |
| キシダマムシグサ | キシダマムシグサ | Arisaema kishidae Makino ex Nakai | |
| キシツツジ | キシツツジ | Rhododendron ripense Makino | |
| キシュウネコノメ | キシュウネコノメ | Chrysosplenium macrostemon Maxim. var. calicitrapa (Franch.) H.Hara | |
| キセルアザミ | キセルアザミ | Cirsium sieboldii Miq. | |
| キソアザミ | キソアザミ | Cirsium fauriei Nakai | |
| キソイチゴ | キソイチゴ | Rubus kisoensis Nakai | |
| キソウロコゴケ | キソウロコゴケ | Clavascidium kisovense (Zahlbr.) Breuss | 地衣類 |
| キソキバナアキギリ | キソキバナアキギリ | Salvia nipponica Miq. var. kisoensis K.Imai | |
| キタカミヒョウタンボク | キタカミヒョウタンボク | Lonicera demissa Rehder var. borealis H.Hara et M.Kikuchi | |
| キタゴヨウ | キタゴヨウ | Pinus parviflora Siebold et Zucc. var. pentaphylla (Mayr) A.Henry | |
| キタササガヤ | キタササガヤ | Leptatherum boreale (Ohwi) C.-H.Chen, C.-S. Kuoh, Veldk. | |
| キタザワブシ | キタザワブシ | Aconitum nipponicum Nakai subsp. micranthum (Nakai) Kadota | |
| キタダケイチゴツナギ | キタダケイチゴツナギ | Poa glauca Vahl subsp. kitadakensis (Ohwi) T.Koyama | |
| キタダケキンポウゲ | キタダケキンポウゲ | Ranunculus kitadakeanus Ohwi | |
| キタダケソウ | キタダケソウ | Callianthemum hondoense Nakai et H.Hara | |
| キタダケトラノオ | キタダケトラノオ | Pseudolysimachion ovatum (Nakai) T.Yamaz. subsp. kiusianum (Furumi) T.Yamaz. var. kitadakemontanum (T.Yamaz.) T.Yamaz. | |
| キタダケトリカブト | キタダケトリカブト | Aconitum kitadakense Nakai | |
| キタダケナズナ | キタダケナズナ | Draba kitadakensis Koidz. | |
| キタダケヨモギ | キタダケヨモギ | Artemisia kitadakensis H.Hara et Kitam. | |
| キタダケリンドウ | キタダケリンドウ | Gentiana scabra Bunge var. kitadakensis (N.Yonez.) Halda | |
| キタミオトギリ | キタミオトギリ | Hypericum kitamense (Y.Kimura) N.Robson | |
| キタヤマヌカボ | キタヤマヌカボ | Agrostis osakae Honda | |
| キツネノカミソリ | キツネノカミソリ | Lycoris sanguinea Maxim. var. sanguinea | |
| キツネヤナギ | キツネヤナギ | Salix vulpina Anders. | |
| キヌガサソウ | キヌガサソウ | Paris japonica (Franch. et Sav.) Franch. | |
| キヌタソウ | キヌタソウ | Galium kinuta Nakai et H.Hara | |
| キノエササラン | キノエササラン | Liparis uchiyamae Schltr. | |
| キノクニカモメヅル | キノクニカモメヅル | Cynanchum sublanceolatum (Miq.) Matsum. var. kinokuniense T.Yamaz. | |
| キノクニスズカケ | キノクニスズカケ | Veronicastrum tagawae (Ohwi) T.Yamaz. | |
| キノクニベニシダ | キノクニベニシダ | Dryopteris kinokuniensis Sa.Kurata | シダ植物 |
| キバナアキギリ | キバナアキギリ | Salvia nipponica Miq. var. nipponica | |
| キバナウツギ | キバナウツギ | Weigela maximowiczii (S.Moore) Rehder | |
| キバナコウリンカ | キバナコウリンカ | Tephroseris furusei (Kitam.) B.Nord. | |
| キバナサバノオ | キバナサバノオ | Dichocarpum pterigionocaudatum (Koidz.) Tamura et Lauener | |
| キバナチゴユリ | キバナチゴユリ | Disporum lutescens (Maxim.) Koidz. | |
| キバナナツノタムラソウ | キバナナツノタムラソウ | Salvia lutescens (Koidz.) Koidz. var. lutescens | |
| キバナノショウキラン | キバナノショウキラン | Yoania amagiensis Nakai et F.Maek. | |
| キバナノツキヌキホトトギス | キバナノツキヌキホトトギス | Tricyrtis perfoliata Masam. | |
| キバナノヒメユリ | キバナノヒメユリ | Lilium callosum Siebold et Zucc. var. flaviflorum Makino | |
| キバナノホトトギス | キバナノホトトギス | Tricyrtis flava Maxim. | |
| キバナハナネコノメ | キバナハナネコノメ | Chrysosplenium album Maxim. var. flavum H.Hara | |
| キビシロタンポポ | キビシロタンポポ | Taraxacum hideoi Nakai ex H.Koidz. | |
| キビノサラゴケ | キビノサラゴケ | Gyalecta kibiensis H.Harada & Yoshim. | 地衣類 |
| キブシ | キブシ | Stachyurus praecox Siebold et Zucc. var. praecox | |
| キブネダイオウ | キブネダイオウ | Rumex nepalensis Spreng. subsp. andreaeanus (Makino) Yonek. | |
| キボウシノ | キボウシノ | Pleioblastus kodzumae Makino | |
| キャラボク | キャラボク | Taxus cuspidata Siebold et Zucc. var. nana Hort. ex Rehder | |
| キュウシュウコゴメグサ | キュウシュウコゴメグサ | Euphrasia insignis Wettst. subsp. iinumae (Takeda) T.Yamaz. var. kiusiana (Y.Kimura) T.Yamaz. | |
| ギョウジャアザミ | ギョウジャアザミ | Cirsium gyojanum Kitam. | |
| キョウマルシャクナゲ | キョウマルシャクナゲ | Rhododendron japonoheptamerum Kitam. var. kyomaruense (T.Yamaz.) Kitam. | |
| キヨスミアナイボゴケ | キヨスミアナイボゴケ | Verrucaria kiyosumiensis H.Harada | 地衣類 |
| キヨズミイボタ | キヨズミイボタ | Ligustrum tschonoskii Decne. var. kiyozumianum (Nakai) Ohwi | |
| キヨスミカワキノリ | キヨスミカワキノリ | Leptogium kiyosumiense H.Harada | 地衣類 |
| キヨスミカワキノリ | キヨスミカワキノリ | Leptosphaeria akagiensis Vain. | 地衣類 |
| キヨスミギボウシ | キヨスミギボウシ | Hosta kiyosumiensis F.Maek. | |
| キヨスミミツバツツジ | キヨスミミツバツツジ | Rhododendron kiyosumense (Makino) Makino | |
| キヨミトリカブト | キヨミトリカブト | Aconitum kiyomiense Kadota | |
| キリガミネアサヒラン | キリガミネアサヒラン | Eleorchis japonica (A.Gray) F.Maek. var. conformis (F.Maek.) F.Maek. ex H.Hara et M.Mizush. | |
| キリガミネトウヒレン | キリガミネトウヒレン | Saussurea kirigaminensis Kitam. | |
| キリガミネヒオウギアヤメ | キリガミネヒオウギアヤメ | Iris setosa Pall. ex Link var. hondoensis Honda | |
| キリギシソウ | キリギシソウ | Callianthemum kirigishiense (Ken Sato et Koji Ito) Kadota | |
| キリシマアザミ | キリシマアザミ | Cirsium kirishimense Kadota et Masami Saito | |
| キリシマザサ | キリシマザサ | Neosasamorpha takizawana (Makino et Uchida) Tatew. subsp. nakashimana (Koidz.) Sad.Suzuki | |
| キリシマタヌキノショクダイ | キリシマタヌキノショクダイ | Thismia tuberculata Hatus. | |
| キリシマテンナンショウ | キリシマテンナンショウ | Arisaema sazensoo (Buerger ex Blume) Makino | |
| キリシマノガリヤス | キリシマノガリヤス | Calamagrostis autumnalis Koidz. subsp. autumnalis var. autumnalis | |
| キリシマヒゴタイ | キリシマヒゴタイ | Saussurea scaposa Franch. et Sav. | |
| キリシマヘビノネゴザ | キリシマヘビノネゴザ | Athyrium kirisimaense Tagawa | シダ植物 |
| キリシマミズキ | キリシマミズキ | Corylopsis glabrescens Franch. et Sav. | |
| キリシマミツバツツジ | キリシマミツバツツジ | Rhododendron nudipes Nakai var. kirishimense T.Yamaz. | |
| キリタチヤマザクラ | キリタチヤマザクラ | Cerasus sargentii (Rehder) H.Ohba var. akimotoi H.Ohba et Mas.Saito | |
| キレハオオクボシダ | キレハオオクボシダ | Ctenopteris sakaguchiana (Koidz.) H.Itô | |
| キレバチダケサシ | キレバチダケサシ | Astilbe microphylla Knoll var. riparia Hatus. | |
| キンカアザミ | キンカアザミ | Cirsium muraii Kitam. | |
| キンキエンゴサク | キンキエンゴサク | Corydalis lineariloba Siebold et Zucc. var. papilligera (Ohwi) Ohwi ex Akiyama | |
| キンキカサスゲ | キンキカサスゲ | Carex persistens Ohwi | |
| キンキヒョウタンボク | キンキヒョウタンボク | Lonicera ramosissima Franch. et Sav. ex Maxim. var. kinkiensis (Koidz.) Ohwi | |
| キンキマメザクラ | キンキマメザクラ | Cerasus incisa (Thunb.) Loisel. var. kinkiensis (Koidz.) H.Ohba | |
| キンコウカ | キンコウカ | Narthecium asiaticum Maxim. | |
| キンスゲ | キンスゲ | Carex pyrenaica Wahlenb. var. altior Kük. | |
| キンチャクアオイ | キンチャクアオイ | Asarum hexalobum F.Maek. var. perfectum F.Maek. | |
| キンチャクゴケ | キンチャクゴケ | Thelotrema nipponicum Tat.Matsumoto | 地衣類 |
| キントキシロヨメナ | キントキシロヨメナ | Aster ageratoides Turcz. var. oligocephalus (Nakai ex H.Hara) Nor.Tanaka | |
| キントキヒゴタイ | キントキヒゴタイ | Saussurea sawadae Kitam. | |
| キンバイソウ | キンバイソウ | Trollius hondoensis Nakai | |
| ギンバイソウ | ギンバイソウ | Deinanthe bifida Maxim. | |
| キンモウワラビ | キンモウワラビ | Hypodematium crenatum (Forssk.) Kuhn subsp. fauriei (Kodama) K.Iwats. | シダ植物 |
| キンレイカ | キンレイカ | Patrinia triloba (Miq.) Miq. var. palmata (Maxim.) H.Hara | |
| クガイソウ | クガイソウ | Veronicastrum japonicum (Nakai) T.Yamaz. var. japonicum | |
| クサアジサイ | クサアジサイ | Cardiandra alternifolia Siebold et Zucc. subsp. alternifolia var. alternifolia | |
| クサナギオゴケ | クサナギオゴケ | Cynanchum katoi Ohwi | |
| クサボケ | クサボケ | Chaenomeles japonica (Thunb.) Lindl. ex Spach | |
| クサボタン | クサボタン | Clematis stans Siebold et Zucc. var. stans | |
| クサヤツデ | クサヤツデ | Diaspananthus uniflorus (Sch.Bip.) Kitam. | |
| クシバタンポポ | クシバタンポポ | Taraxacum pectinatum Kitam. | |
| クジュウアザミ | クジュウアザミ | Cirsium kujuense Kadota | |
| クジュウスゲ | クジュウスゲ | Carex sachalinensis F.Schmidt var. elongatula (Ohwi) Ohwi | |
| クジュウノガリヤス | クジュウノガリヤス | Calamagrostis autumnalis Koidz. subsp. autumnalis var. microtis Ohwi | |
| グジョウシノ | グジョウシノ | Sasaella bitchuensis (Makino) Makino ex Koidz. var. tashirozentaroana (Koidz.) Sad.Suzuki | |
| グスクカンアオイ | グスクカンアオイ | Asarum gusk Yamahata | |
| クスノハカエデ | クスノハカエデ | Acer oblongum Wall. ex DC. var. itoanum Hayata | |
| クテガワザサ | クテガワザサ | Sasa heterotricha Koidz. var. heterotricha | |
| クニガミサンショウヅル | クニガミサンショウヅル | Elatostema suzukii T.Yamaz. | |
| クニガミトンボソウ | クニガミトンボソウ | Platanthera sonoharae Masam. | |
| クニガミヒサカキ | クニガミヒサカキ | Eurya zigzag Masam. | |
| クマイワヘゴ | クマイワヘゴ | Dryopteris anthracinisquama Miyam. | シダ植物 |
| クマザサ | クマザサ | Sasa veitchii (Carrière) Rehder | |
| クマシデ | クマシデ | Carpinus japonica Blume | |
| クマナリヒラ | クマナリヒラ | Semiarundinaria fortis Koidz. | |
| クマノダケ | クマノダケ | Angelica tenuisecta (Makino) Makino var. mayebarana (Koidz.) H.Ohba | |
| クマヤナギ | クマヤナギ | Berchemia racemosa Siebold et Zucc. | |
| クマヤマグミ | クマヤマグミ | Elaeagnus epitricha Momiy. ex H.Ohba | |
| クモイコゴメグサ | クモイコゴメグサ | Euphrasia multifolia Wettst. var. kirisimana Y.Kimura | |
| クモイコザクラ | クモイコザクラ | Primula reinii Franch. et Sav. var. kitadakensis (H.Hara) Ohwi | |
| クモイザクラ | クモイザクラ | Cerasus nipponica (Matsum.) Ohle ex H.Ohba var. alpina (Koidz.) H.Ohba | |
| クモイジガバチ | クモイジガバチ | Liparis truncata F.Maek. ex T.Hashim. | |
| クモイナズナ | クモイナズナ | Arabis tanakana Makino | |
| クモマグサ | クモマグサ | Saxifraga merkii Fisch. var. idsuroei (Franch. et Sav.) Engl. ex Matsum. | |
| クモマシバスゲ | クモマシバスゲ | Carex subumbellata Meinsh. var. verecunda Ohwi | |
| クモマナズナ | クモマナズナ | Draba sakuraii Makino | |
| クモマニガナ | クモマニガナ | Ixeris dentata (Thunb.) Nakai subsp. kimurana Kitam. | |
| クモマミミナグサ | クモマミミナグサ | Cerastium schizopetalum Maxim. var. bifidum Takeda ex M.Mizush. | |
| クリイロシダレキノリ | クリイロシダレキノリ | Bryocaulon satoanum (Gyeln.) K?rnefelt | 地衣類 |
| クリオザサ | クリオザサ | Sasaella masamuneana (Makino) Hatus. et Muroi var. masamuneana | |
| クリヤマハハコ | クリヤマハハコ | Anaphalis sinica Hance var. viscosissima (Honda) Kitam. | |
| クリンソウ | クリンソウ | Primula japonica A.Gray | |
| クルマギク | クルマギク | Aster tenuipes Makino | |
| クルマバハグマ | クルマバハグマ | Pertya rigidula (Miq.) Makino | |
| クロウメボシゴケ | クロウメボシゴケ | Trypetheliopsis yoshimurae H.Harada | 地衣類 |
| クロウメモドキ | クロウメモドキ | Rhamnus japonica Maxim. var. decipiens Maxim. | |
| クロカミシライトソウ | クロカミシライトソウ | Chionographis koidzumiana Ohwi var. kurokamiana (H.Hara) M.Maki | |
| クロカミラン | クロカミラン | Ponerorchis graminifolia Rchb.f. var. kurokamiana (Ohwi et Hatus.) T.Hashim. | |
| クロカワアワビゴケ | クロカワアワビゴケ | Usnocetraria kurokawae (Shibuichi & Yoshida) M.J.Lai & J.C.Wei | 地衣類 |
| クロカワアワビゴケ | クロカワアワビゴケ | Verrucaria allantoidea H.Harada | 地衣類 |
| クロカワホルトノキゴケ | クロカワホルトノキゴケ | Porina subrubrosphaera Kurok. | 地衣類 |
| クロカンバ | クロカンバ | Rhamnus costata Maxim. | |
| クロキ | クロキ | Symplocos kuroki Nagam. | |
| クロクモソウ | クロクモソウ | Saxifraga fusca Maxim. var. kikubuki Ohwi | |
| クロゲパンゴケ（クロタテゴケ） | クロゲパンゴケ（クロタテゴケ） | Peltula japonica (Asahina) Yoshim. | 地衣類 |
| クロゲパンゴケ（クロタテゴケ） | クロゲパンゴケ（クロタテゴケ） | Perigrapha lobariae Zhurb. | 地衣類 |
| クロゲパンゴケ（クロタテゴケ） | クロゲパンゴケ（クロタテゴケ） | Pertusaria alpinoides Oshio | 地衣類 |
| クロゲパンゴケ（クロタテゴケ） | クロゲパンゴケ（クロタテゴケ） | Pertusaria astomoides Nyl. | 地衣類 |
| クロソヨゴ | クロソヨゴ | Ilex sugerokii Maxim. var. sugerokii | |
| クロタキカズラ | クロタキカズラ | Hosiea japonica Makino | |
| クロテンシラトリオトギリ | クロテンシラトリオトギリ | Hypericum watanabei N.Robson | |
| クロトウヒレン | クロトウヒレン | Saussurea sessiliflora (Koidz.) Kadota | |
| クロバナヒキオコシ | クロバナヒキオコシ | Rabdosia trichocarpa (Maxim.) H.Hara | |
| クロビイタヤ | クロビイタヤ | Acer miyabei Maxim. | |
| クロヒナスゲ | クロヒナスゲ | Carex gifuensis Franch. | |
| クロヒメカンアオイ | クロヒメカンアオイ | Asarum yoshikawae T.Sugaw. | |
| クロヒメシライトソウ | クロヒメシライトソウ | Chionographis hisauchiana (Okuyama) N.Tanaka subsp. kurohimensis (Ajima et Satomi) N.Tanaka | |
| クロブチミドリゴケ | クロブチミドリゴケ | Endocarpon nigromarginatum H.Harada | 地衣類 |
| クロフネサイシン | クロフネサイシン | Asarum sieboldii Miq. var. dimidiatum (F.Maek.) T.Sugaw. | |
| クロボシソウ | クロボシソウ | Luzula plumosa E.Mey. subsp. dilatata Z.Kaplan | |
| クロマルゴケモドキ | クロマルゴケモドキ | Porina flavonigra H.Harada | 地衣類 |
| クロマルゴケモドキ | クロマルゴケモドキ | Porina grandicula (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| クロマルゴケモドキ | クロマルゴケモドキ | Porina hypochroa Vain. | 地衣類 |
| クロマルゴケモドキ | クロマルゴケモドキ | Porina isidiosa (R?s?nen) M.Sat? | 地衣類 |
| クロマルゴケモドキ | クロマルゴケモドキ | Porina japonica (R?s?nen) M.Sat? | 地衣類 |
| クロマルゴケモドキ | クロマルゴケモドキ | Porina quintaria (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| クロマルゴケモドキ | クロマルゴケモドキ | Porina sanguinea (R?s?nen) M.Sat? | 地衣類 |
| クロミゴケ | クロミゴケ | Scleropyrenium japonicum H.Harada | 地衣類 |
| クロミダイゴケ | クロミダイゴケ | Bogoriella collospora (Vain.) Aptroot & L?cking | 地衣類 |
| クロミノオキナワスズメウリ | クロミノオキナワスズメウリ | Zehneria liukiuensis (Nakai) C.Jeffrey | |
| クロミノニシゴリ | クロミノニシゴリ | Symplocos paniculata (Thunb.) Miq. | |
| クロモジ | クロモジ | Lindera umbellata Thunb. var. umbellata | |
| クワイバカンアオイ | クワイバカンアオイ | Asarum kumageanum Masam. var. kumageanum | |
| クワガタソウ | クワガタソウ | Veronica miqueliana Nakai var. miqueliana | |
| クワノハイチゴ | クワノハイチゴ | Rubus nesiotes Focke | |
| クワノハエノキ | クワノハエノキ | Celtis boninensis Koidz. | |
| グンナイキンポウゲ | グンナイキンポウゲ | Ranunculus grandis Honda var. mirissimus (Hisauti) H.Hara | |
| グンバイヅル | グンバイヅル | Veronica onoei Franch. et Sav. | |
| ケイタドリ | ケイタドリ | Fallopia japonica (Houtt.) Ronse Decr. var. uzenensis (Honda) Yonek. et H.Ohashi | |
| ゲイビゼキショウ | ゲイビゼキショウ | Tofieldia coccinea Richards. var. geibiensis (M.Kikuchi) H.Hara | |
| ケイビラン | ケイビラン | Comospermum yedoense (Maxim. ex Franch. et Sav.) Rausch. | |
| ゲイホクアザミ | ゲイホクアザミ | Cirsium akimontanum Kadota | |
| ケイリュウタチツボスミレ | ケイリュウタチツボスミレ | Viola grypoceras A.Gray var. ripensis N.Yamada et M.Okamoto | |
| ケキブシ | ケキブシ | Stachyurus praecox Siebold et Zucc. var. leucotrichus Hayashi | |
| ケケンポナシ | ケケンポナシ | Hovenia tomentella (Makino) Nakai ex Y.Kimura | |
| ケザサ | ケザサ | Sasa pubens Nakai | |
| ケサンカクヅル | ケサンカクヅル | Vitis flexuosa Thunb. var. rufotomentosa Makino | |
| ケシツブアナイボゴケ | ケシツブアナイボゴケ | Verrucaria minuscula H.Harada | 地衣類 |
| ケシバニッケイ | ケシバニッケイ | Cinnamomum doederleinii Engl. var. pseudodaphnoides Hatus. | |
| ケショウアザミ | ケショウアザミ | Cirsium japonicum Fisch. ex DC. var. vestitum Kitam. | |
| ケシロヨメナ | ケシロヨメナ | Aster ageratoides Turcz. var. intermedius (Soejima) Mot.Ito et Soejima | |
| ケスエコザサ | ケスエコザサ | Sasaella atamiana (Nakai) Sad.Suzuki var. kanayamensis (Nakai) Sad.Suzuki | |
| ケスズ | ケスズ | Sasamorpha mollis Nakai | |
| ケツルマサキ | ケツルマサキ | Euonymus fortunei (Turcz.) Hand.-Mazz. var. villosus (Nakai) H.Hara | |
| ケナガエサカキ | ケナガエサカキ | Adinandra yaeyamensis Ohwi | |
| ケナシカシダザサ | ケナシカシダザサ | Neosasamorpha oshidensis (Makino et Uchida) Tatew. subsp. glabra (Koidz.) Sad.Suzuki | |
| ケナシツルモウリンカ | ケナシツルモウリンカ | Tylophora tanakae Maxim. var. glabrescens Hatus. ex T.Yamaz. | |
| ケナシハイチゴザサ | ケナシハイチゴザサ | Isachne lutchuensis Hatus. et T.Koyama | |
| ケナシミヤマカンスゲ | ケナシミヤマカンスゲ | Carex multifolia Ohwi var. glaberrima Ohwi | |
| ケハギ | ケハギ | Lespedeza patens Nakai | |
| ケヒエスゲ | ケヒエスゲ | Carex mayebarana Ohwi | |
| ケマキヤマザサ | ケマキヤマザサ | Sasa maculata Nakai var. abei Sad.Suzuki | |
| ケミヤコザサ | ケミヤコザサ | Sasa samaniana Nakai var. villosa (Makino et Nakai) Sad.Suzuki | |
| ケミヤマナミキ | ケミヤマナミキ | Scutellaria shikokiana Makino var. pubicaulis (Ohwi) Kitam. | |
| ケラマツツジ | ケラマツツジ | Rhododendron scabrum G.Don var. scabrum | |
| ゲンカイヤブマオ | ゲンカイヤブマオ | Boehmeria nakashimae Yahara | |
| ケンサキタンポポ | ケンサキタンポポ | Taraxacum ceratolepis Kitam. | |
| コアジサイ | コアジサイ | Hydrangea hirta (Thunb.) Siebold et Zucc. | |
| コアブラツツジ | コアブラツツジ | Enkianthus nudipes (Honda) Ohwi | |
| コイトスゲ | コイトスゲ | Carex sachalinensis F.Schmidt var. iwakiana Ohwi | |
| コイブキアザミ | コイブキアザミ | Cirsium confertissimum Nakai | |
| コイワカンスゲ | コイワカンスゲ | Carex chrysolepis Franch. et Sav. | |
| コイワザクラ | コイワザクラ | Primula reinii Franch. et Sav. var. reinii | |
| コウシュウシロミモジゴケ | コウシュウシロミモジゴケ | Graphis kousyuensis (Horik. & M.Nakan.) L?cking | 地衣類 |
| コウシュウヒゴタイ | コウシュウヒゴタイ | Saussurea amabilis Kitam. | |
| コウシンソウ | コウシンソウ | Pinguicula ramosa Miyoshi | |
| コウシンヒゴタイ | コウシンヒゴタイ | Saussurea pseudosagitta Honda | |
| コウシンヤマハッカ | コウシンヤマハッカ | Rabdosia umbrosa (Maxim.) H.Hara var. latifolia (Okuyama) H.Hara | |
| コウスユキソウ | コウスユキソウ | Leontopodium japonicum Miq. var. spathulatum (Kitam.) Murata | |
| コウツギ | コウツギ | Deutzia floribunda Nakai | |
| コウヅシマクラマゴケ | コウヅシマクラマゴケ | Selaginella doederleinii Hieron. var. opaca Seriz. | |
| コウモリソウ | コウモリソウ | Parasenecio maximowiczianus (Nakai et F.Maek. ex H.Hara) H.Koyama var. maximowiczianus | |
| コウヤカンアオイ | コウヤカンアオイ | Asarum kooyanum Makino | |
| コウヤグミ | コウヤグミ | Elaeagnus numajiriana Makino | |
| コウヤサルオガセ | コウヤサルオガセ | Usnea koyana Asahina | 地衣類 |
| コウヤシロカネソウ | コウヤシロカネソウ | Dichocarpum numajirianum (Makino) W.T.Wang et P.K.Hsiao | |
| コウヤハナゴケ | コウヤハナゴケ | Cladonia koya?nsis Asahina | 地衣類 |
| コウヤハリスゲ | コウヤハリスゲ | Carex koyaensis J.Oda et Nagam. var. koyaensis | |
| コウヤハンショウヅル | コウヤハンショウヅル | Clematis obvallata (Ohwi) Tamura var. obvallata | |
| コウヤボウキ | コウヤボウキ | Pertya scandens (Thunb.) Sch.Bip. | |
| コウヤマキ | コウヤマキ | Sciadopitys verticillata (Thunb.) Siebold et Zucc. | |
| コウラボシ | コウラボシ | Lepisorus uchiyamae (Makino) H.Itô | シダ植物 |
| コガクウツギ | コガクウツギ | Hydrangea luteovenosa Koidz. var. luteovenosa | |
| コガシアズマザサ | コガシアズマザサ | Sasaella kogasensis (Nakai) Nakai ex Koidz. var. kogasensis | |
| コガシザサ | コガシザサ | Sasa kogasensis Nakai var. kogasensis | |
| コガネサイコ | コガネサイコ | Bupleurum longiradiatum Turcz. var. shikotanense (M.Hiroe) Ohwi | |
| コカンスゲ | コカンスゲ | Carex reinii Franch. et Sav. | |
| コキクザキイチゲ | コキクザキイチゲ | Anemone pseudoaltaica H.Hara var. gracilis (H.Hara) H.Ohba | |
| コキンモウイノデ | コキンモウイノデ | Ctenitis microlepigera (Nakai) Ching | シダ植物 |
| コクワガタ | コクワガタ | Veronica miqueliana Nakai var. takedana (Makino) Nemoto | |
| コケコゴメグサ | コケコゴメグサ | Euphrasia kisoalpina Hid.Takah. et Ohba | |
| コケスミレ | コケスミレ | Viola verecunda A.Gray var. yakushimana (Nakai) Ohwi | |
| コケタンポポ | コケタンポポ | Solenogyne mikadoi Koidz. | |
| コゲチャマルゴケ | コゲチャマルゴケ | Porina tosaensis H.Harada | 地衣類 |
| コケトウバナ | コケトウバナ | Clinopodium multicaule (Maxim.) Kuntze var. minimum (H.Hara) Ohwi | |
| コケハイホラゴケ | コケハイホラゴケ | Vandenboschia subclathrata K.Iwats. | シダ植物 |
| コケハリガネスゲ | コケハリガネスゲ | Carex koyaensis J.Oda et Nagam. var. yakushimensis Katsuy. | |
| コゴメカラマツ | コゴメカラマツ | Thalictrum microspermum Ohwi | |
| コゴメヒョウタンボク | コゴメヒョウタンボク | Lonicera linderifolia Maxim. var. konoi (Makino) Okuyama | |
| コゴメヤナギ | コゴメヤナギ | Salix jessoensis Seemen subsp. serissifolia (Kimura) H.Ohashi | |
| コザネゴケ | コザネゴケ | Distopyrenis japonica H.Harada | 地衣類 |
| コザラゴケモドキ | コザラゴケモドキ | Gyalidea pacifica H.Harada & V?zda | 地衣類 |
| コザラゴケモドキ | コザラゴケモドキ | Gyalideopsis chibaensis H.Harada | 地衣類 |
| コシアブラ | コシアブラ | Eleutherococcus sciadophylloides (Franch. et Sav.) H.Ohashi | |
| コシガヤホシクサ | コシガヤホシクサ | Eriocaulon heleocharioides Satake | |
| コシキイトラッキョウ | コシキイトラッキョウ | Allium virgunculae F.Maek. et Kitam. var. koshikiense M.Hotta et Hir.Takah. | |
| コシジシモツケソウ | コシジシモツケソウ | Filipendula auriculata (Ohwi) Kitam. | |
| コシジタネツケバナ | コシジタネツケバナ | Cardamine niigatensis H.Hara | |
| コシジタビラコ | コシジタビラコ | Trigonotis coronata Ohwi | |
| コシノカンアオイ | コシノカンアオイ | Asarum megacalyx (F.Maek.) T.Sugaw. | |
| コシノコバイモ | コシノコバイモ | Fritillaria koidzumiana Ohwi | |
| コシノサトメシダ | コシノサトメシダ | Athyrium neglectum Seriz. subsp. neglectum | シダ植物 |
| コシノチャルメルソウ | コシノチャルメルソウ | Mitella koshiensis Ohwi | |
| コシノネズミガヤ | コシノネズミガヤ | Muhlenbergia curviaristata (Ohwi) Ohwi var. curviaristata | |
| コショウジョウバカマ | コショウジョウバカマ | Heloniopsis kawanoi (Koidz.) Honda | |
| コスギイタチシダ | コスギイタチシダ | Dryopteris yakusilvicola Sa.Kurata | シダ植物 |
| コセリバオウレン | コセリバオウレン | Coptis japonica (Thunb.) Makino var. japonica | |
| コダチボタンボウフウ | コダチボタンボウフウ | Peucedanum japonicum Thunb. var. latifolium M.Hotta et Shiuchi | |
| コタヌキラン | コタヌキラン | Carex doenitzii Boeck. var. doenitzii | |
| コチャルメルソウ | コチャルメルソウ | Mitella pauciflora Rosend. | |
| コツゲ | コツゲ | Buxus microphylla Siebold et Zucc. var. riparia (Makino) Makino | |
| コツブセンニンゴケ | コツブセンニンゴケ | Baeomyces aggregatus Asahina | 地衣類 |
| コツブセンニンゴケ | コツブセンニンゴケ | Biatorella improvisula (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| コツブセンニンゴケ | コツブセンニンゴケ | Biatorella praenotata (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| コツブヌマハリイ | コツブヌマハリイ | Eleocharis parvinux Ohwi | |
| コテリハキンバイ | コテリハキンバイ | Potentilla riparia Murata var. miyajimensis Naruh. | |
| コナアナイボゴケ | コナアナイボゴケ | Verrucaria craterigera H.Harada | 地衣類 |
| コナアナイボゴケ | コナアナイボゴケ | Verrucaria glaucinodes Nyl. | 地衣類 |
| コナアナイボゴケ | コナアナイボゴケ | Verrucaria halochlora H.Harada | 地衣類 |
| コナイボゴケ | コナイボゴケ | Lecanora pulverulenta M?ll.Arg. | 地衣類 |
| コナイボゴケ | コナイボゴケ | Lecanora rikuzensis R?s?nen | 地衣類 |
| コナイボゴケ | コナイボゴケ | Lecanora subcinctula Nyl. | 地衣類 |
| コナサビイボゴケ | コナサビイボゴケ | Brigantiaea sorediata Kashiw. et al. | 地衣類 |
| コナハマチャシブゴケ | コナハマチャシブゴケ | Lecanora kurokawae Shiba et al. | 地衣類 |
| コナユキゴケ | コナユキゴケ | Sporodophoron gossypinum Frisch et al. | 地衣類 |
| コバイケイソウ | コバイケイソウ | Veratrum stamineum Maxim. var. stamineum | |
| コバイモ | コバイモ | Fritillaria japonica Miq. | |
| コハウチワカエデ | コハウチワカエデ | Acer sieboldianum Miq. | |
| コバケイスゲ | コバケイスゲ | Carex tenuior T.Koyama et Chuang | |
| コバトベラ | コバトベラ | Pittosporum parvifolium Hayata var. parvifolium | |
| コバナアザミ | コバナアザミ | Cirsium boreale Kitam. | |
| コバナナベワリ | コバナナベワリ | Croomia saitoana Kadota | |
| コバナノガリヤス | コバナノガリヤス | Calamagrostis adpressiramea Ohwi | |
| コバナノコウモリ | コバナノコウモリ | Parasenecio chokaiensis (Kudô) Kadota | |
| コバノイチヤクソウ | コバノイチヤクソウ | Pyrola alpina Andres | |
| コバノカモメヅル | コバノカモメヅル | Cynanchum sublanceolatum (Miq.) Matsum. var. sublanceolatum | |
| コバノカワズゴケ | コバノカワズゴケ | Lobaria angustifolia (Asahina) Yoshim. | 地衣類 |
| コバノクロウメモドキ | コバノクロウメモドキ | Rhamnus japonica Maxim. var. microphylla H.Hara | |
| コバノクロヅル | コバノクロヅル | Tripterygium doianum Ohwi | |
| コバノコアカソ | コバノコアカソ | Boehmeria spicata (Thunb.) Thunb. var. microphylla Nakai ex Satake | |
| コバノコゴメグサ | コバノコゴメグサ | Euphrasia matsumurae Nakai | |
| コバノタツナミ | コバノタツナミ | Scutellaria indica L. var. parvifolia (Makino) Makino | |
| コバノハナイカダ | コバノハナイカダ | Helwingia japonica (Thunb.) F.Dietr. subsp. japonica var. parvifolia Makino | |
| コバノミツバツツジ | コバノミツバツツジ | Rhododendron reticulatum D.Don ex G.Don | |
| コバノミドリゴケ | コバノミドリゴケ | Endocarpon neopallidulum H.Harada | 地衣類 |
| コバノミヤマノボタン | コバノミヤマノボタン | Bredia okinawensis (Matsum.) H.L.Li | |
| コバノヤスデゴケモドキ | コバノヤスデゴケモドキ | Phylliscum microphyllum Asahina | 地衣類 |
| コハマギク | コハマギク | Chrysanthemum arcticum L. subsp. maekawanum Kitam. | |
| コバンノキ | コバンノキ | Phyllanthus flexuosus (Siebold et Zucc.) Müll.Arg. | |
| コビトホラシノブ | コビトホラシノブ | Sphenomeris minutula Sa.Kurata | シダ植物 |
| コビトホラシノブ | コビトホラシノブ | Odontosoria minutula (Sa.Kurata) Ebihara | シダ植物 |
| コヒナリンドウ | コヒナリンドウ | Gentiana laeviuscula Toyok. | |
| コヒメリボンゴケ | コヒメリボンゴケ | Hypogymnia fujisanensis (Asahina) Kurok. | 地衣類 |
| コヒロハシケシダ | コヒロハシケシダ | Deparia pseudoconilii (Seriz.) Seriz. var. subdeltoidofrons (Seriz.) Seriz. | シダ植物 |
| コブガシ | コブガシ | Machilus kobu Maxim. | |
| コフキザクロゴケ | コフキザクロゴケ | Loxospora glaucomiza (Nyl.) Kalb & Staiger | 地衣類 |
| コフキモジゴケ | コフキモジゴケ | Phaeographis pruinosa M.Nakan. | 地衣類 |
| コブシモドキ | コブシモドキ | Magnolia pseudokobus C.Abe et Akasawa | |
| ゴフンゴケ | ゴフンゴケ | Herpothallon japonicum (Zahlbr.) G.Thor | 地衣類 |
| コヘラナレン | コヘラナレン | Crepidiastrum grandicollum (Koidz.) Nakai | |
| コボタンヅル | コボタンヅル | Clematis apiifolia DC. var. biternata Makino | |
| コマイワヤナギ | コマイワヤナギ | Salix rupifraga Koidz. | |
| コマガタケスグリ | コマガタケスグリ | Ribes japonicum Maxim. | |
| ゴマキ | ゴマキ | Viburnum sieboldii Miq. var. sieboldii | |
| ゴマゴケ（ヤマトホシゴケモドキ） | ゴマゴケ（ヤマトホシゴケモドキ） | Arthopyrenia japonica Vain. | 地衣類 |
| コマツカサススキ | コマツカサススキ | Scirpus fuirenoides Maxim. | |
| ゴマナ | ゴマナ | Aster glehnii F.Schmidt var. hondoensis Kitam. | |
| コマヤマハッカ | コマヤマハッカ | Rabdosia umbrosa (Maxim.) H.Hara var. komaensis (Okuyama) H.Hara | |
| コミダケシダ | コミダケシダ | Ctenitis iriomotensis (H.Itô) Nakaike | シダ植物 |
| コミドリゴケ | コミドリゴケ | Endocarpon minutum H.Harada | 地衣類 |
| コミネカエデ | コミネカエデ | Acer micranthum Siebold et Zucc. | |
| コミノヒメウツギ | コミノヒメウツギ | Deutzia hatusimae H.Ohba, L.M.Niu et Minamit. | |
| コミヤマカンスゲ | コミヤマカンスゲ | Carex multifolia Ohwi var. toriiana T.Koyama | |
| コミヤマスミレ | コミヤマスミレ | Viola maximowicziana Makino | |
| コメツガ | コメツガ | Tsuga diversifolia (Maxim.) Mast. | |
| ゴモジュ | ゴモジュ | Viburnum suspensum Lindl. | |
| コモチウラミゴケ | コモチウラミゴケ | Nephroma squamigerum Inumaru | 地衣類 |
| コモチミミコウモリ | コモチミミコウモリ | Parasenecio auriculatus (DC.) J.R.Grant var. bulbifer (Koidz.) H.Koyama | |
| コモチレンゲ | コモチレンゲ | Orostachys boehmeri (Makino) H.Hara | |
| コモノギク | コモノギク | Aster komonoensis Makino | |
| コヤクシマショウマ | コヤクシマショウマ | Astilbe glaberrima Nakai var. saxatilis (Nakai) H.Ohba | |
| コヤブデマリ | コヤブデマリ | Viburnum plicatum Thunb. var. parvifolium Miq. | |
| ゴヨウザンヨウラク | ゴヨウザンヨウラク | Menziesia goyozanensis M.Kikuchi | |
| ゴンゲンチャシブゴケ | ゴンゲンチャシブゴケ | Lecanora gongensiana H.Miyawaki | 地衣類 |
| コンゴウダケ | コンゴウダケ | Pleioblastus kongosanensis Makino | |
| サイカイツツジ | サイカイツツジ | Rhododendron kaempferi Planch. var. saikaiense (T.Yamaz.) T.Yamaz. | |
| サイコクイカリソウ | サイコクイカリソウ | Epimedium diphyllum (C.Morren et Decne.) Lodd. var. kitamuranum (T.Yamanaka) K.Suzuki | |
| サイゴクイボタ | サイゴクイボタ | Ligustrum ibota Siebold | |
| サイゴクザサ | サイゴクザサ | Sasa occidentalis Sad.Suzuki | |
| サイコクサバノオ | サイコクサバノオ | Dichocarpum univalve (Ohwi) Tamura et Lauener | |
| サイゴクタテゴケ | サイゴクタテゴケ | Psora rubiformella (Zahlbr.) Gotth.Schneid. | 地衣類 |
| サイゴクハマイボゴケ | サイゴクハマイボゴケ | Verrucaria praeviella H.Harada | 地衣類 |
| サイゴクミツバツツジ | サイゴクミツバツツジ | Rhododendron nudipes Nakai var. nudipes | |
| サイヨウザサ | サイヨウザサ | Neosasamorpha stenophylla (Koidz.) Sad.Suzuki subsp. stenophylla | |
| ザオウアザミ | ザオウアザミ | Cirsium zawoense Kadota | |
| サカバサトメシダ | サカバサトメシダ | Athyrium palustre Seriz. | |
| サガミジョウロウホトトギス | サガミジョウロウホトトギス | Tricyrtis ishiiana (Kitag. et T.Koyama) Ohwi et Okuyama var. ishiiana | |
| サガミラン | サガミラン | Cymbidium nipponicum (Franch. et Sav.) Rolfe | |
| サカワサイシン | サカワサイシン | Asarum sakawanum Makino | |
| サキシマスケロクラン | サキシマスケロクラン | Lecanorchis flavicans Fukuy. | |
| サキシマツツジ | サキシマツツジ | Rhododendron amanoi Ohwi | |
| サキシマヒサカキ | サキシマヒサカキ | Eurya sakishimensis Hatus. | |
| サキシマフヨウ | サキシマフヨウ | Hibiscus makinoi Jotani et H.Ohba | |
| サキモリイヌワラビ | サキモリイヌワラビ | Athyrium oblitescens Sa.Kurata | シダ植物 |
| サクノキ | サクノキ | Meliosma arnottiana (Wight) Walp. subsp. oldhamii (Maxim.) H.Ohba var. hachijoensis (Nakai) H.Ohba | |
| サクユリ | サクユリ | Lilium auratum Lindl. var. platyphyllum Baker | |
| サクラガンピ | サクラガンピ | Diplomorpha pauciflora (Franch. et Sav.) Nakai | |
| サクラジマハナヤスリ | サクラジマハナヤスリ | Ophioglossum kawamurae Tagawa | シダ植物 |
| サクラツツジ | サクラツツジ | Rhododendron tashiroi Maxim. var. tashiroi | |
| サケバヒヨドリ | サケバヒヨドリ | Eupatorium laciniatum Kitam. | |
| ササクレアワビゴケ | ササクレアワビゴケ | Tuckermannopsis microphyllica (W.L.Culb. & C.F.Culb.) M.J.Lai | 地衣類 |
| ササノハスゲ | ササノハスゲ | Carex pachygyna Franch. et Sav. | |
| ササユリ | ササユリ | Lilium japonicum Houtt. var. japonicum | |
| ササラゴケ | ササラゴケ | Cladonia substrepsilis Sandst. ex Zahlbr. | 地衣類 |
| サザンカ | サザンカ | Camellia sasanqua Thunb. | |
| サツキ | サツキ | Rhododendron indicum (L.) Sweet | |
| サツキヒナノウスツボ | サツキヒナノウスツボ | Scrophularia musashiensis Bonati var. musashiensis | |
| サツマアオイ | サツマアオイ | Asarum satsumense F.Maek. | |
| サツマイワノリ（ツクシイワノリ） | サツマイワノリ（ツクシイワノリ） | Collema shiroumanum var. kiusianum (Asahina) Degel. var. kiusianum (Asahina) Degel. | 地衣類 |
| サツマオモト | サツマオモト | Rohdea japonica (Thunb.) Roth var. latifolia Hatus. | |
| サツマシロギク | サツマシロギク | Aster satsumensis Soejima | |
| サツマネコノメ | サツマネコノメ | Chrysosplenium macrostemon Maxim. var. viridescens (Sutô) H.Hara | |
| サツマノギク | サツマノギク | Chrysanthemum ornatum Hemsl. | |
| サツマハギ | サツマハギ | Lespedeza formosa (Vogel) Koehne subsp. velutina (Nakai) S.Akiyama et H.Ohba var. satsumensis (Nakai) S.Akiyama et H.Ohba | |
| サツマハチジョウシダ | サツマハチジョウシダ | Pteris satsumana Sa.Kurata | シダ植物 |
| サツマビャクゼン | サツマビャクゼン | Cynanchum doianum Koidz. | |
| サツマホトトギス | サツマホトトギス | Tricyrtis hirta (Thunb.) Hook. var. masamunei (Makino) Masam. | |
| サツママアザミ | サツママアザミ | Cirsium austrokiushianum Kitam. | |
| サツママンネングサ | サツママンネングサ | Sedum satumense Hatus. | |
| サドクルマユリ | サドクルマユリ | Lilium medeoloides A.Gray var. sadoinsulare (Masam. et Satomi) Masam. et Satomi | |
| サドザサ | サドザサ | Sasaella sadoensis (Nakai) Sad.Suzuki | |
| サトヤマハリスゲ | サトヤマハリスゲ | Carex ruralis J.Oda et Nagam. | |
| サバノオ | サバノオ | Dichocarpum dicarpon (Miq.) W.T.Wang et P.K.Hsiao | |
| サビバナナカマド | サビバナナカマド | Sorbus commixta Hedl. var. rufoferruginea C.K.Schneid. | |
| サマニオトギリ | サマニオトギリ | Hypericum nakaii H.Koidz. subsp. nakaii | |
| サマニユキワリ | サマニユキワリ | Primula farinosa L. subsp. modesta (Bisset et S.Moore) Pax var. samanimontana Tatew. | |
| サヤマスゲ | サヤマスゲ | Carex hashimotoi Ohwi | |
| サラサドウダン | サラサドウダン | Enkianthus campanulatus (Miq.) G.Nicholson var. campanulatus | |
| ザラツキギボウシ | ザラツキギボウシ | Hosta kikutii F.Maek. var. scabrinervia N.Fujita et M.N.Tamura | |
| ザラツキヒナガリヤス | ザラツキヒナガリヤス | Calamagrostis nana Takeda subsp. hayachinensis (Ohwi) Tateoka | |
| サルクラハンノキ | サルクラハンノキ | Alnus hakkodensis Hayashi | |
| サワアザミ | サワアザミ | Cirsium yezoense (Maxim.) Makino | |
| サワオグルマ | サワオグルマ | Tephroseris pierotii (Miq.) Holub | |
| サワオトギリ | サワオトギリ | Hypericum pseudopetiolatum R.Keller | |
| サワギク | サワギク | Nemosenecio nikoensis (Miq.) B.Nord. | |
| サワシロギク | サワシロギク | Aster rugulosus Maxim. var. rugulosus | |
| サワダツ | サワダツ | Euonymus melananthus Franch. et Sav. | |
| サワノミドリゴケ | サワノミドリゴケ | Endocarpon japonicum H.Harada | 地衣類 |
| サワハコベ | サワハコベ | Stellaria diversiflora Maxim. var. diversiflora | |
| サワマンジュウゴケ | サワマンジュウゴケ | Strigula aquatica H.Harada | 地衣類 |
| サワラ | サワラ | Chamaecyparis pisifera (Siebold et Zucc.) Endl. | |
| サワルリソウ | サワルリソウ | Ancistrocarya japonica Maxim. | |
| サンインクワガタ | サンインクワガタ | Veronica muratae T.Yamaz. | |
| サンインシロカネソウ | サンインシロカネソウ | Dichocarpum sarmentosum (Ohwi) Murata | |
| サンイントラノオ | サンイントラノオ | Pseudolysimachion ogurae T.Yamaz. | |
| サンインヒエスゲ | サンインヒエスゲ | Carex jubozanensis J.Oda et A.Tanaka | |
| サンインヒキオコシ | サンインヒキオコシ | Rabdosia shikokiana (Makino) H.Hara var. occidentalis (Murata) H.Hara | |
| サンコカンアオイ | サンコカンアオイ | Asarum trigynum (F.Maek.) Araki | |
| サンショウバラ | サンショウバラ | Rosa hirtula (Regel) Nakai | |
| サンプクリンドウ | サンプクリンドウ | Comastoma sectum (Satake) Holub. | |
| サンベサワアザミ | サンベサワアザミ | Cirsium tenuisquamatum Kitam. | |
| サンヨウアオイ | サンヨウアオイ | Asarum hexalobum F.Maek. var. hexalobum | |
| サンヨウブシ | サンヨウブシ | Aconitum sanyoense Nakai | |
| サンリクハマイボゴケ | サンリクハマイボゴケ | Verrucaria sanriku?nsis H.Harada | 地衣類 |
| シイバサトメシダ | シイバサトメシダ | Athyrium neglectum Seriz. subsp. australe Seriz. | シダ植物 |
| シオカゼオトギリ | シオカゼオトギリ | Hypericum iwatelittorale H.Koidz. | |
| シオギク | シオギク | Chrysanthemum shiwogiku Kitam. var. shiwogiku | |
| シオジ | シオジ | Fraxinus spaethiana Lingelsh. | |
| シオバラザサ | シオバラザサ | Sasaella shiobarensis (Nakai) Nakai ex Koidz. var. shiobarensis | |
| シオマンジュウゴケ | シオマンジュウゴケ | Strigula maritima H.Harada | 地衣類 |
| シオミイカリソウ | シオミイカリソウ | Epimedium trifoliatobinatum (Koidz.) Koidz. var. maritimum (K.Suzuki) K.Suzuki | |
| シギンカラマツ | シギンカラマツ | Thalictrum actaeifolium Siebold et Zucc. var. actaeifolium | |
| シコクイチゲ | シコクイチゲ | Anemone sikokiana (Makino) Makino | |
| シコクエビラフジ | シコクエビラフジ | Vicia venosa (Willd. ex Link) Maxim. subsp. yamanakae (Y.Endo et H.Ohashi) Y.Endo et H.Ohashi | |
| シコクカッコソウ | シコクカッコソウ | Primula kisoana Miq. var. shikokiana Makino | |
| シコクギボウシ | シコクギボウシ | Hosta shikokiana N.Fujita | |
| シコクザサ | シコクザサ | Sasa hayatae Makino var. hirtella (Nakai) Sad.Suzuki | |
| シコクシモツケソウ | シコクシモツケソウ | Filipendula tsuguwoi Ohwi | |
| シコクショウマ | シコクショウマ | Astilbe shikokiana Nakai var. shikokiana | |
| シコクシラベ | シコクシラベ | Abies shikokiana Nakai | |
| シコクシロギク | シコクシロギク | Aster yoshinaganus (Kitam.) Mot.Ito et Soejima | |
| シコクスミレ | シコクスミレ | Viola shikokiana Makino | |
| シコクチャルメルソウ | シコクチャルメルソウ | Mitella stylosa H.Boissieu var. makinoi (H.Hara) Wakab. | |
| シコクテンナンショウ | シコクテンナンショウ | Arisaema iyoanum Makino subsp. nakaianum (Kitag. et Ohba) H.Ohashi et J.Murata | |
| シコクノガリヤス | シコクノガリヤス | Calamagrostis tashiroi Ohwi subsp. sikokiana (Ohwi) Tateoka | |
| シコクバイカオウレン | シコクバイカオウレン | Coptis quinquefolia Miq. var. shikokumontana Kadota | |
| シコクハナゴケ | シコクハナゴケ | Cladonia shikokiana Asahina | 地衣類 |
| シコクハンショウヅル | シコクハンショウヅル | Clematis obvallata (Ohwi) Tamura var. shikokiana Tamura | |
| シコクヒロハテンナンショウ | シコクヒロハテンナンショウ | Arisaema longipedunculatum M.Hotta | |
| シコクフクジュソウ | シコクフクジュソウ | Adonis shikokuensis Nishikawa et Koji Ito | |
| シコクブシ | シコクブシ | Aconitum grossedentatum (Nakai) Nakai var. sikokianum (Nakai) Nakai ex Tamura et Namba | |
| シコクママコナ | シコクママコナ | Melampyrum laxum Miq. var. laxum | |
| シコタンタンポポ | シコタンタンポポ | Taraxacum shikotanense Kitam. | |
| シコタントリカブト | シコタントリカブト | Aconitum maximum Pall. ex DC. subsp. kurilense (Takeda) Kadota | |
| シシウド | シシウド | Angelica pubescens Maxim. var. pubescens | |
| シシガシラ | シシガシラ | Blechnum niponicum (Kunze) Makino | シダ植物 |
| シジキカンアオイ | シジキカンアオイ | Asarum hexalobum F.Maek. var. controversum Hatus. et Yamahata | |
| ジゾウカンバ | ジゾウカンバ | Betula globispica Shirai | |
| シソバキスミレ | シソバキスミレ | Viola brevistipulata (Franch. et Sav.) W.Becker var. crassifolia (Koidz.) F.Maek. ex S.Akiyama, H.Ohba et Tabuchi | |
| シソバタツナミ | シソバタツナミ | Scutellaria laeteviolacea Koidz. var. laeteviolacea | |
| シチトウエビヅル | シチトウエビヅル | Vitis ficifolia Bunge var. izuinsularis (Tuyama) H.Hara | |
| シチトウスミレ | シチトウスミレ | Viola grypoceras A.Gray var. hichitoana (Nakai) F.Maek. | |
| シチトウタラノキ | シチトウタラノキ | Aralia ryukyuensis (J.Wen) T.Yamaz. var. inermis (Yanagita) T.Yamaz. | |
| シチトウハナワラビ | シチトウハナワラビ | Botrychium atrovirens (Sahashi) M.Kato | |
| シチョウゲ | シチョウゲ | Leptodermis pulchella Yatabe | |
| シデコブシ | シデコブシ | Magnolia stellata (Siebold et Zucc.) Maxim. | |
| シテンクモキリ | シテンクモキリ | Liparis purpureovittata Tsutsumi, T.Yukawa et M.Kato | |
| シドキヤマアザミ | シドキヤマアザミ | Cirsium shidokimontanum Kadota | |
| シナノアキギリ | シナノアキギリ | Salvia koyamae Makino | |
| シナノオトギリ | シナノオトギリ | Hypericum senanense Maxim. subsp. senanense | |
| シナノカリヤスモドキ | シナノカリヤスモドキ | Miscanthus oligostachyus Stapf var. shinanoensis Y.N.Lee | |
| シナノキンバイソウ | シナノキンバイソウ | Trollius japonicus Miq. | |
| シナノコザクラ | シナノコザクラ | Primula tosaensis Yatabe var. brachycarpa (H.Hara) Ohwi | |
| シナノショウキラン | シナノショウキラン | Yoania flava K.Inoue et T.Yukawa | |
| シナノタイゲキ | シナノタイゲキ | Euphorbia sinanensis (Hurus.) T.Kuros. et H.Ohashi | |
| シナノタンポポ | シナノタンポポ | Taraxacum hondoense Nakai ex Koidz. | |
| シナノトウヒレン | シナノトウヒレン | Saussurea tobitae Kitam. | |
| シナノナデシコ | シナノナデシコ | Dianthus shinanensis (Yatabe) Makino | |
| シナノノダケ | シナノノダケ | Angelica sinanomontana Kitag. | |
| シナノヒメクワガタ | シナノヒメクワガタ | Veronica nipponica Makino ex Furumi var. sinanoalpina H.Hara | |
| シノノメソウ | シノノメソウ | Swertia swertopsis Makino | |
| シノブホングウシダ | シノブホングウシダ | Lindsaea kawabatae Sa.Kurata | |
| シバニッケイ | シバニッケイ | Cinnamomum doederleinii Engl. var. doederleinii | |
| シバヤナギ | シバヤナギ | Salix japonica Thunb. | |
| シビイタチシダ | シビイタチシダ | Dryopteris shibipedis Sa.Kurata | シダ植物 |
| シビイヌワラビ | シビイヌワラビ | Athyrium kenzo-satakei Sa.Kurata | |
| シブカワシロギク | シブカワシロギク | Aster rugulosus Maxim. var. shibukawaensis Kitam. et Murata | |
| シブカワツツジ | シブカワツツジ | Rhododendron sanctum Nakai var. lasiogynum Nakai ex H.Hara | |
| シブカワニンジン | シブカワニンジン | Codonopsis lanceolata (Siebold et Zucc.) Trautv. var. omurae T.Koyama | |
| シブツアサツキ | シブツアサツキ | Allium schoenoprasum L. var. shibutuense Kitam. | |
| シブヤザサ | シブヤザサ | Pleioblastus shibuyanus Makino ex Nakai | |
| シマアケボノソウ | シマアケボノソウ | Swertia makinoana F.Maek. | |
| シマアザミ | シマアザミ | Cirsium brevicaule A.Gray | |
| シマイガクサ | シマイガクサ | Rhynchospora boninensis Nakai ex Tuyama | |
| シマイスノキ | シマイスノキ | Distylium lepidotum Nakai | |
| シマイソスゲ | シマイソスゲ | Carex boninensis Koidz. | |
| シマウチワドコロ | シマウチワドコロ | Dioscorea septemloba Thunb. var. sititoana (Honda et Jotani) Ohwi | |
| シマウツボ | シマウツボ | Orobanche boninsimae (Maxim.) Tuyama | |
| シマウリカエデ | シマウリカエデ | Acer insulare Makino | |
| シマエンジュ | シマエンジュ | Maackia tashiroi (Yatabe) Makino | |
| シマカコソウ | シマカコソウ | Ajuga boninsimae Maxim. | |
| シマカナメモチ | シマカナメモチ | Photinia wrightiana Maxim. | |
| シマガマズミ | シマガマズミ | Viburnum brachyandrum Nakai | |
| シマカモノハシ | シマカモノハシ | Ischaemum ischaemoides (Hook. et Arn.) Nakai | |
| シマギョクシンカ | シマギョクシンカ | Tarenna subsessilis (A.Gray) T.Itô | |
| シマキンレイカ | シマキンレイカ | Patrinia triloba (Miq.) Miq. var. kozushimensis Honda | |
| シマクジャク | シマクジャク | Diplazium longicarpum Kodama | シダ植物 |
| シマクマタケラン | シマクマタケラン | Alpinia boninsimensis Makino | |
| シマクモキリソウ | シマクモキリソウ | Liparis hostifolia (Koidz.) Koidz. ex Nakai | |
| シマコウヤボウキ | シマコウヤボウキ | Pertya yakushimensis H.Koyama et Nagam. | |
| シマコガネギク | シマコガネギク | Solidago virgaurea L. subsp. asiatica (Nakai ex H.Hara) Kitam. ex H.Hara var. insularis (Kitam.) H.Hara | |
| シマコゴメウツギ | シマコゴメウツギ | Stephanandra incisa (Thunb.) Zabel var. macrophylla Hid.Takah. | |
| シマゴショウ | シマゴショウ | Peperomia boninsimensis Makino | |
| シマザクラ | シマザクラ | Hedyotis grayi Hook.f. | |
| シマサクラガンピ | シマサクラガンピ | Diplomorpha yakushimensis (Makino) Masam. | |
| シマジタムラソウ | シマジタムラソウ | Salvia isensis Nakai ex H.Hara | |
| シマソケイ | シマソケイ | Neisosperma iwasakianum (Koidz.) Fosberg et Sachet | |
| シマタイミンタチバナ | シマタイミンタチバナ | Myrsine maximowiczii (Koidz.) E.Walker | |
| シマタヌキラン | シマタヌキラン | Carex doenitzii Boeck. var. okuboi (Franch.) Kük. ex Matsum. | |
| シマチカラシバ | シマチカラシバ | Pennisetum sordidum Koidz. | |
| シマチャシブゴケ | シマチャシブゴケ | Lecanora mikuraensis H.Miyawaki | 地衣類 |
| シマチャシブゴケ | シマチャシブゴケ | Lecanora perconcinna Hue | 地衣類 |
| シマツレサギソウ | シマツレサギソウ | Platanthera boninensis Koidz. | |
| シマテンナンショウ | シマテンナンショウ | Arisaema negishii Makino | |
| シマトウヒレン | シマトウヒレン | Saussurea insularis Kitam. | |
| シマノガリヤス | シマノガリヤス | Calamagrostis autumnalis Koidz. subsp. insularis (Honda) Tateoka | |
| シマフジバカマ | シマフジバカマ | Eupatorium luchuense Nakai | |
| シマホザキラン | シマホザキラン | Malaxis boninensis (Koidz.) Nackej. | |
| シマホタルブクロ | シマホタルブクロ | Campanula microdonta Koidz. | |
| シマホルトノキ | シマホルトノキ | Elaeocarpus photiniifolius Hook. et Arn. | |
| シマムカデシダ | シマムカデシダ | Ctenopteris kanashiroi (Hayata) K.Iwats. | シダ植物 |
| シマムカデシダ | シマムカデシダ | Prosaptia kanashiroi (Hayata) Nakai ex Yamam. | シダ植物 |
| シマムラサキ | シマムラサキ | Callicarpa glabra Koidz. | |
| シマムロ | シマムロ | Juniperus taxifolia Hook. et Arn. var. taxifolia | |
| シマモチ | シマモチ | Ilex mertensii Maxim. | |
| シマヤマブキショウマ | シマヤマブキショウマ | Aruncus dioicus (Walter) Fernald var. insularis H.Hara | |
| シモツケコウホネ | シモツケコウホネ | Nuphar submersa Shiga et Kadono | |
| シモツケソウ | シモツケソウ | Filipendula multijuga Maxim. var. multijuga | |
| シモバシラ | シモバシラ | Keiskea japonica Miq. | |
| シャクナンガンピ | シャクナンガンピ | Daphnimorpha kudoi (Makino) Nakai | |
| ジャコウソウ | ジャコウソウ | Chelonopsis moschata Miq. | |
| ジュズネノキ | ジュズネノキ | Damnacanthus macrophyllus Siebold ex Miq. | |
| ジュロウカンアオイ | ジュロウカンアオイ | Asarum kinoshitae (F.Maek.) T.Sugaw. | |
| シュンジュギク | シュンジュギク | Aster savatieri Makino var. pygmaeus Makino | |
| ジョウシュウアズマギク | ジョウシュウアズマギク | Erigeron thunbergii A.Gray subsp. glabratus (A.Gray) H.Hara var. heterotrichus (H.Hara) H.Hara | |
| ジョウシュウオニアザミ | ジョウシュウオニアザミ | Cirsium okamotoi Kitam. | |
| ジョウシュウトリカブト | ジョウシュウトリカブト | Aconitum tonense Nakai | |
| ショウドシマベンケイソウ | ショウドシマベンケイソウ | Hylotelephium verticillatum (L.) H.Ohba var. lithophilos H.Ohba | |
| ショウドシマレンギョウ | ショウドシマレンギョウ | Forsythia togashii H.Hara | |
| ジョウボウザサ | ジョウボウザサ | Sasaella bitchuensis (Makino) Makino ex Koidz. var. bitchuensis | |
| ジョウロウホトトギス | ジョウロウホトトギス | Tricyrtis macrantha Maxim. | |
| シライヤナギ | シライヤナギ | Salix shiraii Seemen | |
| シライワアザミ | シライワアザミ | Cirsium akimotoi Kadota et Masami Saito | |
| シライワコゴメグサ | シライワコゴメグサ | Euphrasia maximowiczii Wettst. var. calcarea T.Yamaz. | |
| シライワシャジン | シライワシャジン | Adenophora teramotoi Hurus. ex T.Yamaz. | |
| シラガシコロゴケ | シラガシコロゴケ | Parmeliella serpentinicola P.M.J?rg. & Kashiw. | 地衣類 |
| シラコスゲ | シラコスゲ | Carex rhizopoda Maxim. | |
| シラシマメダケ | シラシマメダケ | Pleioblastus nabeshimanus Koidz. | |
| シラタマホシクサ | シラタマホシクサ | Eriocaulon nudicuspe Maxim. | |
| シラトリオトギリ | シラトリオトギリ | Hypericum nakaii H.Koidz. subsp. tatewakii (S.Watan.) N.Robson | |
| シラトリシャジン | シラトリシャジン | Adenophora uryuensis Miyabe et Tatew. | |
| シラネアオイ | シラネアオイ | Glaucidium palmatum Siebold et Zucc. | |
| シラネアザミ | シラネアザミ | Saussurea nikoensis Franch. et Sav. | |
| シラビソ | シラビソ | Abies veitchii Lindl. | |
| シレトコスミレ | シレトコスミレ | Viola kitamiana Nakai | |
| シロウマイタチシダ | シロウマイタチシダ | Dryopteris shiroumensis Sa.Kurata et T.Nakam. | シダ植物 |
| シロウマエビラフジ | シロウマエビラフジ | Vicia venosa (Willd. ex Link) Maxim. subsp. cuspidata (Maxim.) Y.Endo et H.Ohashi var. glabristyla Y.Endo et H.Ohashi | |
| シロウマオウギ | シロウマオウギ | Astragalus shiroumensis Makino | |
| シロウマガリヤス | シロウマガリヤス | Calamagrostis fauriei Hack. var. intermedia T.Shimizu | |
| シロウマタンポポ | シロウマタンポポ | Taraxacum alpicola Kitam. var. shiroumense (H.Koidz.) Kitam. | |
| シロウマナズナ | シロウマナズナ | Draba shiroumana Makino | |
| シロウマリンドウ | シロウマリンドウ | Gentianopsis yabei (Takeda et H.Hara) Ma ex Toyok. var. yabei | |
| シロウマレイジンソウ | シロウマレイジンソウ | Aconitum pterocaule Koidz. var. siroumense Kadota | |
| シロエゾホシクサ | シロエゾホシクサ | Eriocaulon pallescens (Nakai ex Miyabe et Kudô) Satake | |
| シロガネガラクサ | シロガネガラクサ | Evolvulus boninensis F.Maek. et Tuyama | |
| シロザネゴケ | シロザネゴケ | Hyalopyrenia japonica H.Harada | 地衣類 |
| シロツボイボゴケ | シロツボイボゴケ | Lecanora coiliodes Vain. | 地衣類 |
| シロツボイボゴケ | シロツボイボゴケ | Lecanora gallifera Vain. | 地衣類 |
| シロテツ | シロテツ | Boninia glabra Planch. | |
| シロドウダン | シロドウダン | Enkianthus cernuus (Siebold et Zucc.) Makino | |
| シロトダシバ | シロトダシバ | Arundinella hirta (Thunb.) Tanaka var. glauca (Koidz.) Honda | |
| シロトベラ | シロトベラ | Pittosporum boninense Koidz. var. boninense | |
| シロバナイナモリソウ | シロバナイナモリソウ | Pseudopyxis heterophylla (Miq.) Maxim. | |
| シロバナカモメヅル | シロバナカモメヅル | Cynanchum sublanceolatum (Miq.) Matsum. var. macranthum (Maxim.) Matsum. | |
| シロバナショウジョウバカマ | シロバナショウジョウバカマ | Heloniopsis orientalis (Thunb.) Tanaka var. flavida (Nakai) Ohwi | |
| シロバナタンポポ | シロバナタンポポ | Taraxacum albidum Dahlst. | |
| シロバナトウウチソウ | シロバナトウウチソウ | Sanguisorba albiflora (Makino) Makino | |
| シロバナネコノメソウ | シロバナネコノメソウ | Chrysosplenium album Maxim. var. album | |
| シロバナハンショウヅル | シロバナハンショウヅル | Clematis williamsii A.Gray | |
| シロバナミヤマムラサキ | シロバナミヤマムラサキ | Eritrichium nipponicum Makino var. albiflorum Koidz. | |
| シロモジ | シロモジ | Lindera triloba (Siebold et Zucc.) Blume | |
| シロヤシオ | シロヤシオ | Rhododendron quinquefolium Bisset et S.Moore | |
| シロヤナギ | シロヤナギ | Salix jessoensis Seemen subsp. jessoensis | |
| ジングウスゲ | ジングウスゲ | Carex sacrosancta Honda | |
| ジングウツツジ | ジングウツツジ | Rhododendron sanctum Nakai var. sanctum | |
| ジンジソウ | ジンジソウ | Saxifraga cortusifolia Siebold et Zucc. var. cortusifolia | |
| ジンバイソウ | ジンバイソウ | Platanthera florenta Franch. et Sav. | |
| ジンムジサラゴケ | ジンムジサラゴケ | Gyalecta japonica Asahina | 地衣類 |
| ジンヨウキスミレ | ジンヨウキスミレ | Viola alliariifolia Nakai | |
| ズイナ | ズイナ | Itea japonica Oliv. | |
| スイラン | スイラン | Hololeion krameri (Franch. et Sav.) Kitam. | |
| スエコザサ | スエコザサ | Sasaella ramosa (Makino) Makino var. suwekoana (Makino) Sad.Suzuki | |
| スエヒロアオイ | スエヒロアオイ | Asarum dilatatum (F.Maek.) T.Sugaw. | |
| スカシユリ | スカシユリ | Lilium maculatum Thunb. var. maculatum | |
| スギ | スギ | Cryptomeria japonica (L.f.) D.Don | |
| スギイボゴケ | スギイボゴケ | Bacidia yasudae (Vain.) Yasuda | 地衣類 |
| スギノウエノモジゴケ | スギノウエノモジゴケ | Phaeographis laevigata (M.Nakan.) M.Nakan. & Kashiw. | 地衣類 |
| スグリ | スグリ | Ribes sinanense F.Maek. | |
| スゲガサゴケ | スゲガサゴケ | Gyalideopsis japonica H.Harada & V?zda | 地衣類 |
| スゲガサゴケ | スゲガサゴケ | Gyalideopsis lunata H.Harada | 地衣類 |
| スズカアザミ | スズカアザミ | Cirsium suzukaense Kitam. | |
| スズカカンアオイ | スズカカンアオイ | Asarum rigescens F.Maek. var. brachypodion T.Sugaw. | |
| スズコウジュ | スズコウジュ | Perillula reptans Maxim. | |
| ズソウカンアオイ | ズソウカンアオイ | Asarum savatieri F.Maek. subsp. pseudosavatieri (F.Maek.) T.Sugaw. var. pseudosavatieri | |
| ステゴビル | ステゴビル | Caloscordum inutile (Makino) Okuyama et Kitag. | |
| スノキ | スノキ | Vaccinium smallii A.Gray var. glabrum Koidz. | |
| スミレサイシン | スミレサイシン | Viola vaginata Maxim. | |
| スミレモモドキ | スミレモモドキ | Coenogonium nigromaculatum Kurok. | 地衣類 |
| スミレモモドキ | スミレモモドキ | Coenogonium theae (R?s?nen) Gagarina | 地衣類 |
| スルガイノデ | スルガイノデ | Polystichum fibrillosopaleaceum (Kodama) Tagawa var. marginale Seriz. | |
| スルガジョウロウホトトギス | スルガジョウロウホトトギス | Tricyrtis ishiiana (Kitag. et T.Koyama) Ohwi et Okuyama var. surugensis T.Yamaz. | |
| スルガスゲ | スルガスゲ | Carex omurae T.Koyama | |
| スルガテンナンショウ | スルガテンナンショウ | Arisaema yamatense (Nakai) Nakai subsp. sugimotoi (Nakai) H.Ohashi et J.Murata | |
| スルガヒョウタンボク | スルガヒョウタンボク | Lonicera alpigena L. var. watanabeana (Makino) H.Hara | |
| セイタカオトギリ | セイタカオトギリ | Hypericum momoseanum Makino | |
| セイタカトウヒレン | セイタカトウヒレン | Saussurea tanakae Franch. et Sav. ex Maxim. | |
| セイヤブシ | セイヤブシ | Aconitum ito-seiyanum Miyabe et Tatew. | |
| セキモンウライソウ | セキモンウライソウ | Procris boninensis Tuyama | |
| セキモンスゲ | セキモンスゲ | Carex toyoshimae Tuyama | |
| セキモンノキ | セキモンノキ | Claoxylon centinarium Koidz. | |
| セキヤノアキチョウジ | セキヤノアキチョウジ | Rabdosia effusa (Maxim.) H.Hara | |
| セッピコテンナンショウ | セッピコテンナンショウ | Arisaema seppikoense Kitam. | |
| セツブンソウ | セツブンソウ | Eranthis keiskei Franch. et Sav. | |
| セトウチギボウシ | セトウチギボウシ | Hosta pycnophylla F.Maek. | |
| セトウチコスズ | セトウチコスズ | Neosasamorpha magnifica (Nakai) Sad.Suzuki subsp. fujitae (Sad.Suzuki) Sad.Suzuki | |
| セトウチホトトギス | セトウチホトトギス | Tricyrtis setouchiensis Hir.Takah. | |
| セトウチマンネングサ | セトウチマンネングサ | Sedum polytrichoides Hemsl. subsp. yabeanum (Makino) H.Ohba var. setouchiense (Murata et Yuasa) H.Ohba | |
| セリバオウレン | セリバオウレン | Coptis japonica (Thunb.) Makino var. major (Miq.) Satake | |
| セリバシオガマ | セリバシオガマ | Pedicularis keiskei Franch. et Sav. | |
| セリモドキ | セリモドキ | Dystaenia ibukiensis (Y.Yabe) Kitag. | |
| センウヅモドキ | センウヅモドキ | Aconitum jaluense Kom. subsp. iwatekense (Nakai) Kadota | |
| センカクオトギリ | センカクオトギリ | Hypericum senkakuinsulare Hatus. | |
| センカクカンアオイ | センカクカンアオイ | Asarum senkakuinsulare Hatus. | |
| センカクツツジ | センカクツツジ | Rhododendron eriocarpum (Hayata) Nakai var. tawadae Ohwi | |
| センカクハマサジ | センカクハマサジ | Limonium senkakuense T.Yamaz. | |
| センゲンオトギリ | センゲンオトギリ | Hypericum yamamotoanum H.Koidz. | |
| センジュガンピ | センジュガンピ | Silene gracillima Rohrb. | |
| センジョウアザミ | センジョウアザミ | Cirsium senjoense Kitam. | |
| センジョウデンダ | センジョウデンダ | Polystichum gracilipes C.Chr. var. gemmiferum Tagawa | |
| センダイザサ | センダイザサ | Sasa chartacea (Makino) Makino et Shibata var. chartacea | |
| センダイソウ | センダイソウ | Saxifraga sendaica Maxim. | |
| センダイタイゲキ | センダイタイゲキ | Euphorbia sendaica Makino | |
| センダイトウヒレン | センダイトウヒレン | Saussurea sendaica Franch. | |
| セントウソウ | セントウソウ | Chamaele decumbens (Thunb.) Makino var. decumbens | |
| センボンギク | センボンギク | Aster microcephalus (Miq.) Franch. et Sav. var. microcephalus | |
| ソウヤキンポウゲ | ソウヤキンポウゲ | Ranunculus horieanus Kadota | |
| ソウヤレイジンソウ | ソウヤレイジンソウ | Aconitum soyaense Kadota | |
| ソテツ | ソテツ | Cycas revoluta Thunb. | |
| ソナレセンブリ | ソナレセンブリ | Swertia noguchiana Hatus. | |
| ソナレノギク | ソナレノギク | Aster hispidus Thunb. var. insularis (Makino) Okuyama | |
| ソナレマツムシソウ | ソナレマツムシソウ | Scabiosa japonica Miq. var. lasiophylla Sugim. | |
| ソバカスゴケ | ソバカスゴケ | Arthothelium collosporum (Vain.) Yoshim. | 地衣類 |
| ソハヤキトンボソウ | ソハヤキトンボソウ | Platanthera stenoglossa Hayata subsp. hottae K.Inoue | |
| ソボサンスミイボゴケ（ソボサンイボゴケ） | ソボサンスミイボゴケ（ソボサンイボゴケ） | Buellia sobo?nsis R?s?nen | 地衣類 |
| ソボサンスミイボゴケ（ソボサンイボゴケ） | ソボサンスミイボゴケ（ソボサンイボゴケ） | Buellia squamosoareolata Vain. | 地衣類 |
| ソボサンスミイボゴケ（ソボサンイボゴケ） | ソボサンスミイボゴケ（ソボサンイボゴケ） | Buellia subnumerosa Watanuki & H.Harada | 地衣類 |
| ソラチアオヤギバナ | ソラチアオヤギバナ | Solidago horieana Kadota | |
| ソラチコザクラ | ソラチコザクラ | Primula sorachiana Miyabe et Tatew. | |
| タイシャクイタヤ | タイシャクイタヤ | Acer pictum Thunb. subsp. taishakuense (K.Ogata) H.Ohashi | |
| タイシャクカラマツ | タイシャクカラマツ | Thalictrum kubotae Kadota | |
| タイシャクトウヒレン | タイシャクトウヒレン | Saussurea kubotae Kadota | |
| ダイセツトリカブト | ダイセツトリカブト | Aconitum yamazakii Tamura et Namba | |
| ダイセツヒナオトギリ | ダイセツヒナオトギリ | Hypericum yojiroanum Tatew. et Koji Ito | |
| ダイセツレイジンソウ | ダイセツレイジンソウ | Aconitum tatewakii Miyabe | |
| ダイセンアシボソスゲ | ダイセンアシボソスゲ | Carex scita Maxim. var. parvisquama T.Koyama | |
| ダイセンオトギリ | ダイセンオトギリ | Hypericum asahinae Makino | |
| ダイセンスゲ | ダイセンスゲ | Carex daisenensis Nakai | |
| ダイセンヒョウタンボク | ダイセンヒョウタンボク | Lonicera strophiophora Franch. var. glabra Nakai | |
| ダイセンミツバツツジ | ダイセンミツバツツジ | Rhododendron lagopus Nakai var. lagopus | |
| ダイトウシロダモ | ダイトウシロダモ | Neolitsea sericea (Blume) Koidz. var. argentea Hatus. | |
| ダイトウセイシボク | ダイトウセイシボク | Excoecaria formosana (Hayata) Hayata var. daitoinsularis (Hatus.) Hatus. ex Shimabuku | |
| ダイニチアザミ | ダイニチアザミ | Cirsium babanum Koidz. | |
| タイミンガサ | タイミンガサ | Parasenecio peltifolius (Makino) H.Koyama | |
| タイヨウフウトウカズラ | タイヨウフウトウカズラ | Piper postelsianum Maxim. | |
| タイリンアオイ | タイリンアオイ | Asarum asaroides (C.Morren et Decne.) Makino | |
| タイリンヤマハッカ | タイリンヤマハッカ | Rabdosia umbrosa (Maxim.) H.Hara var. excisinflexa (Nakai) H.Hara | |
| タカオヒゴタイ | タカオヒゴタイ | Saussurea sinuatoides Nakai | |
| タカクマヒキオコシ | タカクマヒキオコシ | Rabdosia shikokiana (Makino) H.Hara var. intermedia (Kudô) H.Hara | |
| タカクマホトトギス | タカクマホトトギス | Tricyrtis ohsumiensis Masam. | |
| タカクマミツバツツジ | タカクマミツバツツジ | Rhododendron viscistylum Nakai | |
| タカゴサワイボゴケ | タカゴサワイボゴケ | Verrucaria takago?nsis H.Harada | 地衣類 |
| タカシマスミイボゴケ | タカシマスミイボゴケ | Buellia takashimana (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| タカシマスミイボゴケ | タカシマスミイボゴケ | Buellia tetrastichella (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| タカネイブキボウフウ | タカネイブキボウフウ | Seseli libanotis (L.) Koch subsp. japonica (H.Boissieu) H.Hara var. alpicola (Kitag.) H.Ohba | |
| タカネエゾムギ | タカネエゾムギ | Elymus yubaridakensis (Honda) Ohwi | |
| タカネオトギリ | タカネオトギリ | Hypericum sikokumontanum Makino | |
| タカネキンポウゲ | タカネキンポウゲ | Ranunculus altaicus Laxm. subsp. shinanoalpinus (Ohwi) Kadota | |
| タカネコウボウ | タカネコウボウ | Anthoxanthum japonicum (Maxim.) Hack. ex Matsum. subsp. japonicum | |
| タカネコウリンカ | タカネコウリンカ | Tephroseris takedana (Kitam.) Holub | |
| タカネコンギク | タカネコンギク | Aster viscidulus (Makino) Makino var. alpina (Koidz.) Kitam. | |
| タカネサトメシダ | タカネサトメシダ | Athyrium pinetorum Tagawa | シダ植物 |
| タカネセンブリ | タカネセンブリ | Swertia tetrapetala Pall. subsp. micrantha (Takeda) Kitam. var. micrantha | |
| タカネソモソモ | タカネソモソモ | Festuca takedana Ohwi | |
| タカネタンポポ | タカネタンポポ | Taraxacum yuparense H.Koidz. | |
| タカネツメクサ | タカネツメクサ | Arenaria arctica Steven ex Ser. var. hondoensis (Ohwi) H.Hara | |
| タカネトリカブト | タカネトリカブト | Aconitum zigzag H.Lév. et Vaniot subsp. zigzag | |
| タカネニガナ | タカネニガナ | Ixeris alpicola (Takeda) Nakai | |
| タカネヒゴタイ | タカネヒゴタイ | Saussurea kaimontana Takeda | |
| タカネビランジ | タカネビランジ | Silene akaisialpina (T.Yamaz.) H.Ohashi, Tateishi et H.Nakai | |
| タカネマスクサ | タカネマスクサ | Carex planata Franch. et Sav. var. planata | |
| タカネマツムシソウ | タカネマツムシソウ | Scabiosa japonica Miq. var. alpina Takeda | |
| タカネママコナ | タカネママコナ | Melampyrum laxum Miq. var. arcuatum (Nakai) Soó | |
| タカネマンネングサ | タカネマンネングサ | Sedum tricarpum Makino | |
| タカネヤハズハハコ | タカネヤハズハハコ | Anaphalis alpicola Makino | |
| タカネヨモギ | タカネヨモギ | Artemisia sinanensis Y.Yabe | |
| タガネラン | タガネラン | Calanthe bungoana Ohwi | |
| タカノツメ | タカノツメ | Eleutherococcus innovans (Siebold et Zucc.) H.Ohba | |
| タカノホシクサ | タカノホシクサ | Eriocaulon cauliferum Makino | |
| タカハシテンナンショウ | タカハシテンナンショウ | Arisaema nambae Kitam. | |
| タキアザミ | タキアザミ | Cirsium yoshidae Kadota | |
| タキザワザサ | タキザワザサ | Neosasamorpha takizawana (Makino et Uchida) Tatew. subsp. takizawana var. takizawana | |
| タキナガワシノ | タキナガワシノ | Sasaella takinagawaensis Hatak. | |
| ダキバヒメアザミ | ダキバヒメアザミ | Cirsium amplexifolium (Nakai) Kitam. | |
| タキミチャルメルソウ | タキミチャルメルソウ | Mitella stylosa H.Boissieu var. stylosa | |
| タキユリ | タキユリ | Lilium speciosum Thunb. var. clivorum S.Abe et T.Tamura | |
| タケシマラン | タケシマラン | Streptopus streptopoides (Ledeb.) Frye et Rigg. var. japonicus (Maxim.) Fassett | |
| ダケトンボ | ダケトンボ | Peristylus hatusimanus T.Hashim. | |
| タコノキ | タコノキ | Pandanus boninensis Warb. | |
| タジマタムラソウ | タジマタムラソウ | Salvia omerocalyx Hayata var. omerocalyx | |
| タシロテンナンショウ | タシロテンナンショウ | Arisaema tashiroi Kitam. | |
| タシロノガリヤス | タシロノガリヤス | Calamagrostis tashiroi Ohwi subsp. tashiroi | |
| タチアザミ | タチアザミ | Cirsium inundatum Makino | |
| タチガシワ | タチガシワ | Cynanchum magnificum Nakai | |
| タチカメバソウ | タチカメバソウ | Trigonotis guilielmii (A.Gray) A.Gray ex Gürke | |
| タチキランソウ | タチキランソウ | Ajuga makinoi Nakai | |
| タチネコノメソウ | タチネコノメソウ | Chrysosplenium tosaense (Makino) Makino ex Suto | |
| タテヤマアザミ | タテヤマアザミ | Cirsium otayae Kitam. | |
| タテヤマイワブキ | タテヤマイワブキ | Saxifraga nelsoniana D.Don var. tateyamensis H.Ohba | |
| タテヤマウツボグサ | タテヤマウツボグサ | Prunella prunelliformis (Maxim.) Makino | |
| タテヤマギク | タテヤマギク | Aster dimorphophyllus Franch. et Sav. | |
| タテヤマスゲ | タテヤマスゲ | Carex aphyllopus Kük. var. aphyllopus | |
| タテヤマヌカボ | タテヤマヌカボ | Agrostis tateyamensis Tateoka | |
| タテヤマリンドウ | タテヤマリンドウ | Gentiana thunbergii (G.Don) Griseb. var. minor Maxim. | |
| タニイチゴツナギ | タニイチゴツナギ | Poa yatsugatakensis Honda | |
| タニウツギ | タニウツギ | Weigela hortensis (Siebold et Zucc.) K.Koch | |
| タニガワシズミゴケ | タニガワシズミゴケ | Collemopsidium japonicum (H.Harada) H.Harada | 地衣類 |
| タニガワシズミゴケ | タニガワシズミゴケ | Coniarthonia eos (Grube et al.) Aptroot & Ertz | 地衣類 |
| タニガワシズミゴケ | タニガワシズミゴケ | Cornutispora herteliana Knoph | 地衣類 |
| タニガワシズミゴケ | タニガワシズミゴケ | Corynespora thorii U.Braun et al. | 地衣類 |
| タニジャコウソウ | タニジャコウソウ | Chelonopsis longipes Makino | |
| タニマノオトギリ | タニマノオトギリ | Hypericum pseudoerectum N.Robson | |
| タニミツバ | タニミツバ | Sium serra (Franch. et Sav.) Kitag. | |
| タニムラアオイ | タニムラアオイ | Asarum leucosepalum Hatus. ex Yamahata | |
| タヌキノショクダイ | タヌキノショクダイ | Thismia abei (Akasawa) Hatus. | |
| タヌキラン | タヌキラン | Carex podogyna Franch. et Sav. | |
| タネガシマアザミ | タネガシマアザミ | Cirsium tanegashimense Kitam. ex Kadota | |
| タマアジサイ | タマアジサイ | Hydrangea involucrata Siebold var. involucrata | |
| タマカラマツ | タマカラマツ | Thalictrum watanabei Yatabe | |
| タマガワホトトギス | タマガワホトトギス | Tricyrtis latifolia Maxim. | |
| タマツリスゲ | タマツリスゲ | Carex filipes Franch. et Sav. var. filipes | |
| タマノカンアオイ | タマノカンアオイ | Asarum tamaense Makino | |
| タマバシロヨメナ | タマバシロヨメナ | Aster ageratoides Turcz. var. ovalifolius Kitam. | |
| タマブキ | タマブキ | Parasenecio farfarifolius (Siebold et Zucc.) H.Koyama var. bulbifer (Maxim.) H.Koyama | |
| タムシバ | タムシバ | Magnolia salicifolia (Siebld et Zucc.) Maxim. | |
| タラコゴケ | タラコゴケ | Biatorella zeorina (Vain.) Zahlbr. | 地衣類 |
| ダルマキンミズヒキ | ダルマキンミズヒキ | Agrimonia pilosa Ledeb. var. succapitata Naruh. | |
| タンガザサ | タンガザサ | Sasa elegantissima Koidz. | |
| タンゴグミ | タンゴグミ | Elaeagnus arakiana Koidz. | |
| タンザワウマノスズクサ | タンザワウマノスズクサ | Aristolochia kaempferi Willd. var. tanzawana Kigawa | |
| タンザワサカネラン | タンザワサカネラン | Neottia inagakii Yagame, Katuy. et T.Yukawa | |
| タンザワヒゴタイ | タンザワヒゴタイ | Saussurea hisauchii Nakai | |
| ダンドタムラソウ | ダンドタムラソウ | Salvia lutescens (Koidz.) Koidz. var. stolonifera G.Nakai | |
| タンバヤブレガサ | タンバヤブレガサ | Syneilesis aconitifolia (Bunge) Maxim. var. longilepis Kitam. | |
| チシマウスユキソウ | チシマウスユキソウ | Leontopodium kurilense Takeda | |
| チダケサシ | チダケサシ | Astilbe microphylla Knoll var. microphylla | |
| チチジマクロキ | チチジマクロキ | Symplocos pergracilis (Nakai) T.Yamaz. | |
| チチジマナキリスゲ | チチジマナキリスゲ | Carex chichijimensis Katsuy. | |
| チチジマベニシダ | チチジマベニシダ | Dryopteris insularis Kodama var. chichisimensis (Nakai ex H.Itô) H.Itô | シダ植物 |
| チチジマベニシダ | チチジマベニシダ | Dryopteris chichisimensis Nakai ex H.Ito | シダ植物 |
| チチッパベンケイ | チチッパベンケイ | Hylotelephium sordidum (Maxim.) H.Ohba var. sordidum | |
| チチブイワザクラ | チチブイワザクラ | Primula reinii Franch. et Sav. var. rhodotricha (Nakai et F.Maek.) T.Yamaz. | |
| チチブヒョウタンボク | チチブヒョウタンボク | Lonicera ramosissima Franch. et Sav. ex Maxim. var. ramosissima | |
| チチブミネバリ | チチブミネバリ | Betula chichibuensis H.Hara | |
| チヂレケゴケ | チヂレケゴケ | Ephebe japonica Asahina & Henssen | 地衣類 |
| チトセナンブスズ | チトセナンブスズ | Neosasamorpha takizawana (Makino et Uchida) Tatew. subsp. takizawana var. lasioclada (Makino et Nakai) Sad.Suzuki | |
| チドリケマン | チドリケマン | Corydalis kushiroensis Fukuhara | |
| チドリノキ | チドリノキ | Acer carpinifolium Siebold et Zucc. | |
| チバノマルミゴケ | チバノマルミゴケ | Thelidium chibaense H.Harada | 地衣類 |
| チャイトスゲ | チャイトスゲ | Carex alterniflora Franch. var. aureobrunnea Ohwi | |
| チャイロテンツキ | チャイロテンツキ | Fimbristylis takamineana Ohwi | |
| チャクロイボゴケモドキ | チャクロイボゴケモドキ | Lecidella elaeochroma (Ach.) M.Choisy var. caesitia (Vain.) Mas.Inoue var. caesitia (Vain.) Mas.Inoue | 地衣類 |
| チャボイノデ | チャボイノデ | Polystichum igaense Tagawa | シダ植物 |
| チャボガヤ | チャボガヤ | Torreya nucifera Siebold et Zucc. var. radicans Nakai | |
| チャボカラマツ | チャボカラマツ | Thalictrum foetidum L. var. glabrescens Takeda | |
| チャボカワズスゲ | チャボカワズスゲ | Carex omiana Franch. et Sav. var. yakushimana Ohwi | |
| チャボシライトソウ | チャボシライトソウ | Chionographis koidzumiana Ohwi var. koidzumiana | |
| チャボゼキショウ | チャボゼキショウ | Tofieldia coccinea Richards. var. gracilis (Franch. et Sav.) T.Shimizu | |
| チャボハナヤスリ | チャボハナヤスリ | Ophioglossum parvum M.Nishida et Kurita | |
| チャボホトトギス | チャボホトトギス | Tricyrtis nana Yatabe | |
| チャボヤハズトウヒレン | チャボヤハズトウヒレン | Saussurea sagitta Franch. var. yoshizawae Kitam. | |
| チャボヤマハギ | チャボヤマハギ | Lespedeza bicolor Turcz. var. nana Nakai | |
| チャボンジゴケ | チャボンジゴケ | Phaeographis fuscodisca M.Nakan. | 地衣類 |
| チャルメルソウ | チャルメルソウ | Mitella furusei Ohwi var. subramosa Wakab. | |
| チョウカイアザミ | チョウカイアザミ | Cirsium chokaiense Kitam. | |
| チョウジギク | チョウジギク | Arnica mallotopus Makino | |
| チョウジコメツツジ | チョウジコメツツジ | Rhododendron tschonoskii Maxim. var. tetramerum Komatsu | |
| チョウジザクラ | チョウジザクラ | Cerasus apetala (Siebold et Zucc.) Ohle ex H.Ohba var. apetala | |
| ツガザクラ | ツガザクラ | Phyllodoce nipponica Makino var. nipponica | |
| ツガルオニアザミ | ツガルオニアザミ | Cirsium shimae Kadota | |
| ツガルコウモリ | ツガルコウモリ | Parasenecio hosoianus Kadota | |
| ツガルフジ | ツガルフジ | Vicia fauriei Franch. | |
| ツガルミセバヤ | ツガルミセバヤ | Hylotelephium ussuriense (Kom.) H.Ohba var. tsugaruense (H.Hara) H.Ohba | |
| ツクシアオイ | ツクシアオイ | Asarum kiusianum F.Maek. | |
| ツクシアカショウマ | ツクシアカショウマ | Astilbe thunbergii (Siebold et Zucc.) Miq. var. longipedicellata Hatus. | |
| ツクシアケボノツツジ | ツクシアケボノツツジ | Rhododendron pentaphyllum Maxim. var. pentaphyllum | |
| ツクシアザミ | ツクシアザミ | Cirsium suffultum (Maxim.) Matsum. et Koidz. | |
| ツクシアブラガヤ | ツクシアブラガヤ | Scirpus rosthornii Diels var. kiushuensis (Ohwi) Ohwi | |
| ツクシアリドオシラン | ツクシアリドオシラン | Myrmechis tsukusiana Masam. | |
| ツクシイバラ | ツクシイバラ | Rosa multiflora Thunb. var. adenochaeta (Koidz.) Ohwi | |
| ツクシイワシャジン | ツクシイワシャジン | Adenophora hatsushimae Kitam. | |
| ツクシイワヘゴ | ツクシイワヘゴ | Dryopteris commixta Tagawa | |
| ツクシウスノキ | ツクシウスノキ | Vaccinium hirtum Thunb. var. kiusianum (Koidz.) H.Hara | |
| ツクシウツギ | ツクシウツギ | Deutzia scabra Thunb. var. sieboldiana (Maxim.) H.Hara | |
| ツクシガシワ | ツクシガシワ | Cynanchum grandifolium Hemsl. | |
| ツクシカシワバハグマ | ツクシカシワバハグマ | Pertya robusta (Maxim.) Makino var. kiushiana Kitam. | |
| ツクシカンガレイ | ツクシカンガレイ | Schoenoplectus multisetus Hayas. et C.Sato | |
| ツクシクサボタン | ツクシクサボタン | Clematis stans Siebold et Zucc. var. austrojaponensis (Ohwi) Ohwi | |
| ツクシコウモリ | ツクシコウモリ | Parasenecio nipponicus (Miq.) H.Koyama | |
| ツクシシオガマ | ツクシシオガマ | Pedicularis refracta (Maxim.) Maxim. | |
| ツクシシャクナゲ | ツクシシャクナゲ | Rhododendron japonoheptamerum Kitam. var. japonoheptamerum | |
| ツクシショウジョウバカマ | ツクシショウジョウバカマ | Heloniopsis breviscapa Maxim. var. breviscapa | |
| ツクシスゲ | ツクシスゲ | Carex uber Ohwi | |
| ツクシスズメノカタビラ | ツクシスズメノカタビラ | Poa crassinervis Honda | |
| ツクシゼリ | ツクシゼリ | Angelica longiradiata (Maxim.) Kitag. var. longiradiata | |
| ツクシタチドコロ | ツクシタチドコロ | Dioscorea asclepiadea Prain et Burkill | |
| ツクシタツナミソウ | ツクシタツナミソウ | Scutellaria kiusiana H.Hara | |
| ツクシタニギキョウ | ツクシタニギキョウ | Peracarpa carnosa (Wall.) Hook.f. et Thomson var. pumila H.Hara | |
| ツクシタンポポ | ツクシタンポポ | Taraxacum kiushianum H.Koidz. | |
| ツクシチャルメルソウ | ツクシチャルメルソウ | Mitella kiusiana Makino | |
| ツクシテンツキ | ツクシテンツキ | Fimbristylis tashiroana Ohwi | |
| ツクシトウキ | ツクシトウキ | Angelica pseudoshikokiana Kitag. | |
| ツクシドウダン | ツクシドウダン | Enkianthus campanulatus (Miq.) G.Nicholson var. longilobus (Nakai) Makino | |
| ツクシトウヒレン | ツクシトウヒレン | Saussurea higomontana Honda | |
| ツクシネコノメソウ | ツクシネコノメソウ | Chrysosplenium rhabdospermum Maxim. var. rhabdospermum | |
| ツクシハギ | ツクシハギ | Lespedeza homoloba Nakai | |
| ツクシヒゴタイ | ツクシヒゴタイ | Saussurea kiusiana Franch. | |
| ツクシフウロ | ツクシフウロ | Geranium soboliferum Kom. var. kiusianum (Koidz.) H.Hara | |
| ツクシボウフウ | ツクシボウフウ | Pimpinella thellungiana H.Wolff var. gustavohegiana (Koidz.) Kitam. ex H.Ohba | |
| ツクシマムシグサ | ツクシマムシグサ | Arisaema maximowiczii Nakai | |
| ツクシミカエリソウ | ツクシミカエリソウ | Leucosceptrum stellipilum (Miq.) Kitam. et Murata var. tosaense (Makino ex Koidz.) Kitam. et Murata | |
| ツクシミノボロスゲ | ツクシミノボロスゲ | Carex albata Boott ex Franch. et Sav. var. franchetiana (Ohwi) Akiyama | |
| ツクシミヤマノダケ | ツクシミヤマノダケ | Angelica cryptotaeniifolia Kitag. var. kyushiana T.Yamaz. | |
| ツクシヤブウツギ | ツクシヤブウツギ | Weigela japonica Thunb. | |
| ツクシヤブマオ | ツクシヤブマオ | Boehmeria kiusiana Satake | |
| ツクシヤマザクラ | ツクシヤマザクラ | Cerasus jamasakura (Siebold ex Koidz.) H.Ohba var. chikusiensis (Koidz.) H.Ohba | |
| ツクバキンモンソウ | ツクバキンモンソウ | Ajuga tsukubana (Nakai) Okuyama | |
| ツクバグミ | ツクバグミ | Elaeagnus montana Makino var. ovata (Maxim.) Araki | |
| ツクバスゲ | ツクバスゲ | Carex hirtifructus Kük. | |
| ツクバトリカブト | ツクバトリカブト | Aconitum japonicum Thunb. subsp. maritimum (Tamura et Namba) Kadota var. martimum | |
| ツクバナンブスズ | ツクバナンブスズ | Neosasamorpha tsukubensis (Nakai) Sad.Suzuki subsp. tsukubensis | |
| ツクバネソウ | ツクバネソウ | Paris tetraphylla A.Gray | |
| ツクモグサ | ツクモグサ | Pulsatilla nipponica (Takeda) Ohwi | |
| ツゲ | ツゲ | Buxus microphylla Siebold et Zucc. var. japonica (Müll.Arg. ex Miq.) Rehder et E.H.Wilson | |
| ツゲモドキ | ツゲモドキ | Putranjiva matsumurae Koidz. | |
| ツシマギボウシ | ツシマギボウシ | Hosta tsushimensis N.Fujita var. tsushimensis | |
| ツシマスゲ | ツシマスゲ | Carex tsushimensis (Ohwi) Ohwi | |
| ツシマノダケ | ツシマノダケ | Tilingia tsusimensis (Y.Yabe) Kitag. | |
| ツシマヒナノウスツボ | ツシマヒナノウスツボ | Scrophularia kakudensis Franch. var. toyamae (Hatus. ex T.Yamaz.) T.Yamaz. | |
| ツシママンネングサ | ツシママンネングサ | Sedum polytrichoides Hemsl. subsp. yabeanum (Makino) H.Ohba var. yabeanum (Makino) H.Ohba | |
| ツチグリカンアオイ | ツチグリカンアオイ | Asarum asperum F.Maek. var. geaster (F.Maek. ex Akasawa) T.Sugaw. | |
| ツチトリモチ | ツチトリモチ | Balanophora japonica Makino | |
| ツチビノキ | ツチビノキ | Daphnimorpha capitellata (H.Hara) Nakai | |
| ツツイイワヘゴ | ツツイイワヘゴ | Dryopteris tsutsuiana Sa.Kurata | シダ植物 |
| ツツジノモジゴケ | ツツジノモジゴケ | Graphis cognata M?ll.Arg. | 地衣類 |
| ツノダイボゴケ（ツノダスミイボゴケ） | ツノダイボゴケ（ツノダスミイボゴケ） | Buellia tsunodae Yasuda ex R?s?nen | 地衣類 |
| ツブクボミサラゴケ | ツブクボミサラゴケ | Gyalectidium radiatum L?cking et al. | 地衣類 |
| ツブモジゴケ | ツブモジゴケ | Graphis meridionalis M.Nakan. | 地衣類 |
| ツムゴケ | ツムゴケ | Sagiolechia fusiformis (M?ll.Arg.) Zahlbr. | 地衣類 |
| ツムゴケ | ツムゴケ | Santessoniella luctuosa (Hue) Henssen | 地衣類 |
| ツリガネツツジ | ツリガネツツジ | Menziesia ciliicalyx (Miq.) Maxim. | |
| ツルカコソウ | ツルカコソウ | Ajuga shikotanensis Miyabe et Tatew. | |
| ツルカメバソウ | ツルカメバソウ | Trigonotis iinumae (Maxim.) Makino | |
| ツルギカンギク | ツルギカンギク | Chrysanthemum indicum L. var. tsurugisanense Kitam. | |
| ツルキツネノボタン | ツルキツネノボタン | Ranunculus hakkodensis Nakai | |
| ツルギテンナンショウ | ツルギテンナンショウ | Arisaema abei Seriz. | |
| ツルギハナウド | ツルギハナウド | Heracleum sphondylium L. subsp. sphondylium var. turugisanense (Honda) H.Ohba | |
| ツルギミツバツツジ | ツルギミツバツツジ | Rhododendron tsurugisanense (T.Yamaz.) T.Yamaz. | |
| ツルシコクショウマ | ツルシコクショウマ | Astilbe shikokiana Nakai var. surculosa S.Akiyama et Kadota | |
| ツルシロカネソウ | ツルシロカネソウ | Dichocarpum stoloniferum (Maxim.) W.T.Wang et P.K.Hsiao | |
| ツルジンジソウ | ツルジンジソウ | Saxifraga cortusifolia Siebold et Zucc. var. stolonifera (Makino) Koidz. | |
| ツルタチツボスミレ | ツルタチツボスミレ | Viola grypoceras A.Gray var. rhizomata (Nakai) Ohwi | |
| ツルナシオオイトスゲ | ツルナシオオイトスゲ | Carex tenuinervis Ohwi | |
| ツルミヤマカンスゲ | ツルミヤマカンスゲ | Carex sikokiana Franch. et Sav. | |
| ツルモウリンカ | ツルモウリンカ | Tylophora tanakae Maxim. var. tanakae | |
| ツルワダン | ツルワダン | Ixeris longirostra (Hayata) Nakai | |
| テイショウソウ | テイショウソウ | Ainsliaea cordifolia Franch. et Sav. var. cordifolia | |
| テイネニガクサ | テイネニガクサ | Teucrium teinense Kudô | |
| テキリスゲ | テキリスゲ | Carex kiotensis Franch. et Sav. | |
| デグチツブゴケ | デグチツブゴケ | Agonimia deguchii H.Harada | 地衣類 |
| デグチツブゴケ | デグチツブゴケ | Amygdalaria consentiens var. japonica Mas.Inoue var. japonica Mas.Inoue | 地衣類 |
| テシオコザクラ | テシオコザクラ | Primula takedana Tatew. | |
| テツカエデ | テツカエデ | Acer nipponicum H.Hara | |
| テバコモミジガサ | テバコモミジガサ | Parasenecio tebakoensis (Makino) H.Koyama | |
| テリハアカショウマ | テリハアカショウマ | Astilbe thunbergii (Siebold et Zucc.) Miq. var. kiusiana (H.Hara) H.Hara ex H.Ohba | |
| テリハアザミ | テリハアザミ | Cirsium lucens Kitam. | |
| テリハノギク | テリハノギク | Aster taiwanensis Kitam. var. lucens (Kitam.) Kitam. | |
| デワノタツナミソウ | デワノタツナミソウ | Scutellaria muramatsui H.Hara | |
| テングノコヅチ | テングノコヅチ | Tripterospermum trinervium (Thunb.) H.Ohashi et H.Nakai var. involubile (N.Yonez.) H.Ohashi et H.Nakai | |
| テンニンソウ | テンニンソウ | Leucosceptrum japonicum (Miq.) Kitam. et Murata | |
| トウカイコモウセンゴケ | トウカイコモウセンゴケ | Drosera tokaiensis (Komiya et C.Shibata) T.Nakam. et K.Ueda | |
| トウカイタンポポ | トウカイタンポポ | Taraxacum longeappendiculatum Nakai | |
| トウカンゾウ | トウカンゾウ | Hemerocallis major (Baker) M.Hotta | |
| トウキ | トウキ | Angelica acutiloba (Siebold et Zucc.) Kitag. var. acutiloba | |
| トウグミ | トウグミ | Elaeagnus multiflora Thunb. var. hortensis (Maxim.) Servett. | |
| トウゲオトギリ | トウゲオトギリ | Hypericum nakaii H.Koidz. subsp. miyabei (Y.Kimura) N.Robson | |
| トウゲダケ | トウゲダケ | Sasaella sasakiana Makino et Uchida | |
| トウゴクサバノオ | トウゴクサバノオ | Dichocarpum trachyspermum (Maxim.) W.T.Wang et P.K.Hsiao | |
| トウゴクシソバタツナミ | トウゴクシソバタツナミ | Scutellaria laeteviolacea Koidz. var. abbreviata (H.Hara) H.Hara | |
| トウゴクヘラオモダカ | トウゴクヘラオモダカ | Alisma rariflorum Sam. | |
| トウゴクミツバツツジ | トウゴクミツバツツジ | Rhododendron wadanum Makino | |
| トウテイラン | トウテイラン | Pseudolysimachion ornatum (Monjuschko) Holub | |
| トウノウネコノメ | トウノウネコノメ | Chrysosplenium pseudopilosum Wakab. et Hir.Takah. var. pseudopilosum | |
| トウヒ | トウヒ | Picea jezoensis (Siebold et Zucc.) Carrière var. hondoensis (Mayr) Rehder | |
| トオノアザミ | トオノアザミ | Cirsium heiianum Koidz. | |
| トガアザミ | トガアザミ | Cirsium togaense Kadota | |
| トガクシオトギリ | トガクシオトギリ | Hypericum ovalifolium Koidz. var. hisauchii Y.Kimura | |
| トガクシコゴメグサ | トガクシコゴメグサ | Euphrasia insignis Wettst. subsp. insignis var. togakusiensis (Y.Kimura) Y.Kimura ex H.Hara | |
| トガクシソウ | トガクシソウ | Ranzania japonica (T.Itô ex Maxim.) T.Itô | |
| トガサワラ | トガサワラ | Pseudotsuga japonica (Shiras.) Beissner | |
| トガシキクバゴケ（ミノブキクバゴケ） | トガシキクバゴケ（ミノブキクバゴケ） | Xanthoparmelia togashii Kurok. | 地衣類 |
| トカチオウギ | トカチオウギ | Astragalus tokachiensis T.Yamaz. et Kadota | |
| トカチビランジ | トカチビランジ | Silene tokachiensis Kadota | |
| トガヒゴタイ | トガヒゴタイ | Saussurea muramatsui Kitam. | |
| トカラアジサイ | トカラアジサイ | Hydrangea kawagoeana Koidz. var. kawagoeana | |
| トカラカンアオイ | トカラカンアオイ | Asarum tokarense Hatus. | |
| トカラカンスゲ | トカラカンスゲ | Carex conica Boott var. scabrifolia (T.Koyama) Hatus., nom. nud. | |
| トカラタマアジサイ | トカラタマアジサイ | Hydrangea involucrata Siebold var. tokarensis M.Hotta et T.Shiuchi | |
| トキホコリ | トキホコリ | Elatostema densiflorum Franch. et Sav. ex Maxim. | |
| トキワイカリソウ | トキワイカリソウ | Epimedium sempervirens Nakai ex F.Maek. var. sempervirens | |
| トキワイヌビワ | トキワイヌビワ | Ficus boninsimae Koidz. | |
| トキワガマズミ | トキワガマズミ | Viburnum japonicum (Thunb. ex Murray) Spreng. var. boninsimense Makino | |
| トキワカモメヅル | トキワカモメヅル | Tylophora japonica Miq. | |
| トキワバイカツツジ | トキワバイカツツジ | Rhododendron uwaense H.Hara et T.Yamanaka | |
| トクガワザサ | トクガワザサ | Sasa tokugawana Makino | |
| トクノシマカンアオイ | トクノシマカンアオイ | Asarum simile Hatus. | |
| トクノシマテンナンショウ | トクノシマテンナンショウ | Arisaema kawashimae Seriz. | |
| トクワカソウ | トクワカソウ | Shortia uniflora (Maxim.) Maxim. var. orbicularis Honda | |
| トゲイボタ | トゲイボタ | Ligustrum tamakii Hatus. | |
| トゲカラクサイヌワラビ | トゲカラクサイヌワラビ | Athyrium setuligerum Sa.Kurata | シダ植物 |
| トゲナシフトネゴケ | トゲナシフトネゴケ | Relicina echinocarpa (Kurok.) Hale | 地衣類 |
| トゲナシフトネゴケモドキ | トゲナシフトネゴケモドキ | Relicina segregata Elix | 地衣類 |
| トゲミツクシネコノメ | トゲミツクシネコノメ | Chrysosplenium rhabdospermum Maxim. var. shikokianum Wakab. | |
| トゲヤマイヌワラビ | トゲヤマイヌワラビ | Athyrium spinescens Sa.Kurata | シダ植物 |
| トゲヤマルリソウ | トゲヤマルリソウ | Omphalodes japonica (Thunb.) Maxim. var. echinosperma Kitam. | |
| トサオトギリ | トサオトギリ | Hypericum tosaense Makino | |
| トサコバイモ | トサコバイモ | Fritillaria shikokiana Naruh. | |
| トサシモツケ | トサシモツケ | Spiraea nipponica Maxim. var. tosaensis (Yatabe) Makino | |
| トサトウヒレン | トサトウヒレン | Saussurea yoshinagae Kitam. | |
| トサノアオイ | トサノアオイ | Asarum costatum (F.Maek.) F.Maek. | |
| トサノギボウシ | トサノギボウシ | Hosta kikutii F.Maek. var. tosana (F.Maek.) F.Maek. | |
| トサノコゴメグサ | トサノコゴメグサ | Euphrasia insignis Wettst. subsp. iinumae (Takeda) T.Yamaz. var. makinoi (Takeda) T.Yamaz. | |
| トサノチャルメルソウ | トサノチャルメルソウ | Mitella yoshinagae H.Hara | |
| トサノハマスゲ | トサノハマスゲ | Cyperus rotundus L. var. yoshinagae (Ohwi) Ohwi | |
| トサノミツバツツジ | トサノミツバツツジ | Rhododendron dilatatum Miq. var. decandrum Makino | |
| トサボウフウ | トサボウフウ | Angelica saxicola Makino ex Y.Yabe var. yoshinagae (Makino) Murata et T.Yamanaka | |
| トサミズキ | トサミズキ | Corylopsis spicata Siebold et Zucc. | |
| トサムラサキ | トサムラサキ | Callicarpa shikokiana Makino | |
| トダイハハコ | トダイハハコ | Anaphalis sinica Hance var. pernivea T.Shimizu | |
| トチノキ | トチノキ | Aesculus turbinata Blume | |
| トチバニンジン | トチバニンジン | Panax pseudoginseng Wall. subsp. japonicus (C.A.Mey.) H.Hara var. japonicus | |
| ドナンコバンノキ | ドナンコバンノキ | Phyllanthus oligospermus Hayata subsp. donanensis T.Kuros. | |
| トネアザミ | トネアザミ | Cirsium tonense Nakai | |
| トネテンツキ | トネテンツキ | Fimbristylis tonensis Makino | |
| トネハナヤスリ | トネハナヤスリ | Ophioglossum namegatae M.Nishida et Kurita | シダ植物 |
| トネリコ | トネリコ | Fraxinus japonica Blume ex K.Koch | |
| トバタアヤメ | トバタアヤメ | Iris sanguinea Hornem. var. tobataensis S.Akiyama et Iwashina | |
| トビシマカンゾウ | トビシマカンゾウ | Hemerocallis middendorffii Trautv. et C.A.Mey. var. exaltata (Stout) M.Hotta | |
| トモエシオガマ | トモエシオガマ | Pedicularis resupinata L. subsp. teucriifolia (M.Bieb. ex Steven) T.Yamaz. var. caespitosa Koidz. | |
| トヨオカザサ | トヨオカザサ | Pleioblastus humilis (Mitford) Nakai | |
| トヨグチイノデ | トヨグチイノデ | Polystichum ohmurae Sa.Kurata | シダ植物 |
| トラノオジソ | トラノオジソ | Perilla hirtella Nakai | |
| トリアシショウマ | トリアシショウマ | Astilbe odontophylla Miq. var. odontophylla | |
| トリガタハンショウヅル | トリガタハンショウヅル | Clematis tosaensis Makino | |
| トリガミネカンアオイ | トリガミネカンアオイ | Asarum pellucidum Hatus. et Yamahata | |
| ドロノシモツケ | ドロノシモツケ | Spiraea japonica L.f. var. ripensis Kitam. | |
| ナガエスゲ | ナガエスゲ | Carex otayae Ohwi | |
| ナガエチャボゼキショウ | ナガエチャボゼキショウ | Tofieldia coccinea Richards. var. kiusiana (Okuyama) H.Hara | |
| ナガエノアザミ | ナガエノアザミ | Cirsium longipedunculatum Kitam. | |
| ナカガワノギク | ナカガワノギク | Chrysanthemum yoshinaganthum Makino ex Kitam. | |
| ナガサキオトギリ | ナガサキオトギリ | Hypericum kiusianum Koidz. var. kiusianum | |
| ナガサキギボウシ | ナガサキギボウシ | Hosta tsushimensis N.Fujita var. tibae (F.Maek.) N.Fujita et M.N.Tamura | |
| ナガサキトリハダゴケ | ナガサキトリハダゴケ | Pertusaria nagasakensis Nyl. | 地衣類 |
| ナガサキマンネングサ | ナガサキマンネングサ | Sedum nagasakianum (H.Hara) H.Ohba | |
| ナカチャシロモジゴケ | ナカチャシロモジゴケ | Hemithecium endofuscum (M.Nakan.) M.Nakan. & Kashiw. | 地衣類 |
| ナガトアザミ | ナガトアザミ | Cirsium nagatoense Kadota | |
| ナガバイワカガミ | ナガバイワカガミ | Schizocodon soldanelloides Siebold et Zucc. var. longifolius (T.Yamaz.) T.Shimizu | |
| ナガバイワザクラ | ナガバイワザクラ | Primula tosaensis Yatabe var. ovatifolia (Ohwi) Ohwi | |
| ナガバカラマツ | ナガバカラマツ | Thalictrum integrilobum Maxim. | |
| ナガバキタアザミ | ナガバキタアザミ | Saussurea riederi Herder var. yezoensis Maxim. | |
| ナガバキブシ | ナガバキブシ | Stachyurus praecox Siebold et Zucc. var. macrocarpus (Koidz.) Tuyama ex H.Ohba | |
| ナガバクロバイ | ナガバクロバイ | Symplocos prunifolia Siebold et Zucc. var. tawadae Nagam. | |
| ナガバコウラボシ | ナガバコウラボシ | Grammitis tuyamae H.Ohba | シダ植物 |
| ナガバコウラボシ | ナガバコウラボシ | Oreogrammitis tuyamae (H.Ohba) Parris | シダ植物 |
| ナガバサンショウソウ | ナガバサンショウソウ | Pellionia yosiei H.Hara | |
| ナガハシスミレ | ナガハシスミレ | Viola rostrata Pursh var. japonica (W.Becker et H.Boissieu) Ohwi | |
| ナガバシロダモ | ナガバシロダモ | Neolitsea gilva Koidz. | |
| ナガバシロヨメナ | ナガバシロヨメナ | Aster ageratoides Turcz. var. tenuifolius Kitam. | |
| ナガバツガザクラ | ナガバツガザクラ | Phyllodoce nipponica Makino subsp. tsugifolia (Nakai) Toyok. | |
| ナガバトンボソウ | ナガバトンボソウ | Platanthera tipuloides (L.f.) Lindl. subsp. linearifolia (Ohwi) K.Inoue | |
| ナガバネマガリダケ | ナガバネマガリダケ | Sasa kurilensis (Rupr.) Makino et Shibata var. uchidae (Makino) Makino | |
| ナガバノスミレサイシン | ナガバノスミレサイシン | Viola bissetii Maxim. | |
| ナガバノダケカンバ | ナガバノダケカンバ | Betula ermanii Cham. var. japonica (Shirai) Koidz. | |
| ナガバハグマ | ナガバハグマ | Ainsliaea oblonga Koidz. | |
| ナガバヒナノウスツボ | ナガバヒナノウスツボ | Scrophularia duplicatoserrata (Miq.) Makino var. surugensis (Honda) Honda ex H.Hara | |
| ナガバマムシグサ | ナガバマムシグサ | Arisaema undulatifolium Nakai subsp. undulatifolium | |
| ナガバヤクシソウ | ナガバヤクシソウ | Paraixeris yoshinoi (Makino) Nakai | |
| ナカハラクロキ | ナカハラクロキ | Symplocos nakaharae (Hayata) Masam. | |
| ナガボナツハゼ | ナガボナツハゼ | Vaccinium sieboldii Miq. | |
| ナガボノコジュズスゲ | ナガボノコジュズスゲ | Carex vaniotii H.Le'v. | |
| ナガミヒメスゲ | ナガミヒメスゲ | Carex oxyandra (Franch. et Sav.) Kudô var. lanceata (Kük.) Ohwi | |
| ナギソアザミ | ナギソアザミ | Cirsium nagisoense Kadota | |
| ナギヒロハテンナンショウ | ナギヒロハテンナンショウ | Arisaema nagiense T.Kobay., K.Sasam. et J.Murata | |
| ナスノユカワザサ | ナスノユカワザサ | Sasa kogasensis Nakai var. nasuensis (Kimura et Sad.Suzuki) Sad.Suzuki | |
| ナスヒオウギアヤメ | ナスヒオウギアヤメ | Iris setosa Pall. ex Link var. nasuensis H.Hara | |
| ナツアサドリ | ナツアサドリ | Elaeagnus yoshinoi Makino | |
| ナツグミ | ナツグミ | Elaeagnus multiflora Thunb. var. multiflora | |
| ナツトウダイ | ナツトウダイ | Euphorbia sieboldiana C.Morren et Decne. | |
| ナツノタムラソウ | ナツノタムラソウ | Salvia lutescens (Koidz.) Koidz. var. intermedia (Makino) Murata | |
| ナベクラザゼンソウ | ナベクラザゼンソウ | Symplocarpus nabekuraensis Otsuka et K.Inoue | |
| ナベワリ | ナベワリ | Croomia heterosepala (Baker) Okuyama | |
| ナマリモジゴケ | ナマリモジゴケ | Leiorreuma vicarians (Vain.) M.Nakan. & Kashiw. | 地衣類 |
| ナメラダイモンジソウ | ナメラダイモンジソウ | Saxifraga fortunei Hook.f. var. suwoensis Nakai | |
| ナメルギボウシ | ナメルギボウシ | Hosta sieboldiana (Lodd.) Engl. var. glabra N.Fujita | |
| ナヨナヨコゴメグサ | ナヨナヨコゴメグサ | Euphrasia microphylla Koidz. | |
| ナラビモジゴケ | ナラビモジゴケ | Graphis parallela M?ll.Arg. | 地衣類 |
| ナリヒラダケ | ナリヒラダケ | Semiarundinaria fastuosa (Mitford) Makino ex Nakai var. fastuosa | |
| ナルコスゲ | ナルコスゲ | Carex curvicollis Franch. et Sav. | |
| ナルトオウギ | ナルトオウギ | Astragalus sikokianus Nakai | |
| ナンカイアオイ | ナンカイアオイ | Asarum nipponicum F.Maek. var. nankaiese (F.Maek.) T.Sugaw. | |
| ナンカイシダ | ナンカイシダ | Asplenium micantifrons (Tuyama) Tuyama ex H.Ohba | シダ植物 |
| ナンカイシュスラン | ナンカイシュスラン | Goodyera augustini Tuyama | |
| ナンカイヒメイワカガミ | ナンカイヒメイワカガミ | Schizocodon ilicifolius Maxim. var. nankaiensis T.Yamaz. | |
| ナンキンナナカマド | ナンキンナナカマド | Sorbus gracilis (Siebold et Zucc.) K.Koch | |
| ナンゴクアオイ | ナンゴクアオイ | Asarum crassum F.Maek. | |
| ナンゴクカモメヅル | ナンゴクカモメヅル | Cynanchum austrokiusianum Koidz. | |
| ナンゴククガイソウ | ナンゴククガイソウ | Veronicastrum japonicum (Nakai) T.Yamaz. var. australe (T.Yamaz.) T.Yamaz. | |
| ナンゴクナライシダ | ナンゴクナライシダ | Arachniodes miqueliana Ohwi | |
| ナンゴクホウチャクソウ | ナンゴクホウチャクソウ | Disporum sessile D.Don ex Schult. var. micranthum Hatus. | |
| ナンゴクミツバツツジ | ナンゴクミツバツツジ | Rhododendron mayebarae Nakai et H.Hara var. mayebarae | |
| ナンゴクミネカエデ | ナンゴクミネカエデ | Acer tschonoskii Maxim. var. australe Momot. | |
| ナンゴクヤマアジサイ | ナンゴクヤマアジサイ | Hydrangea serrata (Thunb.) Ser. var. australis T.Yamaz. | |
| ナンゴクヤマラッキョウ | ナンゴクヤマラッキョウ | Allium austrokyushuense M.Hotta | |
| ナンタイブシ | ナンタイブシ | Aconitum zigzag H.Lév. et Vaniot subsp. komatsui (Nakai) Kadota | |
| ナンブアザミ | ナンブアザミ | Cirsium makinoi Kadota | |
| ナンブイヌナズナ | ナンブイヌナズナ | Draba japonica Maxim. | |
| ナンブコハモミジ | ナンブコハモミジ | Acer amoenum Carrière var. nambuanum (Koidz.) K.Ogata | |
| ナンブソモソモ | ナンブソモソモ | Poa hayachinensis Koidz. | |
| ナンブタカネアザミ | ナンブタカネアザミ | Cirsium nambuense Nakai | |
| ナンブトウウチソウ | ナンブトウウチソウ | Sanguisorba obtusa Maxim. | |
| ナンブトウヒレン | ナンブトウヒレン | Saussurea sugimurae Honda | |
| ナンブトラノオ | ナンブトラノオ | Bistorta hayachinensis (Makino) H.Gross | |
| ニイガタガヤツリ | ニイガタガヤツリ | Cyperus niigatensis Ohwi | |
| ニオイウツギ | ニオイウツギ | Weigela coraeensis Thunb. var. fragrans (Ohwi) H.Hara | |
| ニオイエビネ | ニオイエビネ | Calanthe izuinsularis (Satomi) Ohwi et Satomi | |
| ニオウヤブマオ | ニオウヤブマオ | Boehmeria gigantea Satake | |
| ニシキウツギ | ニシキウツギ | Weigela decora (Nakai) Nakai var. decora | |
| ニシキゴロモ | ニシキゴロモ | Ajuga yesoensis Maxim. ex Franch. et Sav. | |
| ニシノコハチジョウシダ | ニシノコハチジョウシダ | Pteris kiuschiuensis Hieron. | |
| ニシノハマカンゾウ | ニシノハマカンゾウ | Hemerocallis fulva L. var. aurantiaca (Baker) M.Hotta | |
| ニシノホンモンジスゲ | ニシノホンモンジスゲ | Carex stenostachys Franch. et Sav. var. stenostachys | |
| ニシノヤマタイミンガサ | ニシノヤマタイミンガサ | Parasenecio yatabei (Matsum. et Koidz.) H.Koyama var. occidentalis (F. Maek. ex Kitam.) H.Koyama | |
| ニセツクシアザミ | ニセツクシアザミ | Cirsium pseudsuffultum Kadota | |
| ニセヒロハノコギリシダ | ニセヒロハノコギリシダ | Diplazium dilatatum Blume var. heterolepis Seriz. | |
| ニセマルゴケ | ニセマルゴケ | Cresporhaphis chibaensis H.Harada | 地衣類 |
| ニセマルゴケ | ニセマルゴケ | Crocynia hakodateana B.de Lesd. in Hue | 地衣類 |
| ニセマルゴケ | ニセマルゴケ | Crocynia japonica de Lesd. ex Hue | 地衣類 |
| ニセマルゴケ | ニセマルゴケ | Crocynia leucomelanea Hue | 地衣類 |
| ニセマルゴケ | ニセマルゴケ | Crocynia nipponica de Lesd. ex Hue | 地衣類 |
| ニセマルゴケ | ニセマルゴケ | Crocynia pauper Hue | 地衣類 |
| ニセマルゴケ | ニセマルゴケ | Crocynia reticulata Hue | 地衣類 |
| ニセマルゴケ | ニセマルゴケ | Crocynia rosella Hue | 地衣類 |
| ニセマルゴケ | ニセマルゴケ | Crocynia yeso?nsis B.de Lesd. in Hue | 地衣類 |
| ニセマルゴケ | ニセマルゴケ | Diplolaeviopsis japonica Zhurb. & Diederich | 地衣類 |
| ニセミヤマキゴケ | ニセミヤマキゴケ | Stereocaulon curtatoides Asahina | 地衣類 |
| ニセヨゴレイタチシダ | ニセヨゴレイタチシダ | Dryopteris hadanoi Sa.Kurata | シダ植物 |
| ニッケイ | ニッケイ | Cinnamomum sieboldii Meisn. | |
| ニッコウアザミ | ニッコウアザミ | Cirsium oligophyllum (Franch. et Sav.) Matsum. var. nikkoense (Nakai ex Matsum. et Koidz.) Kitam. | |
| ニッコウオトギリ | ニッコウオトギリ | Hypericum nikkoense Makino | |
| ニッコウコウモリ | ニッコウコウモリ | Parasenecio hastatus (L.) H.Koyama subsp. orientalis (Kitam.) H.Koyama var. nantaicus (Komatsu) H.Koyama | |
| ニッコウザサ | ニッコウザサ | Sasa chartacea (Makino) Makino et Shibata var. nana (Makino) Sad.Suzuki | |
| ニッコウネコノメ | ニッコウネコノメ | Chrysosplenium macrostemon Maxim. var. shiobarense (Franch.) H.Hara | |
| ニッコウハリスゲ | ニッコウハリスゲ | Carex fulta Franch. | |
| ニッコウヒョウタンボク | ニッコウヒョウタンボク | Lonicera mochidzukiana Makino var. mochidzukiana | |
| ニッコウフクロゴケ | ニッコウフクロゴケ | Hypogymnia nikko?nsis (Zahlbr.) Rass. | 地衣類 |
| ニッコウフクロゴケ | ニッコウフクロゴケ | Hypogymnia pseudophysodes var. reagens (Asahina) Kurok. var. reagens (Asahina) Kurok. | 地衣類 |
| ニッポウアザミ | ニッポウアザミ | Cirsium nippoense Kadota | |
| ヌカイタチシダマガイ | ヌカイタチシダマガイ | Dryopteris simasakii (H.Itô) Sa.Kurata var. simasakii | |
| ヌポロオトギリ | ヌポロオトギリ | Hypericum nuporoense N.Robson | |
| ヌマカゼクサ | ヌマカゼクサ | Eragrostis aquatica Honda | |
| ネコシデ | ネコシデ | Betula corylifolia Regel et Maxim. | |
| ネコノメソウ | ネコノメソウ | Chrysosplenium grayanum Maxim. | |
| ネコヤマヒゴタイ | ネコヤマヒゴタイ | Saussurea modesta Kitam. | |
| ネザサ | ネザサ | Pleioblastus chino (Franch. et Sav.) Makino var. viridis (Makino) Sad.Suzuki | |
| ネジレモ | ネジレモ | Vallisneria natans (Lour.) H.Hara var. biwaensis (Miki) H.Hara | |
| ネズコ | ネズコ | Thuja standishii (Gordon) Carrière | |
| ネバリノギラン | ネバリノギラン | Aletris foliata (Maxim.) Bureau et Franch. | |
| ノウルシ | ノウルシ | Euphorbia adenochlora C.Morren et Decne. | |
| ノカイドウ | ノカイドウ | Malus spontanea (Makino) Makino | |
| ノコンギク | ノコンギク | Aster microcephalus (Miq.) Franch. et Sav. var. ovatus (Franch. et Sav.) Soejima et Mot.Ito | |
| ノジギク | ノジギク | Chrysanthemum japonense (Makino) Nakai var. japonense | |
| ノスゲ | ノスゲ | Carex tashiroana Ohwi | |
| ノダケモドキ | ノダケモドキ | Angelica hakonensis Maxim. var. nikoensis (Y.Yabe) H.Hara | |
| ノッポロガンクビソウ | ノッポロガンクビソウ | Carpesium matsuei Tatew. et Kitam. | |
| ノハラアザミ | ノハラアザミ | Cirsium oligophyllum (Franch. et Sav.) Matsum. var. oligophyllum | |
| ノマアザミ | ノマアザミ | Cirsium chikushiense Koidz. | |
| ノミノアオキノリ | ノミノアオキノリ | Scytinium chibaense (H.Harada) Ot?lora et al. | 地衣類 |
| ノミノアオキノリ | ノミノアオキノリ | Skyttea ochrolechiae Zhurb. | 地衣類 |
| ノヤシ | ノヤシ | Clinostigma savoryanum (Rehder et E.H.Wilson) H.E.Moore et Fosberg | |
| ノリクラアザミ | ノリクラアザミ | Cirsium norikurense Nakai | |
| ハイイヌガヤ | ハイイヌガヤ | Cephalotaxus harringtonia (Knight ex Forbes) K.Koch var. nana (Nakai) Rehder | |
| ハイイロサネゴケ | ハイイロサネゴケ | Pyrenula stramineoatra Vain. var. cinereostraminea Vain. var. cinereostraminea Vain. | 地衣類 |
| バイカイカリソウ | バイカイカリソウ | Epimedium diphyllum (C.Morren et Decne.) Lodd. var. diphyllum | |
| バイカウツギ | バイカウツギ | Philadelphus satsumi Siebold ex Lindl. et Paxton | |
| バイカオウレン | バイカオウレン | Coptis quinquefolia Miq. var. quinquefolia | |
| バイカツツジ | バイカツツジ | Rhododendron semibarbatum Maxim. | |
| バイカモ | バイカモ | Ranunculus nipponicus Nakai var. submersus H.Hara | |
| ハイコトジソウ | ハイコトジソウ | Salvia glabrescens (Franch. et Sav.) Makino var. repens (Koidz.) Kurosaki | |
| ハイタムラソウ | ハイタムラソウ | Salvia omerocalyx Hayata var. prostrata Satake | |
| ハイノキ | ハイノキ | Symplocos myrtacea Siebold et Zucc. var. myrtacea | |
| ハイヒカゲツツジ | ハイヒカゲツツジ | Rhododendron keiskei Miq. var. ozawae T.Yamaz. | |
| ハイルリソウ | ハイルリソウ | Omphalodes prolifera Ohwi | |
| ハウチワカエデ | ハウチワカエデ | Acer japonicum Thunb. | |
| ハガクレカナワラビ | ハガクレカナワラビ | Arachniodes yasu-inouei Sa.Kurata | シダ植物 |
| ハガクレカナワラビ | ハガクレカナワラビ | Arachniodes yasu-inouei Sa.Kurata var. yasu-inouei | シダ植物 |
| ハガクレツリフネ | ハガクレツリフネ | Impatiens hypophylla Makino var. hypophylla | |
| ハカマカズラ | ハカマカズラ | Bauhinia japonica Maxim. | |
| ハクサンアザミ | ハクサンアザミ | Cirsium matsumurae Nakai | |
| ハクサンイチゲ | ハクサンイチゲ | Anemone narcissiflora L. subsp. nipponica (Tamura) Kadota | |
| ハクサンイチゴツナギ | ハクサンイチゴツナギ | Poa hakusanensis Hack. | |
| ハクサンオオバコ | ハクサンオオバコ | Plantago hakusanensis Koidz. | |
| ハクサンオミナエシ | ハクサンオミナエシ | Patrinia triloba (Miq.) Miq. var. triloba | |
| ハクサンカメバヒキオコシ | ハクサンカメバヒキオコシ | Rabdosia umbrosa (Maxim.) H.Hara var. hakusanensis (Kudô) H.Hara | |
| ハクサンコザクラ | ハクサンコザクラ | Primula cuneifolia Ledeb. var. hakusanensis (Franch.) Makino | |
| ハクサンサイコ | ハクサンサイコ | Bupleurum nipponicum Koso-Pol. var. nipponicum | |
| ハクサンシャクナゲ | ハクサンシャクナゲ | Rhododendron brachycarpum D.Don ex G.Don var. brachycarpum | |
| ハクサンタイゲキ | ハクサンタイゲキ | Euphorbia togakusensis Hayata | |
| ハクサンフウロ | ハクサンフウロ | Geranium yesoense Franch. et Sav. var. nipponicum Nakai | |
| ハクサンボウフウ | ハクサンボウフウ | Peucedanum multivittatum Maxim. | |
| ハクサンボク | ハクサンボク | Viburnum japonicum (Thunb. ex Murray) Spreng. var. japonicum | |
| ハクバブシ | ハクバブシ | Aconitum zigzag H.Lév. et Vaniot subsp. kishidae (Nakai) Kadota | |
| ハコネイトスゲ | ハコネイトスゲ | Carex hakonemontana Katsuy. | |
| ハコネイボゴケ | ハコネイボゴケ | Bacidia hakonensis (M?ll.Arg.) Yasuda | 地衣類 |
| ハコネイボゴケ | ハコネイボゴケ | Bacidia leptoboliza (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| ハコネイボゴケ | ハコネイボゴケ | Bacidia luteorufula (Tuck.) Zahlbr. | 地衣類 |
| ハコネウツギ | ハコネウツギ | Weigela coraeensis Thunb. var. coraeensis | |
| ハコネオトギリ | ハコネオトギリ | Hypericum hakonense Franch. et Sav. | |
| ハコネギク | ハコネギク | Aster viscidulus (Makino) Makino var. viscidulus | |
| ハコネクサアジサイ | ハコネクサアジサイ | Cardiandra alternifolia Siebold et Zucc. subsp. alternifolia var. hakonensis Ohba ex H.Ohba | |
| ハコネグミ | ハコネグミ | Elaeagnus matsunoana Makino | |
| ハコネコメツツジ | ハコネコメツツジ | Rhododendron tsusiophyllum Sugim. | |
| ハコネシノ | ハコネシノ | Sasaella sawadae (Makino) Makino ex Koidz. var. sawadae | |
| ハコネシロカネソウ | ハコネシロカネソウ | Dichocarpum hakonense (F.Maek. et Tuyama ex Ohwi) W.T.Wang et P.K.Hsiao | |
| ハコネダケ | ハコネダケ | Pleioblastus chino (Franch. et Sav.) Makino var. vaginatus (Hack.) Sad.Suzuki | |
| ハコネナンブスズ | ハコネナンブスズ | Neosasamorpha shimidzuana (Makino) Koidz. subsp. shimidzuana | |
| ハコネラン | ハコネラン | Ephippianthus sawadanus (F.Maek.) Ohwi ex Masam. et Satomi | |
| ハシナガカンスゲ | ハシナガカンスゲ | Carex phaeodon T.Koyama | |
| ハチジョウアキノキリンソウ | ハチジョウアキノキリンソウ | Solidago virgaurea L. subsp. leiocarpa (Benth.) Hultén var. praeflorens Nakai | |
| ハチジョウアザミ | ハチジョウアザミ | Cirsium hachijoense Nakai | |
| ハチジョウイタドリ | ハチジョウイタドリ | Fallopia japonica (Houtt.) Ronse Decr. var. hachidyoensis (Makino) Yonek. et H.Ohashi | |
| ハチジョウイボタ | ハチジョウイボタ | Ligustrum ovalifolium Hassk. var. pacificum (Nakai) M.Mizush. | |
| ハチジョウウラボシ | ハチジョウウラボシ | Lepisorus hachijoensis Sa.Kurata | シダ植物 |
| ハチジョウオトギリ | ハチジョウオトギリ | Hypericum hachijyoense Nakai | |
| ハチジョウカンスゲ | ハチジョウカンスゲ | Carex hachijoensis Akiyama | |
| ハチジョウキブシ | ハチジョウキブシ | Stachyurus praecox Siebold et Zucc. var. matsuzakii (Nakai) Makino ex H.Hara | |
| ハチジョウクサイチゴ | ハチジョウクサイチゴ | Rubus nishimuranus Koidz. | |
| ハチジョウグワ | ハチジョウグワ | Morus kagayamae Koidz. | |
| ハチジョウコゴメグサ | ハチジョウコゴメグサ | Euphrasia hachijoensis Nakai ex Furumi | |
| ハチジョウショウマ | ハチジョウショウマ | Astilbe hachijoensis Nakai | |
| ハチジョウスズダケ | ハチジョウスズダケ | Sasamorpha borealis (Hack.) Nakai var. viridescens (Nakai) Sad.Suzuki | |
| ハチジョウチドリ | ハチジョウチドリ | Platanthera mandarinorum Rchb.f. subsp. hachijoensis (Honda) Murata var. hachijoensis | |
| ハチジョウツレサギ | ハチジョウツレサギ | Platanthera okuboi Makino | |
| ハチジョウテンナンショウ | ハチジョウテンナンショウ | Arisaema hatizyoense Nakai | |
| ハチジョウネッタイラン | ハチジョウネッタイラン | Tropidia nipponica Masam. var. hachijoensis F.Maek. | |
| ハチノヘトウヒレン | ハチノヘトウヒレン | Saussurea neichiana Kadota | |
| ハチマンタイアザミ | ハチマンタイアザミ | Cirsium hachimantaiense Kadota | |
| ハツシマカンアオイ | ハツシマカンアオイ | Asarum hatsushimae F.Maek. ex Hatus. et Yamahata | |
| ハツシマラン | ハツシマラン | Odontochilus hatusimanus Ohwi et T.Koyama | |
| ハッタチアザミ | ハッタチアザミ | Cirsium yamauchii Kadota | |
| ハツバキ | ハツバキ | Drypetes integerrima (Koidz.) Hosok. | |
| ハッポウアザミ | ハッポウアザミ | Cirsium happoense Kadota | |
| ハッポウタカネセンブリ | ハッポウタカネセンブリ | Swertia tetrapetala Pall. subsp. micrantha (Takeda) Kitam. var. happoensis Hid.Takah. ex T.Shimizu | |
| ハナウド | ハナウド | Heracleum sphondylium L. subsp. sphondylium var. nipponicum (Kitag.) H.Ohba | |
| ハナガガシ | ハナガガシ | Quercus hondae Makino | |
| ハナコミカンボク | ハナコミカンボク | Phyllanthus liukiuensis Matsum. ex Hayata | |
| ハナゼキショウ | ハナゼキショウ | Tofieldia nuda Maxim. var. nuda | |
| ハナタツナミソウ | ハナタツナミソウ | Scutellaria iyoensis Nakai | |
| ハナチダケサシ | ハナチダケサシ | Astilbe formosa Nakai | |
| ハナネコノメ | ハナネコノメ | Chrysosplenium album Maxim. var. stamineum (Franch.) H.Hara | |
| ハナノキ | ハナノキ | Acer pycnanthum K.Koch | |
| ハナビゼリ | ハナビゼリ | Angelica inaequalis Maxim. | |
| ハナマキアザミ | ハナマキアザミ | Cirsium hanamakiense Kitam. | |
| ハナヤマツルリンドウ | ハナヤマツルリンドウ | Tripterospermum distylum J.Murata et Yahara | |
| ハハジマテンツキ | ハハジマテンツキ | Fimbristylis longispica Steud. var. hahajimensis (Tuyama) Ohwi | |
| ハハジマトベラ | ハハジマトベラ | Pittosporum parvifolium Hayata var. beecheyi (Tuyama) H.Ohba | |
| ハハジマノボタン | ハハジマノボタン | Melastoma tetramerum Hayata var. pentapetalum Toyoda | |
| ハハジマハナガサノキ | ハハジマハナガサノキ | Morinda umbellata L. subsp. boninensis (Ohwi) T.Yamaz. var. hahazimensis T.Yamaz. | |
| ハハジマホザキラン | ハハジマホザキラン | Malaxis hahajimensis S.Kobay. | |
| ハハジマホラゴケ | ハハジマホラゴケ | Abrodictyum boninense Tagawa et K.Iwats. | シダ植物 |
| ハバヤマボクチ | ハバヤマボクチ | Synurus excelsus (Makino) Kitam. | |
| ハマアザミ | ハマアザミ | Cirsium maritimum Makino | |
| ハマオオウシノケグサ | ハマオオウシノケグサ | Festuca rubra L. var. muramatsui Ohwi | |
| ハマギク | ハマギク | Nipponanthemum nipponicum (Franch. ex Maxim.) Kitam. | |
| ハマコウゾリナ | ハマコウゾリナ | Picris hieracioides L. subsp. japonica (Thunb.) Krylov var. litoralis Kitam. | |
| ハマサワヒヨドリ | ハマサワヒヨドリ | Eupatorium lindleyanum DC. var. yasushii Tuyama | |
| ハマスミイボゴケ | ハマスミイボゴケ | Buellia yoshimurae A.Higashi et al. | 地衣類 |
| ハマスミイボゴケ | ハマスミイボゴケ | Buellia zabotica (K?rb.) R?s?nen var. zabotica | 地衣類 |
| ハマスミイボゴケ | ハマスミイボゴケ | Buellia zabotica var. japonica R?s?nen var. japonica R?s?nen | 地衣類 |
| ハマタマボウキ | ハマタマボウキ | Asparagus kiusianus Makino | |
| ハマツルボ | ハマツルボ | Barnardia japonica (Thunb.) Schult. et Schult.f. var. litoralis (Konta) M.N.Tamura, ined. | |
| ハマトラノオ | ハマトラノオ | Pseudolysimachion sieboldianum (Miq.) Holub | |
| ハマニンドウ | ハマニンドウ | Lonicera affinis Hook. et Arn. | |
| ハマヒナノウスツボ | ハマヒナノウスツボ | Scrophularia grayanoides M.Kikuchi | |
| ハマフウロ | ハマフウロ | Geranium yesoense Franch. et Sav. var. pseudopalustre Nakai | |
| ハマベノギク | ハマベノギク | Aster arenarius (Kitam.) Nemoto | |
| ハマボウ | ハマボウ | Hibiscus hamabo Siebold et Zucc. | |
| ハマヤブマオ | ハマヤブマオ | Boehmeria arenicola Satake | |
| ハヤザキヒョウタンボク | ハヤザキヒョウタンボク | Lonicera praeflorens Batalin var. japonica H.Hara | |
| ハヤチネウスユキソウ | ハヤチネウスユキソウ | Leontopodium hayachinense (Takeda) H.Hara et Kitam. | |
| ハヤチネコウモリ | ハヤチネコウモリ | Parasenecio hayachinensis (Kitam.) Kadota | |
| ハヤトミツバツツジ | ハヤトミツバツツジ | Rhododendron dilatatum Miq. var. satsumense T.Yamaz. | |
| バライチゴ | バライチゴ | Rubus illecebrosus Focke | |
| ハリイボゴケ | ハリイボゴケ | Bacidia spumosula (Zahlbr. ex Yasuda) Yasuda | 地衣類 |
| ハリイボゴケ | ハリイボゴケ | Bacidia subdiscendens (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| ハリイボゴケ | ハリイボゴケ | Bacidia subrudis (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| ハリイボゴケ | ハリイボゴケ | Bacidia subvermifera (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| ハリイボゴケ | ハリイボゴケ | Bacidia uvulina Zahlbr. | 地衣類 |
| ハリカガノアザミ | ハリカガノアザミ | Cirsium spinuliferum (Kitam.) Kadota | |
| ハリガネカズラ | ハリガネカズラ | Gaultheria japonica (A.Gray) Sleumer | |
| ハリノキテンナンショウ | ハリノキテンナンショウ | Arisaema nikoense Nakai subsp. alpicola (Seriz.) J.Murata | |
| ハリブキ | ハリブキ | Oplopanax japonicus (Nakai) Nakai | |
| ハリママムシグサ | ハリママムシグサ | Arisaema minus (Seriz.) J.Murata | |
| ハリモミ | ハリモミ | Picea polita (Siebold et Zucc.) Carrière | |
| ハルザキヤツシロラン | ハルザキヤツシロラン | Gastrodia nipponica (Honda) Tuyama | |
| ハルトラノオ | ハルトラノオ | Bistorta tenuicaulis (Bisset et S.Moore) Nakai var. tenuicaulis | |
| ハルノタムラソウ | ハルノタムラソウ | Salvia ranzaniana Makino | |
| ハルユキノシタ | ハルユキノシタ | Saxifraga nipponica Makino | |
| ハンカイシオガマ | ハンカイシオガマ | Pedicularis gloriosa Bisset et S.Moore | |
| ハンショウヅル | ハンショウヅル | Clematis japonica Thunb. | |
| バンダイショウマ | バンダイショウマ | Astilbe odontophylla Miq. var. bandaica (Honda) H.Hara | |
| ヒイラギソウ | ヒイラギソウ | Ajuga incisa Maxim. | |
| ヒカゲツツジ | ヒカゲツツジ | Rhododendron keiskei Miq. var. keiskei | |
| ヒガンマムシグサ | ヒガンマムシグサ | Arisaema aequinoctiale Nakai et F.Maek. | |
| ヒゲノガリヤス | ヒゲノガリヤス | Calamagrostis longiseta Hack. | |
| ヒゴウコギ | ヒゴウコギ | Eleutherococcus higoensis (Hatus.) H.Ohba | |
| ヒコサンヒメシャラ | ヒコサンヒメシャラ | Stewartia serrata Maxim. | |
| ヒゴスミレ | ヒゴスミレ | Viola chaerophylloides (Regel) W.Becker var. sieboldiana (Maxim.) Makino | |
| ヒサカキサザンカ | ヒサカキサザンカ | Pyrenaria virgata (Koidz.) H.Keng | |
| ヒシュウザサ | ヒシュウザサ | Sasaella hidaensis (Makino) Makino var. hidaensis | |
| ビゼンナリヒラ | ビゼンナリヒラ | Semiarundinaria okuboi Makino | |
| ヒダアザミ | ヒダアザミ | Cirsium tashiroi Kitam. var. hidaense (Kitam.) Kadota | |
| ヒダカアザミ | ヒダカアザミ | Cirsium hidakamontanum Kadota | |
| ヒダカイワザクラ | ヒダカイワザクラ | Primula hidakana Miyabe et Kudô ex Nakai var. hidakana | |
| ヒダカキンバイソウ | ヒダカキンバイソウ | Trollius citrinus Miyabe | |
| ヒダカソウ | ヒダカソウ | Callianthemum miyabeanum Tatew. | |
| ヒダカトウヒレン | ヒダカトウヒレン | Saussurea kudoana Tatew. et Kitam. var. kudoana | |
| ヒダカトリカブト | ヒダカトリカブト | Aconitum yuparense Takeda var. apoiense (Nakai) Kadota | |
| ヒダカミセバヤ | ヒダカミセバヤ | Hylotelephium cauticola (Praeger) H.Ohba | |
| ヒダカミツバツツジ | ヒダカミツバツツジ | Rhododendron dilatatum Miq. var. boreale Sugim. | |
| ヒダカヤエガワ | ヒダカヤエガワ | Betula davurica Pall. var. okuboi Miyabe et Tatew. | |
| ヒダキセルアザミ | ヒダキセルアザミ | Cirsium hidapaludosum Kadota et Nagase | |
| ヒダボタン | ヒダボタン | Chrysosplenium nagasei Wakab. et H.Ohba var. nagasei | |
| ビッチュウアザミ | ビッチュウアザミ | Cirsium bitchuense Nakai | |
| ビッチュウヒカゲスゲ | ビッチュウヒカゲスゲ | Carex bitchuensis T.Hoshino et H.Ikeda | |
| ビッチュウフウロ | ビッチュウフウロ | Geranium yoshinoi Makino ex Nakai | |
| ビッチュウミヤコザサ | ビッチュウミヤコザサ | Sasa samaniana Nakai var. yoshinoi (Koidz.) Sad.Suzuki | |
| ヒッツキアザミ | ヒッツキアザミ | Cirsium congestissimum Kitam. | |
| ヒトツバカエデ | ヒトツバカエデ | Acer distylum Siebold et Zucc. | |
| ヒトツバショウマ | ヒトツバショウマ | Astilbe simplicifolia Makino | |
| ヒトツバテンナンショウ | ヒトツバテンナンショウ | Arisaema monophyllum Nakai | |
| ヒトツバヨモギ | ヒトツバヨモギ | Artemisia monophylla Kitam. | |
| ヒトツボクロモドキ | ヒトツボクロモドキ | Tipularia japonica Matsum. var. harae F.Maek. | |
| ヒトヨシテンナンショウ | ヒトヨシテンナンショウ | Arisaema mayebarae Nakai | |
| ヒナウチワカエデ | ヒナウチワカエデ | Acer tenuifolium (Koidz.) Koidz. | |
| ヒナガリヤス | ヒナガリヤス | Calamagrostis nana Takeda subsp. nana | |
| ヒナカンアオイ | ヒナカンアオイ | Asarum okinawense Hatus. | |
| ヒナコゴメグサ | ヒナコゴメグサ | Euphrasia yabeana Nakai | |
| ヒナザクラ | ヒナザクラ | Primula nipponica Yatabe | |
| ヒナザサ | ヒナザサ | Coelachne japonica Hack. | |
| ヒナシャジン | ヒナシャジン | Adenophora maximowicziana Makino | |
| ヒナスゲ | ヒナスゲ | Carex grallatoria Maxim. var. grallatoria | |
| ヒナセントウソウ | ヒナセントウソウ | Chamaele decumbens (Thunb.) Makino var. gracillima H.Wolff | |
| ヒナチドリ | ヒナチドリ | Ponerorchis chidori (Makino) Ohwi | |
| ヒナノウスツボ | ヒナノウスツボ | Scrophularia duplicatoserrata (Miq.) Makino var. duplicatoserrata | |
| ヒナノボンボリ | ヒナノボンボリ | Oxygyne hyodoi C.Abe et Akasawa | |
| ヒナボウフウ | ヒナボウフウ | Angelica longiradiata (Maxim.) Kitag. var. yakushimensis (Masam. et Ohwi) Kitag. | |
| ヒナワチガイソウ | ヒナワチガイソウ | Pseudostellaria heterantha (Maxim.) Pax var. linearifolia (Takeda) Nemoto | |
| ヒノキ | ヒノキ | Chamaecyparis obtusa (Siebold et Zucc.) Endl. var. obtusa | |
| ヒノキアスナロ | ヒノキアスナロ | Thujopsis dolabrata (L.f.) Siebold et Zucc. var. hondae Makino | |
| ヒノタニシダ | ヒノタニシダ | Pteris nakasimae Tagawa | |
| ヒメアオガヤツリ | ヒメアオガヤツリ | Cyperus extremiorientalis Ohwi | |
| ヒメアオキ | ヒメアオキ | Aucuba japonica Thunb. var. borealis Miyabe et Kudô | |
| ヒメアオキノリ | ヒメアオキノリ | Scytinium boso?nse (H.Harada) Ot?lora et al. | 地衣類 |
| ヒメアオスゲ | ヒメアオスゲ | Carex discoidea Boott var. discoidea | |
| ヒメアカボシタツナミソウ | ヒメアカボシタツナミソウ | Scutellaria rubropunctata Hayata var. minima T.Yamaz. | |
| ヒメアザミ | ヒメアザミ | Cirsium buergeri Miq. | |
| ヒメイカリソウ | ヒメイカリソウ | Epimedium trifoliatobinatum (Koidz.) Koidz. var. trifoliatobinatum | |
| ヒメイノモトソウ | ヒメイノモトソウ | Pteris yamatensis (Tagawa) Tagawa | シダ植物 |
| ヒメイバラモ | ヒメイバラモ | Najas tenuicaulis Miki | |
| ヒメイヨカズラ | ヒメイヨカズラ | Cynanchum matsumurae T.Yamaz. | |
| ヒメイワカガミ | ヒメイワカガミ | Schizocodon ilicifolius Maxim. var. ilicifolius | |
| ヒメイワギボウシ | ヒメイワギボウシ | Hosta longipes (Franch. et Sav.) Matsum. var. gracillima (F.Maek.) N.Fujita | |
| ヒメイワショウブ | ヒメイワショウブ | Tofieldia okuboi Makino | |
| ヒメウスノキ | ヒメウスノキ | Vaccinium yatabei Makino | |
| ヒメウスユキソウ | ヒメウスユキソウ | Leontopodium shinanense Kitam. | |
| ヒメウツギ | ヒメウツギ | Deutzia gracilis Siebold et Zucc. | |
| ヒメウマノアシガタ | ヒメウマノアシガタ | Ranunculus yakushimensis (Makino) Masam. | |
| ヒメウメバチソウ | ヒメウメバチソウ | Parnassia alpicola Makino | |
| ヒメウラシマソウ | ヒメウラシマソウ | Arisaema kiushianum Makino | |
| ヒメウワバミソウ | ヒメウワバミソウ | Elatostema japonicum Wedd. var. japonicum | |
| ヒメエゾネギ | ヒメエゾネギ | Allium schoenoprasum L. var. yezomonticola H.Hara | |
| ヒメエンゴサク | ヒメエンゴサク | Corydalis lineariloba Siebold et Zucc. var. capillaris (Makino) Ohwi | |
| ヒメオオイワボタン | ヒメオオイワボタン | Chrysosplenium pseudofauriei H.Lév. var. nipponense Wakab. | |
| ヒメオニヤブソテツ | ヒメオニヤブソテツ | Cyrtomium falcatum (L.f.) C.Presl subsp. littorale S.Matsumoto, nom. nud. | シダ植物 |
| ヒメオニヤブソテツ | ヒメオニヤブソテツ | Cyrtomium falcatum (L.f.) C.Presl subsp. littorale Ebihara et S.Matsumoto | シダ植物 |
| ヒメカシゴケ | ヒメカシゴケ | Cresponea japonica A.Sakata & H.Harada | 地衣類 |
| ヒメカミザサ | ヒメカミザサ | Neosasamorpha stenophylla (Koidz.) Sad.Suzuki subsp. tobagenzoana (Koidz.) Sad.Suzuki | |
| ヒメカムリゴケ | ヒメカムリゴケ | Pilophorus curtulus Kurok. & Shibuichi | 地衣類 |
| ヒメカムリゴケ | ヒメカムリゴケ | Porina aspera R?s?nen | 地衣類 |
| ヒメカムリゴケ | ヒメカムリゴケ | Porina cupreola (M?ll.Arg.) F.Schill. var. nipponica G.Thor et al. var. nipponica G.Thor et al. | 地衣類 |
| ヒメカラマツ | ヒメカラマツ | Thalictrum alpinum L. var. stipitatum Y.Yabe | |
| ヒメカンアオイ | ヒメカンアオイ | Asarum fauriei Franch. var. takaoi (F.Maek.) T.Sugaw. | |
| ヒメキカシグサ | ヒメキカシグサ | Rotala elatinomorpha Makino | |
| ヒメキクタビラコ | ヒメキクタビラコ | Myriactis japonensis Koidz. | |
| ヒメキジノオ | ヒメキジノオ | Plagiogyria japonica Nakai var. pseudojaponica (Nakaike) K. Iwats. | シダ植物 |
| ヒメキツネノボタン | ヒメキツネノボタン | Ranunculus yaegatakensis Masam. | |
| ヒメキリンソウ | ヒメキリンソウ | Phedimus sikokianus (Maxim.) 't Hart | |
| ヒメキンポウゲ | ヒメキンポウゲ | Halerpestes kawakamii (Makino) Tamura | |
| ヒメクロミゴケ | ヒメクロミゴケ | Scleropyrenium kurokawae H.Harada | 地衣類 |
| ヒメクロモジ | ヒメクロモジ | Lindera sericea (Siebold et Zucc.) Blume var. lancea (Momiy.) H.Ohba | |
| ヒメクワガタ | ヒメクワガタ | Veronica nipponica Makino ex Furumi var. nipponica | |
| ヒメコイワカガミ | ヒメコイワカガミ | Schizocodon ilicifolius Maxim. var. minimus (Makino) T.Yamaz. | |
| ヒメコウホネ | ヒメコウホネ | Nuphar subintegerrima (Casp.) Makino | |
| ヒメコウモリ | ヒメコウモリ | Parasenecio shikokianus (Makino) H.Koyama | |
| ヒメコザクラ | ヒメコザクラ | Primula macrocarpa Maxim. | |
| ヒメコナスビ | ヒメコナスビ | Lysimachia japonica Thunb. var. minutissima Masam. | |
| ヒメコヌカグサ | ヒメコヌカグサ | Agrostis valvata Steud. | |
| ヒメゴマシオゴケ | ヒメゴマシオゴケ | Arthothelium pertenerum (Vain.) Zahlbr. | 地衣類 |
| ヒメゴヨウイチゴ | ヒメゴヨウイチゴ | Rubus pseudojaponicus Koidz. | |
| ヒメサザンカ | ヒメサザンカ | Camellia lutchuensis T.Itô | |
| ヒメサユリ | ヒメサユリ | Lilium rubellum Baker | |
| ヒメサンゴトリハダゴケ | ヒメサンゴトリハダゴケ | Pertusaria corallina var. minor (Yasuda ex R?s?nen) Oshio var. minor (Yasuda ex R?s?nen) Oshio | 地衣類 |
| ヒメサンゴトリハダゴケ | ヒメサンゴトリハダゴケ | Pertusaria ferruginea (M?ll.Arg.) Oshio | 地衣類 |
| ヒメシケシダ | ヒメシケシダ | Deparia petersenii (Kunze) M.Kato var. yakusimensis (H.Ito) M.Kato | シダ植物 |
| ヒメシコクショウマ | ヒメシコクショウマ | Astilbe shikokiana Nakai var. sikokumontana (Koidz.) H.Hara | |
| ヒメシャガ | ヒメシャガ | Iris gracilipes A.Gray | |
| ヒメシャジン | ヒメシャジン | Adenophora nikoensis Franch. et Sav. var. nikoensis | |
| ヒメシャラ | ヒメシャラ | Stewartia monadelpha Siebold et Zucc. | |
| ヒメシラネニンジン | ヒメシラネニンジン | Tilingia ajanensis Regel var. angustissima (Nakai ex H.Hara) Kitag. | |
| ヒメスイカズラ | ヒメスイカズラ | Lonicera japonica Thunb. var. miyagusukiana Makino | |
| ヒメスズダケ | ヒメスズダケ | Sasaella hisauchii (Makino) Makino | |
| ヒメタツナミソウ | ヒメタツナミソウ | Scutellaria kikai-insularis Hatus. ex T.Yamaz. | |
| ヒメタムラソウ | ヒメタムラソウ | Salvia pygmaea Matsum. var. pygmaea | |
| ヒメチドメ | ヒメチドメ | Hydrocotyle yabei Makino | |
| ヒメチャルメルソウ | ヒメチャルメルソウ | Mitella doiana Ohwi | |
| ヒメツバキ | ヒメツバキ | Schima mertensiana (Siebold et Zucc.) Koidz. | |
| ヒメトキホコリ | ヒメトキホコリ | Elatostema yakushimense Hatus. | |
| ヒメトケンラン | ヒメトケンラン | Tainia laxiflora Makino | |
| ヒメトラノオ | ヒメトラノオ | Pseudolysimachion rotundum (Nakai) Holub var. petiolatum (Nakai) T.Yamaz. | |
| ヒメノカンゾウ | ヒメノカンゾウ | Hemerocallis fulva L. var. pauciflora M.Hotta et M.Matsuoka | |
| ヒメノコギリシダ | ヒメノコギリシダ | Diplazium wichurae (Mett.) Diels var. amabile Tagawa | シダ植物 |
| ヒメハイホラゴケ | ヒメハイホラゴケ | Vandenboschia nipponica (Nakai) Ebihara | シダ植物 |
| ヒメハッカ | ヒメハッカ | Mentha japonica (Miq.) Makino | |
| ヒメハマナデシコ | ヒメハマナデシコ | Dianthus kiusianus Makino | |
| ヒメバラモミ | ヒメバラモミ | Picea maximowiczii Regel ex Carrière | |
| ヒメヒサカキ | ヒメヒサカキ | Eurya yakushimensis (Makino) Makino | |
| ヒメヒダボタン | ヒメヒダボタン | Chrysosplenium nagasei Wakab. et H.Ohba var. luteoflorum Wakab. et H.Ohba | |
| ヒメフトモモ | ヒメフトモモ | Syzygium cleyerifolium (Yatabe) Makino | |
| ヒメホウチャクソウ | ヒメホウチャクソウ | Disporum sessile D.Don ex Schult. var. minus Miq. | |
| ヒメホラシノブ | ヒメホラシノブ | Sphenomeris gracilis (Tagawa) Sa.Kurata | |
| ヒメマサキ | ヒメマサキ | Euonymus boninensis Koidz. | |
| ヒメマツハダ | ヒメマツハダ | Picea shirasawae Hayashi | |
| ヒメマンネングサ | ヒメマンネングサ | Sedum zentaro-tashiroi Makino | |
| ヒメミズトンボ | ヒメミズトンボ | Habenaria linearifolia Maxim. var. brachycentra H.Hara | |
| ヒメミゾシダ | ヒメミゾシダ | Stegnogramma gymnocarpa (Copel.) K.Iwats. subsp. amabilis (Tagawa) K.Iwats. | シダ植物 |
| ヒメミゾシダ | ヒメミゾシダ | Thelypteris gymnocarpa (Copel.) C.V.Morton subsp. amabilis (Tagawa) C.V.Morton | シダ植物 |
| ヒメミツバツツジ | ヒメミツバツツジ | Rhododendron nudipes Nakai var. nagasakianum (Nakai) T.Yamaz. | |
| ヒメミドリゴケ | ヒメミドリゴケ | Endocarpon superpositum H.Harada | 地衣類 |
| ヒメミヤマカラマツ | ヒメミヤマカラマツ | Thalictrum nakamurae Koidz. | |
| ヒメミヤマコナスビ | ヒメミヤマコナスビ | Lysimachia liukiuensis Hatus. | |
| ヒメムカゴシダ | ヒメムカゴシダ | Monachosorum arakii Tagawa | |
| ヒメムカデクラマゴケ | ヒメムカデクラマゴケ | Selaginella lutchuensis Koidz. | |
| ヒメモチ | ヒメモチ | Ilex leucoclada (Maxim.) Makino | |
| ヒメヤマツツジ | ヒメヤマツツジ | Rhododendron kaempferi Planch. var. tubiflorum Komatsu | |
| ヒメユキチャシブゴケ | ヒメユキチャシブゴケ | Lecanora lecanactina Zahlbr. | 地衣類 |
| ヒメユキチャシブゴケ | ヒメユキチャシブゴケ | Lecanora leptocheila Vain. | 地衣類 |
| ヒメユキチャシブゴケ | ヒメユキチャシブゴケ | Lecanora leptopismodes Nyl. | 地衣類 |
| ヒメユキチャシブゴケ | ヒメユキチャシブゴケ | Lecanora liukiu?nsis (R?s?nen) Cretz. | 地衣類 |
| ビャッコアザミ | ビャッコアザミ | Cirsium japonicum Fisch. ex DC. var. villosum Kadota | |
| ヒュウガアザミ | ヒュウガアザミ | Cirsium masami-saitoanum Kadota | |
| ヒュウガアジサイ | ヒュウガアジサイ | Hydrangea serrata (Thunb.) Ser. var. minamitanii H.Ohba | |
| ヒュウガオウレン | ヒュウガオウレン | Coptis minamitaniana Kadota | |
| ヒュウガカナワラビ | ヒュウガカナワラビ | Arachniodes hiugana Sa.Kurata | シダ植物 |
| ヒュウガギボウシ | ヒュウガギボウシ | Hosta kikutii F.Maek. var. kikutii | |
| ヒュウガシケシダ | ヒュウガシケシダ | Deparia minamitanii Seriz. | シダ植物 |
| ヒュウガセンキュウ | ヒュウガセンキュウ | Angelica minamitanii T.Yamaz. | |
| ヒュウガタイゲキ | ヒュウガタイゲキ | Euphorbia watanabei Makino subsp. minamitanii T.Kuros., Seriz. et H.Ohashi | |
| ヒュウガトウキ | ヒュウガトウキ | Angelica tenuisecta (Makino) Makino var. furcijuga (Kitag.) H.Ohba | |
| ヒュウガナベワリ | ヒュウガナベワリ | Croomia hyugaensis Kadota | |
| ヒュウガナルコユリ | ヒュウガナルコユリ | Polygonatum falcatum A.Gray var. hyugaense Hiyama | |
| ヒュウガヒロハテンナンショウ | ヒュウガヒロハテンナンショウ | Arisaema minamitanii Seriz. | |
| ヒュウガミツバツツジ | ヒュウガミツバツツジ | Rhododendron hyugaense (T.Yamaz.) T.Yamaz. | |
| ヒョウノセンカタバミ | ヒョウノセンカタバミ | Oxalis acetosella L. var. longicapsula Terao | |
| ヒラミヤイトゴケ | ヒラミヤイトゴケ | Solorina platycarpa Hue | 地衣類 |
| ヒラモ | ヒラモ | Vallisneria natans (Lour.) H.Hara var. higoensis (Miki) H.Hara | |
| ヒルゼンスゲ | ヒルゼンスゲ | Carex aphyllopus Kük. var. impura (Ohwi) T.Koyama | |
| ヒレフリカラマツ | ヒレフリカラマツ | Thalictrum toyamae Ohwi et Hatus. | |
| ヒロウザサ | ヒロウザサ | Pleioblastus nagashima (Mitford) Nakai var. nagashima | |
| ビロードウツギ | ビロードウツギ | Deutzia crenata Siebold et Zucc. var. heterotricha (Rehder) H.Hara | |
| ビロードエゾシオガマ | ビロードエゾシオガマ | Pedicularis yezoensis Maxim. var. pubescens H.Hara | |
| ビロードスゲ | ビロードスゲ | Carex miyabei Franch. | |
| ビロードトラノオ | ビロードトラノオ | Pseudolysimachion ovatum (Nakai) T.Yamaz. subsp. miyabei (Nakai et Honda) T.Yamaz. var. villosum (Furumi) T.Yamaz. | |
| ビロードミヤコザサ | ビロードミヤコザサ | Sasa chartacea (Makino) Makino et Shibata var. mollis (Nakai) Sad.Suzuki | |
| ヒロハアツイタ | ヒロハアツイタ | Elaphoglossum tosaense (Yatabe) Makino | シダ植物 |
| ヒロハカツラ | ヒロハカツラ | Cercidiphyllum magnificum (Nakai) Nakai | |
| ヒロハキクザキイチゲ | ヒロハキクザキイチゲ | Anemone pseudoaltaica H.Hara var. katonis H.Ohba | |
| ヒロハコンロンソウ | ヒロハコンロンソウ | Cardamine appendiculata Franch. et Sav. | |
| ヒロバスゲ | ヒロバスゲ | Carex insaniae Koidz. | |
| ヒロハツリシュスラン | ヒロハツリシュスラン | Goodyera pendula Maxim. var. brachyphylla F.Maek. | |
| ヒロハテイショウソウ | ヒロハテイショウソウ | Ainsliaea cordifolia Franch. et Sav. var. maruoi (Makino) Makino ex Kitam. | |
| ヒロハテンナンショウ | ヒロハテンナンショウ | Arisaema ovale Nakai | |
| ヒロハナライシダ | ヒロハナライシダ | Arachniodes quadripinnata (Hayata) Seriz. subsp. fimbriata (Koidz.) Seriz. | |
| ヒロハヌマゼリ | ヒロハヌマゼリ | Sium suave Walter var. ovatum (Yatabe) H.Hara | |
| ヒロハノアマナ | ヒロハノアマナ | Amana latifolia (Makino) Honda | |
| ヒロハノオオタマツリスゲ | ヒロハノオオタマツリスゲ | Carex arakiana (Ohwi) Ohwi | |
| ヒロハノコヌカグサ | ヒロハノコヌカグサ | Aniselytron treutleri (Kunze) Soják var. japonicum (Hack.) N.X.Zhao | |
| ヒロハノハネガヤ | ヒロハノハネガヤ | Stipa coreana Honda var. japonica (Hack.) Y.N.Lee | |
| ヒロハノミミズバイ | ヒロハノミミズバイ | Symplocos tanakae Matsum. | |
| ヒロハハイノキ | ヒロハハイノキ | Symplocos myrtacea Siebold et Zucc. var. latifolia Hatus. | |
| ヒロハヒメウラボシ | ヒロハヒメウラボシ | Grammitis nipponica Tagawa et K.Iwats. | シダ植物 |
| ヒロハヒメウラボシ | ヒロハヒメウラボシ | Oreogrammitis nipponica (Tagawa et K.Iwats.) Parris | シダ植物 |
| ヒロハマツナ | ヒロハマツナ | Suaeda malacosperma H.Hara | |
| ヒロハムカシヨモギ | ヒロハムカシヨモギ | Erigeron acer L. var. amplifolius Kitam. | |
| ヒロハヤブレガサモドキ | ヒロハヤブレガサモドキ | Syneilesis tagawae (Kitam.) Kitam. var. latifolia H.Koyama | |
| ヒロハヤマトウバナ | ヒロハヤマトウバナ | Clinopodium latifolium (H.Hara) T.Yamaz. et Murata | |
| ヒロハユキザサ | ヒロハユキザサ | Smilacina yesoensis Franch. et Sav. | |
| ビワコエビラフジ | ビワコエビラフジ | Vicia venosa (Willd. ex Link) Maxim. subsp. stolonifera (Y.Endo et H.Ohashi) Y.Endo et H.Ohashi | |
| フウリンウメモドキ | フウリンウメモドキ | Ilex geniculata Maxim. | |
| フォーリーアザミ | フォーリーアザミ | Saussurea fauriei Franch. | |
| フガクスズムシソウ | フガクスズムシソウ | Liparis fujisanensis F.Maek. ex F.Konta et S.Matsumoto | |
| フキユキノシタ | フキユキノシタ | Saxifraga japonica H.Boissieu | |
| フギレオオバキスミレ | フギレオオバキスミレ | Viola brevistipulata (Franch. et Sav.) W.Becker var. laciniata (H.Boissieu) W.Becker | |
| フクエジマカンアオイ | フクエジマカンアオイ | Asarum mitoanum T.Sugaw. | |
| フクオウソウ | フクオウソウ | Prenanthes acerifolia (Maxim.) Matsum. | |
| フクレセンシゴケ | フクレセンシゴケ | Menegazzia asahinae (Yasuda ex Asahina) R.Sant. | 地衣類 |
| フクレニクイボゴケ | フクレニクイボゴケ | Ochrolechia submarginata (Nyl.) Oshio | 地衣類 |
| フクロダガヤ | フクロダガヤ | Tripogon longearistatus Honda var. japonicus Honda | |
| フゲシザサ | フゲシザサ | Sasa fugeshiensis Koidz. | |
| ブコウマメザクラ | ブコウマメザクラ | Cerasus incisa (Thunb.) Loisel. var. bukosanensis (Honda) H.Ohba | |
| フサカンスゲ | フサカンスゲ | Carex tokarensis T.Koyama | |
| フサザクラ | フサザクラ | Euptelea polyandra Siebold et Zucc. | |
| フサタヌキモ | フサタヌキモ | Utricularia dimorphantha Makino | |
| フジ | フジ | Wisteria floribunda (Willd.) DC. | |
| フジアカショウマ | フジアカショウマ | Astilbe thunbergii (Siebold et Zucc.) Miq. var. fujisanensis (Nakai) Ohwi | |
| フジアザミ | フジアザミ | Cirsium purpuratum (Maxim.) Matsum. | |
| フジアワビゴケ | フジアワビゴケ | Tuckermannopsis platyphylloides (Asahina) Kurok. | 地衣類 |
| フジイバラ | フジイバラ | Rosa fujisanensis (Makino) Makino | |
| フジウツギ | フジウツギ | Buddleja japonica Hemsl. | |
| フジカワゴケ | フジカワゴケ | Toninia tristis (Th.Fr.) Th.Fr. subsp. fujikawae (M.Sat?) Timdal subsp. fujikawae (M.Sat?) Timdal | 地衣類 |
| フシグロセンノウ | フシグロセンノウ | Silene miqueliana (Rohrb.) H.Ohashi et H.Nakai | |
| フジスミレ | フジスミレ | Viola tokubuchiana Makino var. tokubuchiana | |
| フジセンニンソウ | フジセンニンソウ | Clematis fujisanensis Hisauti et H.Hara | |
| フジタイゲキ | フジタイゲキ | Euphorbia watanabei Makino subsp. watanabei | |
| フジチドリ | フジチドリ | Neottianthe fujisanensis (Sugim.) F.Maek., comb. ined. | |
| フジツツジ | フジツツジ | Rhododendron tosaense Makino | |
| フジノカンアオイ | フジノカンアオイ | Asarum fudsinoi T.Itô | |
| フジノモジゴケ | フジノモジゴケ | Fissurina fujisanensis (Kashiw. & M.Nakan.) M.Nakan. & Kashiw. | 地衣類 |
| フジノモジゴケ | フジノモジゴケ | Fissurina subtropica (M.Nakan.) M.Nakan. & Kashiw. | 地衣類 |
| フジノモジゴケ | フジノモジゴケ | Fuscidea cyathoides (Ach.) V.Wirth & V?zda var. japonica Mas.Inoue & P.James var. japonica Mas.Inoue & P.James | 地衣類 |
| フジノモジゴケ | フジノモジゴケ | Fuscidea submollis Mas.Inoue | 地衣類 |
| フジノモジゴケ | フジノモジゴケ | Fuscidea verruciformis Mas.Inoue | 地衣類 |
| フジヤマチズゴケ | フジヤマチズゴケ | Rhizocarpon fujiyamae R?s?nen | 地衣類 |
| フジヤマチズゴケ | フジヤマチズゴケ | Rhizocarpon japonicum (R?s?nen) R?s?nen | 地衣類 |
| フジヤマチズゴケ | フジヤマチズゴケ | Rhizocarpon nabewariense Yasuda ex R?s?nen | 地衣類 |
| フジヤマチズゴケ | フジヤマチズゴケ | Rhizocarpon obscuratum var. subvirens Zahlbr. var. subvirens Zahlbr. | 地衣類 |
| フジヤマチズゴケ | フジヤマチズゴケ | Rhizocarpon vulcani Mas.Inoue | 地衣類 |
| フジヤマチズゴケ | フジヤマチズゴケ | Rinodina cervina Vain. | 地衣類 |
| フジヤマチズゴケ | フジヤマチズゴケ | Rinodina compensata (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| フジヤマチズゴケ | フジヤマチズゴケ | Rinodina luteonigra Zahlbr. | 地衣類 |
| ブゼンノギク | ブゼンノギク | Aster hispidus Maxim. var. koidzumianus (Kitam.) Okuyama | |
| フタナミソウ | フタナミソウ | Scorzonera rebunensis Tatew. et Kitam. | |
| フトボナギナタコウジュ | フトボナギナタコウジュ | Elsholtzia nipponica Ohwi | |
| ブナ | ブナ | Fagus crenata Blume | |
| フボウトウヒレン | フボウトウヒレン | Saussurea fuboensis Kadota | |
| フモトシケシダ | フモトシケシダ | Deparia pseudoconilii (Seriz.) Seriz. var. pseudoconilii | |
| フモトミズナラ | フモトミズナラ | Quercus serrata Murray subsp. mongolicoides H.Ohba | |
| フルセオトギリ | フルセオトギリ | Hypericum furusei N.Robson | |
| ブンゴウツギ | ブンゴウツギ | Deutzia zentaroana Nakai | |
| ヘツカコナスビ | ヘツカコナスビ | Lysimachia ohsumiensis H.Hara | |
| ヘツカリンドウ | ヘツカリンドウ | Swertia tashiroi (Maxim.) Makino | |
| ベニオグラコウホネ | ベニオグラコウホネ | Nuphar oguraensis Miki var. akiensis Shimoda | |
| ベニバナイチゴ | ベニバナイチゴ | Rubus vernus Focke | |
| ベニバナノツクバネウツギ | ベニバナノツクバネウツギ | Abelia spathulata Siebold et Zucc. var. sanguinea Makino | |
| ヘノンホシゴケ | ヘノンホシゴケ | Arthonia henoniana M?ll.Arg. | 地衣類 |
| ヘノンホシゴケ | ヘノンホシゴケ | Arthonia perpallens Nyl. | 地衣類 |
| ヘノンホシゴケ | ヘノンホシゴケ | Arthonia vernicis M?ll.Arg. | 地衣類 |
| ヘノンホシゴケ | ヘノンホシゴケ | Arthopyrenia fallaciuscula (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| ヘビノボラズ | ヘビノボラズ | Berberis sieboldii Miq. | |
| ヘラナレン | ヘラナレン | Crepidiastrum linguifolium (A.Gray) Nakai | |
| ヘラノキ | ヘラノキ | Tilia kiusiana Makino et Shiras. | |
| ベンテンツゲ | ベンテンツゲ | Buxus microphylla Siebold et Zucc. var. kitashimae (Yanagita) H.Ohba | |
| ホウオウシャジン | ホウオウシャジン | Adenophora takedae Makino var. howozana (Takeda) Sugim. ex J.Okazaki | |
| ホウキアザミ | ホウキアザミ | Cirsium gratiosum Kitam. | |
| ホウキスミイボゴケ | ホウキスミイボゴケ | Buellia disciformis var. hokiensis R?s?nen var. hokiensis R?s?nen | 地衣類 |
| ホウキスミイボゴケ | ホウキスミイボゴケ | Buellia hypoleucodes (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| ホウキスミイボゴケ | ホウキスミイボゴケ | Buellia numerosa Watanuki & H.Harada | 地衣類 |
| ホウキスミイボゴケ | ホウキスミイボゴケ | Buellia placodiospora Vain. | 地衣類 |
| ボウズサワイボゴケ | ボウズサワイボゴケ | Verrucaria capitulata H.Harada | 地衣類 |
| ホウライカズラ | ホウライカズラ | Gardneria nutans Siebold et Zucc. | |
| ホウロクイチゴ | ホウロクイチゴ | Rubus sieboldii Blume | |
| ホオノキ | ホオノキ | Magnolia hypoleuca Siebold et Zucc. | |
| ホクリクアオウキクサ | ホクリクアオウキクサ | Lemna aoukikusa Beppu et Murata subsp. hokurikuensis Beppu et Murata | |
| ホクリククサボタン | ホクリククサボタン | Clematis satomiana Kadota | |
| ホクリクネコノメ | ホクリクネコノメ | Chrysosplenium fauriei Franch. | |
| ホクリクハイホラゴケ | ホクリクハイホラゴケ | Vandenboschia hokurikuensis Ebihara | シダ植物 |
| ホクリクムヨウラン | ホクリクムヨウラン | Lecanorchis japonica Blume var. hokurikuensis (Masam.) T.Hashim. | |
| ホクロクトウヒレン | ホクロクトウヒレン | Saussurea hokurokuensis (Kitam.) Kadota | |
| ホコガタフウロ | ホコガタフウロ | Geranium wilfordii Maxim. var. hastatum H.Hara | |
| ホコザキベニシダ | ホコザキベニシダ | Dryopteris koidzumiana Tagawa | シダ植物 |
| ホザキカナワラビ | ホザキカナワラビ | Arachniodes dimorphophylla (Hayata) Ching | シダ植物 |
| ホザキツリガネツツジ | ホザキツリガネツツジ | Menziesia katsumatae M.Tash. et H.Hatta | |
| ホザキマスクサ | ホザキマスクサ | Carex planata Franch. et Sav. var. angustealata Akiyama | |
| ホシザキカンアオイ | ホシザキカンアオイ | Asarum stellatum (F.Maek. ex Akasawa) T.Sugaw. | |
| ホシザキシャクジョウ | ホシザキシャクジョウ | Oxygyne shinzatoi (Hatus.) C.Abe et Akasawa | |
| ホシツルラン | ホシツルラン | Calanthe hoshii S.Kobay, | |
| ホシナシゴウソ | ホシナシゴウソ | Carex maximowiczii Miq. var. levisaccus Ohwi | |
| ホシマルミゴケ（マルミゴケモドキ） | ホシマルミゴケ（マルミゴケモドキ） | Thelidium radiatum H.Harada | 地衣類 |
| ホシマルミゴケ（マルミゴケモドキ） | ホシマルミゴケ（マルミゴケモドキ） | Thelotrema canescens Tat.Matsumoto | 地衣類 |
| ホシミゴケ | ホシミゴケ | Pyrenula tokyensis (M?ll.Arg.) H.Harada | 地衣類 |
| ホスゲ | ホスゲ | Carex senanensis Ohwi | |
| ホソエカエデ | ホソエカエデ | Acer capillipes Maxim. | |
| ホソエノアザミ | ホソエノアザミ | Cirsium tenuipedunculatum Kadota | |
| ホソガタスズメウリ | ホソガタスズメウリ | Zehneria perpusilla (Blume) Bole et M.R.Almeida var. deltifrons (Ohwi) H.Ohba | |
| ホソキゴケ | ホソキゴケ | Stereocaulon exile Asahina | 地衣類 |
| ホソキゴケ | ホソキゴケ | Stereocaulon japonicum var. subfastigiatum Asahina var. subfastigiatum Asahina | 地衣類 |
| ホソバアリノトウグサ | ホソバアリノトウグサ | Haloragis walkeri Ohwi | |
| ホソバイワガネソウ | ホソバイワガネソウ | Coniogramme gracilis Ogata | シダ植物 |
| ホソバウルップソウ | ホソバウルップソウ | Lagotis yesoensis (Miyabe et Tatew.) Tatew. | |
| ホソバエゾノコギリソウ | ホソバエゾノコギリソウ | Achillea ptarmica L. var. yezoensis Kitam. | |
| ホソバカラクサゴケ | ホソバカラクサゴケ | Parmelia angustifolia (Asahina) Kurok. | 地衣類 |
| ホソバガンクビソウ | ホソバガンクビソウ | Carpesium koidzumii Makino | |
| ホソバカンスゲ | ホソバカンスゲ | Carex temnolepis Franch. | |
| ホソバクリハラン | ホソバクリハラン | Lepisorus boninensis (H.Christ) Ching | シダ植物 |
| ホソバコウシュンシダ | ホソバコウシュンシダ | Microlepia obtusiloba Hayata var. angustata Seriz. | シダ植物 |
| ホソバコゴメグサ | ホソバコゴメグサ | Euphrasia insignis Wettst. subsp. insignis var. japonica (Wettst.) Ohwi | |
| ホソバシャクナゲ | ホソバシャクナゲ | Rhododendron makinoi Tagg ex Nakai | |
| ホソバチクセツニンジン | ホソバチクセツニンジン | Panax pseudoginseng Wall. subsp. japonicus (C.A.Mey.) H.Hara var. angustatus (Makino) H.Hara | |
| ホソバテンナンショウ | ホソバテンナンショウ | Arisaema angustatum Franch. et Sav. | |
| ホソバトウキ | ホソバトウキ | Angelica acutiloba (Siebold et Zucc.) Kitag. var. lineariloba (Koidz.) Hikino | |
| ホソバトリカブト | ホソバトリカブト | Aconitum senanense Nakai subsp. senanense var. senanense | |
| ホソバナコバイモ | ホソバナコバイモ | Fritillaria amabilis Koidz. | |
| ホソバヌカイタチシダ | ホソバヌカイタチシダ | Dryopteris gymnosora (Makino) C.Chr. var. angustata H.Itô | |
| ホソバノギク | ホソバノギク | Aster sohayakiensis Koidz. | |
| ホソバノヤマハハコ | ホソバノヤマハハコ | Anaphalis margaritacea (L.) Benth. et Hook.f. var. japonica (Sch.Bip.) Makino | |
| ホソバハグマ | ホソバハグマ | Ainsliaea faurieana Beauverd | |
| ホソバハナウド | ホソバハナウド | Heracleum sphondylium L. subsp. sphondylium var. akasimontanum (Koidz.) H.Ohba | |
| ホソバヒナウスユキソウ | ホソバヒナウスユキソウ | Leontopodium fauriei (Beauverd) Hand.-Mazz. var. angustifolium H.Hara et Kitam. | |
| ホソバヘラオモダカ | ホソバヘラオモダカ | Alisma canaliculatum A.Braun et C.D.Bouché var. harimense Makino | |
| ホソバムカシヨモギ | ホソバムカシヨモギ | Erigeron acer L. var. linearifolius (Koidz.) Kitam. | |
| ボタンキンバイソウ | ボタンキンバイソウ | Trollius altaicus C.A.Mey. subsp. pulcher (Makino) Kadota | |
| ボタンネコノメソウ | ボタンネコノメソウ | Chrysosplenium kiotoense Ohwi | |
| ホッコクアザミ | ホッコクアザミ | Cirsium hokkokuense Kitam. | |
| ホツツジ | ホツツジ | Elliottia paniculata (Siebold et Zucc.) Hook.f. | |
| ホトトギス | ホトトギス | Tricyrtis hirta (Thunb.) Hook. var. hirta | |
| ホナガクマヤナギ | ホナガクマヤナギ | Berchemia longiracemosa Okuyama | |
| ホナガタツナミソウ | ホナガタツナミソウ | Scutellaria laeteviolacea Koidz. var. maekawae (H.Hara) H.Hara | |
| ホロテンナンショウ | ホロテンナンショウ | Arisaema cucullatum M.Hotta | |
| ホンシャクナゲ | ホンシャクナゲ | Rhododendron japonoheptamerum Kitam. var. hondoense (Nakai) Kitam. | |
| ホンドハナゴケ | ホンドハナゴケ | Cladonia hondo?nsis Asahina | 地衣類 |
| ホンドハナゴケモドキ | ホンドハナゴケモドキ | Cladonia pseudohondo?nsis Asahina | 地衣類 |
| ホンドミヤマネズ | ホンドミヤマネズ | Juniperus communis L. var. hondoensis (Satake) Satake ex Sugim. | |
| ホンモンジスゲ | ホンモンジスゲ | Carex pisiformis Boott | |
| マキヤマザサ | マキヤマザサ | Sasa maculata Nakai var. maculata | |
| マシケオトギリ | マシケオトギリ | Hypericum yamamotoi Miyabe et Y.Kimura | |
| マシケレイジンソウ | マシケレイジンソウ | Aconitum mashikense Kadota | |
| マダイオウ | マダイオウ | Rumex madaio Makino | |
| マツカサススキ | マツカサススキ | Scirpus mitsukurianus Makino | |
| マツシマアザミ | マツシマアザミ | Cirsium sendaicum Nakai | |
| マツノハマンネングサ | マツノハマンネングサ | Sedum hakonense Makino | |
| マツバシバ | マツバシバ | Aristida boninensis Ohwi et Tuyama | |
| マツムシソウ | マツムシソウ | Scabiosa japonica Miq. var. japonica | |
| マツラコゴメグサ | マツラコゴメグサ | Euphrasia insignis Wettst. subsp. insignis var. pubigera (Koidz.) Murata | |
| マテバシイ | マテバシイ | Lithocarpus edulis (Makino) Nakai | |
| マネキグサ | マネキグサ | Lamium ambiguum (Makino) Ohwi | |
| マミガサキアザミ | マミガサキアザミ | Cirsium takahashii Kadota | |
| マメグミ | マメグミ | Elaeagnus montana Makino var. montana | |
| マメザクラ | マメザクラ | Cerasus incisa (Thunb.) Loisel. var. incisa | |
| マメスゲ | マメスゲ | Carex pudica Honda | |
| マルバアキグミ | マルバアキグミ | Elaeagnus umbellata Thunb. var. rotundifolia Makino | |
| マルバウスゴ | マルバウスゴ | Vaccinium shikokianum Nakai | |
| マルバウツギ | マルバウツギ | Deutzia scabra Thunb. var. scabra | |
| マルバキンレイカ | マルバキンレイカ | Patrinia gibbosa Maxim. | |
| マルバコウツギ | マルバコウツギ | Deutzia bungoensis Hatus. | |
| マルバコゴメグサ | マルバコゴメグサ | Euphrasia insignis Wettst. subsp. insignis var. nummularia (Nakai) T.Yamaz. | |
| マルバコナラ | マルバコナラ | Quercus serrata Murray subsp. serrata var. pseudovariabilis Nakai | |
| マルバゴマキ | マルバゴマキ | Viburnum sieboldii Miq. var. obovatifolium (Yanagita) Sugim. | |
| マルバコンロンソウ | マルバコンロンソウ | Cardamine tanakae Franch. et Sav. ex Maxim. | |
| マルバサツキ | マルバサツキ | Rhododendron eriocarpum (Hayata) Nakai var. eriocarpum | |
| マルバシマザクラ | マルバシマザクラ | Hedyotis mexicana (Hook. et Arn.) Hatus. | |
| マルバタウコギ | マルバタウコギ | Bidens biternata (Lour.) Merr. et Sherff var. mayebarae (Kitam.) Kitam. | |
| マルハチ | マルハチ | Cyathea mertensiana (Kunze) Copel. | シダ植物 |
| マルバテイショウソウ | マルバテイショウソウ | Ainsliaea fragrans Champ. var. integrifolia (Maxim.) Kitam. | |
| マルバニッケイ | マルバニッケイ | Cinnamomum daphnoides Siebold et Zucc. | |
| マルバヌカイタチシダモドキ | マルバヌカイタチシダモドキ | Dryopteris tsugiwoi Sa.Kurata | シダ植物 |
| マルバノイチヤクソウ | マルバノイチヤクソウ | Pyrola nephrophylla (Andres) Andres | |
| マルバノホロシ | マルバノホロシ | Solanum maximowiczii Koidz. | |
| マルバハタケムシロ | マルバハタケムシロ | Lobelia loochooensis Koidz. | |
| マルバヒレアザミ | マルバヒレアザミ | Cirsium grayanum (Maxim.) Nakai | |
| マルバマンサク | マルバマンサク | Hamamelis japonica Siebold et Zucc. var. discolor (Nakai) Sugim. | |
| マルバマンネングサ | マルバマンネングサ | Sedum makinoi Maxim. | |
| マルミカンアオイ | マルミカンアオイ | Asarum subglobosum F.Maek. ex Hatus. et Yamahata | |
| マルミゴケ | マルミゴケ | Thelidium japonicum H.Harada | 地衣類 |
| マンサク | マンサク | Hamamelis japonica Siebold et Zucc. var. japonica | |
| ミアケザサ | ミアケザサ | Sasa miakeana Sad.Suzuki | |
| ミウラハイホラゴケ | ミウラハイホラゴケ | Vandenboschia miuraensis Ebihara | シダ植物 |
| ミカエリソウ | ミカエリソウ | Leucosceptrum stellipilum (Miq.) Kitam. et Murata var. stellipilum | |
| ミカワイヌノヒゲ | ミカワイヌノヒゲ | Eriocaulon mikawanum Satake et T.Koyama | |
| ミカワザサ | ミカワザサ | Neosasamorpha pubiculmis (Makino) Sad.Suzuki subsp. sugimotoi (Nakai) Sad.Suzuki | |
| ミカワシオガマ | ミカワシオガマ | Pedicularis resupinata L. subsp. oppositifolia (Miq.) T.Yamaz. var. microphylla Honda | |
| ミカワショウマ | ミカワショウマ | Astilbe okuyamae H.Hara | |
| ミカワチャルメルソウ | ミカワチャルメルソウ | Mitella furusei Ohwi var. furusei | |
| ミカワツツジ | ミカワツツジ | Rhododendron kaempferi Planch. var. mikawanum (Makino) Makino | |
| ミカワバイケイソウ | ミカワバイケイソウ | Veratrum stamineum Maxim. var. micranthum Satake | |
| ミキノフシアナゴケ | ミキノフシアナゴケ | Mazosia japonica A.Sakata & H.Harada | 地衣類 |
| ミキノフシアナゴケ | ミキノフシアナゴケ | Melarthonis piceae Frisch & G.Thor | 地衣類 |
| ミギワトダシバ | ミギワトダシバ | Arundinella riparia Honda subsp. riparia | |
| ミクニテンナンショウ | ミクニテンナンショウ | Arisaema planilaminum J.Murata | |
| ミクラザサ | ミクラザサ | Sasa jotanii (Ke.Inoue et Tanimoto) M.Kobay. | |
| ミクラシマトウヒレン | ミクラシマトウヒレン | Saussurea mikurasimensis (Kitam.) Kadota | |
| ミクラモジゴケ | ミクラモジゴケ | Graphis mikuraensis Y.Ohmura & M.Nakan. | 地衣類 |
| ミサヤマチャヒキ | ミサヤマチャヒキ | Helictotrichon hideoi (Honda) Ohwi | |
| ミズギク | ミズギク | Inula ciliaris (Miq.) Maxim. var. ciliaris | |
| ミズスギナ | ミズスギナ | Rotala hippuris Makino | |
| ミズタカモジ | ミズタカモジ | Elymus humidus (Ohwi et Sakam.) A.Löve | |
| ミズタビラコ | ミズタビラコ | Trigonotis brevipes (Maxim.) Maxim. ex Hemsl. | |
| ミズニラモドキ | ミズニラモドキ | Isoetes pseudojaponica M.Takamiya, Mitsu.Watan. et K.Ono | シダ植物 |
| ミスミソウ | ミスミソウ | Hepatica nobilis Schreb. var. japonica Nakai | |
| ミズメ | ミズメ | Betula grossa Siebold et Zucc. | |
| ミセバヤ | ミセバヤ | Hylotelephium sieboldii (Sweet ex Hook.) H.Ohba var. sieboldii | |
| ミセンアオスゲ | ミセンアオスゲ | Carex leucochlora Bunge var. horikawae (K.Okamoto) Katsuy. | |
| ミソガワソウ | ミソガワソウ | Nepeta subsessilis Maxim. | |
| ミゾモジゴケ | ミゾモジゴケ | Hemithecium polymorphum (M.Nakan.) M.Nakan. & Kashiw. | 地衣類 |
| ミチノクエンゴサク | ミチノクエンゴサク | Corydalis capillipes Franch. | |
| ミチノクコゴメグサ | ミチノクコゴメグサ | Euphrasia maximowiczii Wettst. var. arcuata F.Maek. ex T.Yamaz. | |
| ミチノクコザクラ | ミチノクコザクラ | Primula cuneifolia Ledeb. var. heterodonta Makino | |
| ミチノクサイシン | ミチノクサイシン | Asarum fauriei Franch. var. fauriei | |
| ミチノクホタルイ | ミチノクホタルイ | Schoenoplectus orthorhizomatus (Arai et Miyam.) Hayas. et H.Ohashi | |
| ミチノクホンモンジスゲ | ミチノクホンモンジスゲ | Carex stenostachys Franch. et Sav. var. cuneata (Ohwi) Ohwi et T.Koyama | |
| ミチノクヤマタバコ | ミチノクヤマタバコ | Ligularia fauriei (Franch.) Koidz. | |
| ミチノクヨロイグサ | ミチノクヨロイグサ | Angelica anomala Ave-Lall. subsp. sachalinensis (Maxim.) H.Ohba var. glabra (Koidz.) H.Ohba | |
| ミツデカエデ | ミツデカエデ | Acer cissifolium (Siebold et Zucc.) K.Koch | |
| ミツデコトジソウ | ミツデコトジソウ | Salvia nipponica Miq. var. trisecta (Matsum. ex Kudô) Honda | |
| ミツバコンロンソウ | ミツバコンロンソウ | Cardamine anemonoides O.E.Schulz | |
| ミツバツツジ | ミツバツツジ | Rhododendron dilatatum Miq. var. dilatatum | |
| ミツバテンナンショウ | ミツバテンナンショウ | Arisaema ternatipartitum Makino | |
| ミツバノバイカオウレン | ミツバノバイカオウレン | Coptis trifoliolata (Makino) Makino | |
| ミツモリミミナグサ | ミツモリミミナグサ | Cerastium arvense L. var. mistumorense (Miyabe et Tatew.) S.Akiyama | |
| ミドウシノ | ミドウシノ | Sasaella midoensis Hatakeyama | |
| ミドリハナワラビ | ミドリハナワラビ | Botrychium triangularifolium (Sahashi) M.Kato | シダ植物 |
| ミネアザミ | ミネアザミ | Cirsium alpicola Nakai | |
| ミネウスユキソウ | ミネウスユキソウ | Leontopodium japonicum Miq. var. shiroumense Nakai ex Kitam. | |
| ミネオトギリ | ミネオトギリ | Hypericum kimurae N.Robson | |
| ミネカエデ | ミネカエデ | Acer tschonoskii Maxim. var. tschonoskii | |
| ミネザサ | ミネザサ | Sasa minensis Sad.Suzuki var. minensis | |
| ミノシライトソウ | ミノシライトソウ | Chionographis hisauchiana (Okuyama) N.Tanaka subsp. minoensis (H.Hara) N.Tanaka | |
| ミミガタテンナンショウ | ミミガタテンナンショウ | Arisaema limbatum Nakai et F.Maek. | |
| ミヤギウシオイボゴケ | ミヤギウシオイボゴケ | Verrucaria miyagiensis H.Harada | 地衣類 |
| ミヤコアオイ | ミヤコアオイ | Asarum asperum F.Maek. var. asperum | |
| ミヤコイバラ | ミヤコイバラ | Rosa paniculigera (Koidz.) Makino ex Momiy. | |
| ミヤコオトギリ | ミヤコオトギリ | Hypericum kinashianum Koidz. | |
| ミヤココケリンドウ | ミヤココケリンドウ | Gentiana takushii T.Yamaz. | |
| ミヤコザサ | ミヤコザサ | Sasa nipponica (Makino) Makino et Shibata | |
| ミヤコザサ-チマキザサ複合体 | ミヤコザサ-チマキザサ複合体 | Sasa palmata - S. nipponica complex | |
| ミヤコジマツルマメ | ミヤコジマツルマメ | Glycine koidzumii Ohwi | |
| ミヤビカンアオイ | ミヤビカンアオイ | Asarum celsum F.Maek. ex Hatus. et Yamahata | |
| ミヤマアオイ | ミヤマアオイ | Asarum fauriei Franch. var. nakaianum (F.Maek.) Ohwi | |
| ミヤマアオスゲ | ミヤマアオスゲ | Carex sachalinensis F.Schmidt var. longiuscula Ohwi | |
| ミヤマアオダモ | ミヤマアオダモ | Fraxinus apertisquamifera H.Hara | |
| ミヤマアシボソスゲ | ミヤマアシボソスゲ | Carex scita Maxim. var. scita | |
| ミヤマアブラススキ | ミヤマアブラススキ | Spodiopogon depauperatus Hack. | |
| ミヤマイタチシダ | ミヤマイタチシダ | Dryopteris sabae (Franch. et Sav.) C.Chr. | シダ植物 |
| ミヤマイタチシダ | ミヤマイタチシダ | Dryopteris sabaei (Franch. et Sav.) C.Chr. | シダ植物 |
| ミヤマイヌノハナヒゲ | ミヤマイヌノハナヒゲ | Rhynchospora yasudana Makino | |
| ミヤマウグイスカグラ | ミヤマウグイスカグラ | Lonicera gracilipes Miq. var. glandulosa Maxim. | |
| ミヤマウコギ | ミヤマウコギ | Eleutherococcus trichodon (Franch. et Sav.) H.Ohashi | |
| ミヤマウスユキソウ | ミヤマウスユキソウ | Leontopodium fauriei (Beauverd) Hand.-Mazz. var. fauriei | |
| ミヤマウド | ミヤマウド | Aralia glabra Matsum. | |
| ミヤマウメモドキ | ミヤマウメモドキ | Ilex nipponica Makino | |
| ミヤマウラジロ | ミヤマウラジロ | Cheilanthes brandtii Franch. et Sav. | シダ植物 |
| ミヤマエゾクロウスゴ | ミヤマエゾクロウスゴ | Vaccinium ovalifolium Sm. var. alpinum (Tatew.) T.Yamaz. | |
| ミヤマオトコヨモギ | ミヤマオトコヨモギ | Artemisia pedunculosa Miq. | |
| ミヤマカニツリ | ミヤマカニツリ | Trisetum koidzumianum Ohwi | |
| ミヤマカワラハンノキ | ミヤマカワラハンノキ | Alnus fauriei H.Lév. et Vaniot | |
| ミヤマカンスゲ | ミヤマカンスゲ | Carex multifolia Ohwi var. multifolia | |
| ミヤマガンピ | ミヤマガンピ | Diplomorpha albiflora (Yatabe) Nakai | |
| ミヤマキスミレ | ミヤマキスミレ | Viola brevistipulata (Franch. et Sav.) W.Becker var. acuminata Nakai | |
| ミヤマキタアザミ | ミヤマキタアザミ | Saussurea franchetii Koidz. | |
| ミヤマキヌタソウ | ミヤマキヌタソウ | Galium nakaii Kudô ex H.Hara | |
| ミヤマキハダ | ミヤマキハダ | Phellodendron amurense Rupr. var. lavallei (Dode) Sprague | |
| ミヤマキリシマ | ミヤマキリシマ | Rhododendron kiusianum Makino | |
| ミヤマクマザサ | ミヤマクマザサ | Sasa hayatae Makino var. hayatae | |
| ミヤマクマヤナギ | ミヤマクマヤナギ | Berchemia pauciflora Maxim. | |
| ミヤマクルマバナ | ミヤマクルマバナ | Clinopodium macranthum (Makino) H.Hara | |
| ミヤマクワガタ | ミヤマクワガタ | Pseudolysimachion schmidtianum (Regel) T.Yamaz. subsp. senanense (Maxim.) T.Yamaz. | |
| ミヤマコウゾリナ | ミヤマコウゾリナ | Hieracium japonicum Franch. et Sav. | |
| ミヤマコゴメグサ | ミヤマコゴメグサ | Euphrasia insignis Wettst. subsp. insignis var. insignis | |
| ミヤマコナスビ | ミヤマコナスビ | Lysimachia tanakae Maxim. | |
| ミヤマゴマシオゴケ | ミヤマゴマシオゴケ | Arthothelium scandinavicum Th.Fr. var. japonicum Vain. var. japonicum Vain. | 地衣類 |
| ミヤマゴマシオゴケ | ミヤマゴマシオゴケ | Aspicilia cinerea var. pumila R?s?nen var. pumila R?s?nen | 地衣類 |
| ミヤマゴマシオゴケ | ミヤマゴマシオゴケ | Aspicilia cremicolor Hue | 地衣類 |
| ミヤマゴマシオゴケ | ミヤマゴマシオゴケ | Aspicilia inaequata (Ach.) Hue | 地衣類 |
| ミヤマゴマシオゴケ | ミヤマゴマシオゴケ | Aspicilia incolorella (Nyl.) Hue | 地衣類 |
| ミヤマゴマシオゴケ | ミヤマゴマシオゴケ | Aspicilia mamillata R?s?nen | 地衣類 |
| ミヤマゴマシオゴケ | ミヤマゴマシオゴケ | Aspicilia nitellina Hue | 地衣類 |
| ミヤマゴマシオゴケ | ミヤマゴマシオゴケ | Aspicilia ochraceorubra R?s?nen | 地衣類 |
| ミヤマゴマシオゴケ | ミヤマゴマシオゴケ | Aspicilia prorumpens R?s?nen | 地衣類 |
| ミヤマゴマシオゴケ | ミヤマゴマシオゴケ | Aspicilia rhodopiza Hue | 地衣類 |
| ミヤマゴマシオゴケ | ミヤマゴマシオゴケ | Aspicilia straminella Hue | 地衣類 |
| ミヤマゴマシオゴケ | ミヤマゴマシオゴケ | Aspicilia tephroda Hue | 地衣類 |
| ミヤマシオガマ | ミヤマシオガマ | Pedicularis apodochila Maxim. | |
| ミヤマシシウド | ミヤマシシウド | Angelica pubescens Maxim. var. matsumurae (Y.Yabe) Ohwi | |
| ミヤマシシガシラ | ミヤマシシガシラ | Blechnum castaneum Makino | シダ植物 |
| ミヤマジュズスゲ | ミヤマジュズスゲ | Carex dissitiflora Franch. | |
| ミヤマシラスゲ | ミヤマシラスゲ | Carex confertiflora Boott | |
| ミヤマスカシユリ | ミヤマスカシユリ | Lilium maculatum Thunb. var. bukosanense (Honda) H.Hara | |
| ミヤマゼンコ | ミヤマゼンコ | Coelopleurum multisectum (Maxim.) Kitag. var. multisectum | |
| ミヤマセントウソウ | ミヤマセントウソウ | Chamaele decumbens (Thunb.) Makino var. japonica (Y.Yabe) Makino | |
| ミヤマタムラソウ | ミヤマタムラソウ | Salvia lutescens (Koidz.) Koidz. var. crenata (Makino) Murata | |
| ミヤマタンポポ | ミヤマタンポポ | Taraxacum alpicola Kitam. var. alpicola | |
| ミヤマチドリ | ミヤマチドリ | Platanthera takedae Makino subsp. takedae | |
| ミヤマチョウジザクラ | ミヤマチョウジザクラ | Cerasus apetala (Siebold et Zucc.) Ohle ex H.Ohba var. montica (Kawas. et H.Koyama) H.Ohba | |
| ミヤマツチトリモチ | ミヤマツチトリモチ | Balanophora nipponica Makino | |
| ミヤマツメクサ | ミヤマツメクサ | Arenaria macrocarpa Pursh var. jooi (Makino) H.Hara | |
| ミヤマトウキ | ミヤマトウキ | Angelica acutiloba (Siebold et Zucc.) Kitag. var. iwatensis (Kitag.) Hikino | |
| ミヤマトウヒレン | ミヤマトウヒレン | Saussurea pennata Koidz. | |
| ミヤマトリカブト | ミヤマトリカブト | Aconitum nipponicum Nakai subsp. nipponicum var. nipponicum | |
| ミヤマナミキ | ミヤマナミキ | Scutellaria shikokiana Makino var. shikokiana | |
| ミヤマナラ | ミヤマナラ | Quercus crispula Blume var. horikawae H.Ohba | |
| ミヤマナルコユリ | ミヤマナルコユリ | Polygonatum lasianthum Maxim. var. lasianthum | |
| ミヤマニンジン | ミヤマニンジン | Ostericum florentii (Franch. et Sav. ex Maxim.) Kitag. | |
| ミヤマヌカボシソウ | ミヤマヌカボシソウ | Luzula jimboi Miyabe et Kudô subsp. atrotepala Z.Kaplan | |
| ミヤマノギク | ミヤマノギク | Erigeron miyabeanus (Tatew. et Kitam.) Tatew. et Kitam. ex H.Hara | |
| ミヤマノダケ | ミヤマノダケ | Angelica cryptotaeniifolia Kitag. var. cryptotaeniifolia | |
| ミヤマハナシノブ | ミヤマハナシノブ | Polemonium caeruleum L. subsp. yezoense (Miyabe et Kudô) H.Hara var. nipponicum (Kitam.) Koji Ito | |
| ミヤマハンショウヅル | ミヤマハンショウヅル | Clematis ochotensis (Pall.) Poir. var. japonica Nakai ex H.Hara | |
| ミヤマハンモドキ | ミヤマハンモドキ | Rhamnus ishidae Miyabe et Kudô | |
| ミヤマヒキオコシ | ミヤマヒキオコシ | Rabdosia shikokiana (Makino) H.Hara var. shikokiana | |
| ミヤマホタルイ | ミヤマホタルイ | Schoenoplectus hondoensis (Ohwi) Soják | |
| ミヤマホツツジ | ミヤマホツツジ | Elliottia bracteata (Maxim.) Hook.f. | |
| ミヤマママコナ | ミヤマママコナ | Melampyrum laxum Miq. var. nikkoense Beauverd | |
| ミヤママンネングサ | ミヤママンネングサ | Sedum japonicum Siebold ex Miq. subsp. japonicum var. senanense (Makino) Makino | |
| ミヤマミミナグサ | ミヤマミミナグサ | Cerastium schizopetalum Maxim. var. schizopetalum | |
| ミヤマムラサキ | ミヤマムラサキ | Eritrichium nipponicum Makino var. nipponicum | |
| ミヤマモミジイチゴ | ミヤマモミジイチゴ | Rubus pseudoacer Makino | |
| ミヤマヤブタバコ | ミヤマヤブタバコ | Carpesium triste Maxim. | |
| ミヤマヤマブキショウマ | ミヤマヤマブキショウマ | Aruncus dioicus (Walter) Fernald var. astilboides (Maxim.) H.Hara | |
| ミヤマヨメナ | ミヤマヨメナ | Aster savatieri Makino var. savatieri | |
| ミヤマリンドウ | ミヤマリンドウ | Gentiana nipponica Maxim. var. nipponica | |
| ミョウギイワザクラ | ミョウギイワザクラ | Primula reinii Franch. et Sav. var. myogiensis H.Hara | |
| ミョウギカラマツ | ミョウギカラマツ | Thalictrum minus L. var. chionophyllum (Nakai ex F.Maek.) Emura | |
| ミョウギシダ | ミョウギシダ | Polypodium someyae Yatabe | シダ植物 |
| ミョウギシダ | ミョウギシダ | Goniophlebium someyae (Yatabe) Ebihara | シダ植物 |
| ミョウギシャジン | ミョウギシャジン | Adenophora nikoensis Franch. et Sav. var. petrophila (H.Hara) H.Hara | |
| ミョウコウアザミ | ミョウコウアザミ | Cirsium myokoense Kadota | |
| ミョウコウトリカブト | ミョウコウトリカブト | Aconitum nipponicum Nakai subsp. nipponicum var. septemcarpum (Nakai) Kadota | |
| ムカゴサイシン | ムカゴサイシン | Nervilia nipponica Makino | |
| ムカゴツヅリ | ムカゴツヅリ | Poa tuberifera Faurie ex Hack. | |
| ムカゴネコノメソウ | ムカゴネコノメソウ | Chrysosplenium maximowiczii Franch. et Sav. | |
| ムカシベニシダ | ムカシベニシダ | Dryopteris anadroma Mitsuta, nom. nud. | シダ植物 |
| ムチイボゴケ | ムチイボゴケ | Bacidia baculifera (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| ムチイボゴケ | ムチイボゴケ | Bacidia hakkodensis Kashiw. | 地衣類 |
| ムツトウヒレン | ムツトウヒレン | Saussurea hosoiana Kadota | |
| ムツノガリヤス | ムツノガリヤス | Calamagrostis matsumurae Maxim. | |
| ムニンアオガンピ | ムニンアオガンピ | Wikstroemia pseudoretusa Koidz. | |
| ムニンイヌツゲ | ムニンイヌツゲ | Ilex matanoana Makino | |
| ムニンエダウチホングウシダ | ムニンエダウチホングウシダ | Lindsaea repanda Kunze | シダ植物 |
| ムニンカラスウリ | ムニンカラスウリ | Trichosanthes ovigera Blume var. boninensis (Nakai ex Tuyama) H.Ohba | |
| ムニンキヌラン | ムニンキヌラン | Zeuxine boninensis Tuyama | |
| ムニンクロキ | ムニンクロキ | Symplocos boninensis Rehder et E.H.Wilson | |
| ムニンゴケ（ムニンプソロマゴケ） | ムニンゴケ（ムニンプソロマゴケ） | Gibbosporina boninensis (Kurok.) Elvebakk & P.M.J?rg. | 地衣類 |
| ムニンゴシュユ | ムニンゴシュユ | Euodia nishimurae Koidz. | |
| ムニンサジラン | ムニンサジラン | Loxogramme boninensis Nakai | シダ植物 |
| ムニンシャシャンボ | ムニンシャシャンボ | Vaccinium boninense Nakai | |
| ムニンシュスラン | ムニンシュスラン | Goodyera hachijoensis Yatabe var. boninensis (Nakai) T.Hashim. | |
| ムニンススキ | ムニンススキ | Miscanthus boninensis Nakai ex Honda | |
| ムニンタイトゴメ | ムニンタイトゴメ | Sedum japonicum Siebold ex Miq. subsp. boninense (T.Yamam. ex Tuyama) H.Ohba | |
| ムニンタツナミソウ | ムニンタツナミソウ | Scutellaria longituba Koidz. | |
| ムニンツツジ | ムニンツツジ | Rhododendron boninense Nakai | |
| ムニンテンツキ | ムニンテンツキ | Fimbristylis boninensis Hayata | |
| ムニンナキリスゲ | ムニンナキリスゲ | Carex hattoriana Nakai ex Tuyama | |
| ムニンネズミモチ | ムニンネズミモチ | Ligustrum micranthum Zucc. | |
| ムニンノキ | ムニンノキ | Planchonella boninensis (Nakai) Masam. et Yanagihara | |
| ムニンノボタン | ムニンノボタン | Melastoma tetramerum Hayata var. tetramerum | |
| ムニンハダカホオズキ | ムニンハダカホオズキ | Tubocapsicum boninense (Koidz.) Koidz. ex H.Hara | |
| ムニンハナガサノキ | ムニンハナガサノキ | Morinda umbellata L. subsp. boninensis (Ohwi) T.Yamaz. var. boninensis | |
| ムニンハマウド | ムニンハマウド | Angelica japonica A.Gray var. boninensis (Tuyama) T.Yamaz. | |
| ムニンヒメワラビ | ムニンヒメワラビ | Thelypteris ogasawarensis (Nakai) H.Itô ex Honda | シダ植物 |
| ムニンヒメワラビ | ムニンヒメワラビ | Macrothelypteris ogasawarensis (Nakai) Holttum | シダ植物 |
| ムニンビャクダン | ムニンビャクダン | Santalum boninense (Nakai) Tuyama | |
| ムニンヒョウタンスゲ | ムニンヒョウタンスゲ | Carex yasuii Katsuy. | |
| ムニンフトモモ | ムニンフトモモ | Meterosideros boninensis (Hayata ex Koidz.) Tuyama | |
| ムニンベニシダ | ムニンベニシダ | Dryopteris insularis Kodama var. insularis | シダ植物 |
| ムニンベニシダ | ムニンベニシダ | Dryopteris insularis Kodama | シダ植物 |
| ムニンボウラン | ムニンボウラン | Luisia boninensis Schltr. | |
| ムニンホオズキ | ムニンホオズキ | Solanum boninense Nakai ex Tuyama | |
| ムニンミドリシダ | ムニンミドリシダ | Diplazium subtripinnatum Nakai | シダ植物 |
| ムニンヤツシロラン | ムニンヤツシロラン | Gastrodia boninensis Tuyama | |
| ムニンヤツデ | ムニンヤツデ | Fatsia oligocarpella Koidz. | |
| ムラクモアオイ | ムラクモアオイ | Asarum kumageanum Masam. var. satakeanum (F.Maek.) Hatus. | |
| ムラクモアザミ | ムラクモアザミ | Cirsium maruyamanum Kitam. | |
| ムラサキツリガネツツジ | ムラサキツリガネツツジ | Menziesia multiflora Maxim. var. purpurea (Makino) Ohwi | |
| ムラサキボタンヅル | ムラサキボタンヅル | Clematis takedana Makino | |
| ムラサキマユミ | ムラサキマユミ | Euonymus lanceolatus Yatabe | |
| ムラサキヤシオツツジ | ムラサキヤシオツツジ | Rhododendron albrechtii Maxim. | |
| ムレホシゴケ（ムレゴケ） | ムレホシゴケ（ムレゴケ） | Arthonia gregantula M?ll.Arg. | 地衣類 |
| ムロウテンナンショウ | ムロウテンナンショウ | Arisaema yamatense (Nakai) Nakai subsp. yamatense | |
| メアカンキンバイ | メアカンキンバイ | Potentilla miyabei Makino | |
| メアカンフスマ | メアカンフスマ | Arenaria merckioides Maxim. | |
| メオニグジョウシノ | メオニグジョウシノ | Sasaella caudiceps (Koidz.) Koidz. var. psilovaginula Sad.Suzuki | |
| メガネチャシブゴケ | メガネチャシブゴケ | Lecanora hemiphracta Hue | 地衣類 |
| メギ | メギ | Berberis thunbergii DC. | |
| メグスリノキ | メグスリノキ | Acer maximowiczianum Miq. | |
| メダケ | メダケ | Pleioblastus simonii (Carrière) Nakai | |
| メヘゴ | メヘゴ | Cyathea ogurae (Hayata) Domin | シダ植物 |
| モイワラン | モイワラン | Cremastra aphylla T.Yukawa | |
| モエギシブゴケ（モエギレカニア） | モエギシブゴケ（モエギレカニア） | Lecania erysibe var. luridella (Nyl.) Zahlbr. var. luridella (Nyl.) Zahlbr. | 地衣類 |
| モエギシブゴケ（モエギレカニア） | モエギシブゴケ（モエギレカニア） | Lecanora aggregans Vain. | 地衣類 |
| モグリウシオイボゴケ | モグリウシオイボゴケ | Verrucaria submicrospora Nyl. | 地衣類 |
| モジゴケモドキ | モジゴケモドキ | Halegrapha yakushimensis M.Nakan. et al. | 地衣類 |
| モチツツジ | モチツツジ | Rhododendron macrosepalum Maxim. | |
| モノドラカンアオイ | モノドラカンアオイ | Asarum monodoriflorum Hatus. et Yamahata | |
| モミ | モミ | Abies firma Siebold et Zucc. | |
| モミジガサ | モミジガサ | Parasenecio delphiniifolius (Siebold et Zucc.) H.Koyama | |
| モミジカラスウリ | モミジカラスウリ | Trichosanthes multiloba Miq. | |
| モミジカラマツ | モミジカラマツ | Trautvetteria palmata Fisch. et May. var. palmata | |
| モミジコウモリ | モミジコウモリ | Parasenecio kiusianus (Makino) H.Koyama | |
| モミジタマブキ | モミジタマブキ | Parasenecio farfarifolius (Siebold et Zucc.) H.Koyama var. acerinus (Makino) H.Koyama | |
| モミジチャルメルソウ | モミジチャルメルソウ | Mitella acerina Makino | |
| モミジハグマ | モミジハグマ | Ainsliaea acerifolia Sch.Bip. var. acerifolia | |
| モミジバショウマ | モミジバショウマ | Astilbe platyphylla H.Boissieu | |
| モメンヅル | モメンヅル | Astragalus reflexistipulus Miq. | |
| モリアザミ | モリアザミ | Cirsium dipsacolepis (Maxim.) Matsum. var. dipsacolepis | |
| モリイバラ | モリイバラ | Rosa onoei Makino var. hakonensis (Franch. et Sav.) H.Ohba | |
| モロコシソウ | モロコシソウ | Lysimachia sikokiana Miq. | |
| モンテンボク | モンテンボク | Hibiscus glaber (Matsum. ex Hatt.) Matsum. ex Nakai | |
| ヤエヤマカンアオイ | ヤエヤマカンアオイ | Asarum yaeyamense Hatus. | |
| ヤエヤマコンテリギ | ヤエヤマコンテリギ | Hydrangea chinensis Maxim. var. koidzumiana H.Ohba et S.Akiyama | |
| ヤエヤマスケロクラン | ヤエヤマスケロクラン | Lecanorchis japonica Blume var. tubiformis T.Hashim. | |
| ヤエヤマスミレ | ヤエヤマスミレ | Viola tashiroi Makino | |
| ヤエヤマトラノオ | ヤエヤマトラノオ | Polystichum yaeyamense (Makino) Makino | シダ植物 |
| ヤエヤマネコノチチ | ヤエヤマネコノチチ | Rhamnella franguloides (Maxim.) Weberb. var. inaequilatera (Ohwi) Hatus. | |
| ヤエヤマノボタン | ヤエヤマノボタン | Bredia yaeyamensis (Matsum.) H.L.Li | |
| ヤエヤマヒサカキ | ヤエヤマヒサカキ | Eurya yaeyamensis Masam. | |
| ヤエヤマヒメウツギ | ヤエヤマヒメウツギ | Deutzia yaeyamensis Ohwi | |
| ヤエヤマホラシノブ | ヤエヤマホラシノブ | Sphenomeris yaeyamensis S.J.Lin, M.Kato et K.Iwats. | シダ植物 |
| ヤエヤマホラシノブ | ヤエヤマホラシノブ | Odontosoria yaeyamensis (S.J.Lin, M.Kato et K.Iwats.) Ebihara | シダ植物 |
| ヤエヤマヤシ | ヤエヤマヤシ | Satakentia liukiuensis (Hatus.) H.E.Moore | |
| ヤエヤマラセイタソウ | ヤエヤマラセイタソウ | Boehmeria yaeyamensis Hatus. | |
| ヤクイヌワラビ | ヤクイヌワラビ | Athyrium masamunei Seriz. | シダ植物 |
| ヤクシマアザミ | ヤクシマアザミ | Cirsium yakusimense Masam. | |
| ヤクシマアジサイ | ヤクシマアジサイ | Hydrangea kawagoeana Koidz. var. grosseserrata (Engl.) Hatus. | |
| ヤクシマアセビ | ヤクシマアセビ | Pieris japonica (Thunb.) D.Don ex G.Don var. yakushimensis T.Yamaz. | |
| ヤクシマイトスゲ | ヤクシマイトスゲ | Carex discoidea Boott var. perangusta (Ohwi) Katsuy. | |
| ヤクシマイトラッキョウ | ヤクシマイトラッキョウ | Allium virgunculae F.Maek. et Kitam. var. yakushimense M.Hotta | |
| ヤクシマウスユキソウ | ヤクシマウスユキソウ | Anaphalis sinica Hance var. yakusimensis (Masam.) Yahara | |
| ヤクシマウメバチソウ | ヤクシマウメバチソウ | Parnassia palustris L. var. yakusimensis (Masam.) H.Ohba | |
| ヤクシマウラボシ | ヤクシマウラボシ | Crypsinus yakuinsularis (Masam.) Tagawa | |
| ヤクシマオナガカエデ | ヤクシマオナガカエデ | Acer morifolium Koidz. | |
| ヤクシマガクウツギ | ヤクシマガクウツギ | Hydrangea luteovenosa Koidz. var. yakusimensis (Masam.) Sugim. | |
| ヤクシマカラスザンショウ | ヤクシマカラスザンショウ | Zanthoxylum yakumontanum (Sugim.) Nagam. | |
| ヤクシマカラマツ | ヤクシマカラマツ | Thalictrum tuberiferum Maxim. var. yakusimense (Koidz.) Kadota | |
| ヤクシマカワゴロモ | ヤクシマカワゴロモ | Hydrobryum puncticulatum Koidz. | |
| ヤクシマカンスゲ | ヤクシマカンスゲ | Carex morrowii Boott var. laxa Ohwi | |
| ヤクシマキジノオ | ヤクシマキジノオ | Plagiogyria adnata (Blume) Bedd. var. yakushimensis (Kansei Sato) Tagawa | シダ植物 |
| ヤクシマグミ | ヤクシマグミ | Elaeagnus yakusimensis Masam. | |
| ヤクシマコウモリ | ヤクシマコウモリ | Parasenecio yakusimensis (Masam.) H.Koyama | |
| ヤクシマコオトギリ | ヤクシマコオトギリ | Hypericum kiusianum Koidz. var. yakusimense (Koidz.) T.Kato | |
| ヤクシマコケリンドウ | ヤクシマコケリンドウ | Gentiana yakumontana Masam. | |
| ヤクシマサルオガセ | ヤクシマサルオガセ | Usnea yakushimensis Asahina | 地衣類 |
| ヤクシマサルスベリ | ヤクシマサルスベリ | Lagerstroemia subcostata Koehne var. fauriei (Koehne) Hatus. ex Yahara | |
| ヤクシマシオガマ | ヤクシマシオガマ | Pedicularis ochiaiana Makino | |
| ヤクシマシソバタツナミ | ヤクシマシソバタツナミ | Scutellaria kuromidakensis (Yahara) T.Yamaz. | |
| ヤクシマシャクナゲ | ヤクシマシャクナゲ | Rhododendron yakushimanum Nakai | |
| ヤクシマショウマ | ヤクシマショウマ | Astilbe glaberrima Nakai var. glaberrima | |
| ヤクシマショリマ | ヤクシマショリマ | Thelypteris quelpaertensis (H.Christ) Ching var. yakumontana (Masam.) Tagawa | |
| ヤクシマスミレ | ヤクシマスミレ | Viola iwagawae Makino | |
| ヤクシマセントウソウ | ヤクシマセントウソウ | Chamaele decumbens (Thunb.) Makino var. micrantha Masam. | |
| ヤクシマタニイヌワラビ | ヤクシマタニイヌワラビ | Athyrium yakusimense Tagawa | シダ植物 |
| ヤクシマチドリ | ヤクシマチドリ | Platanthera amabilis Koidz. | |
| ヤクシマトウヒレン | ヤクシマトウヒレン | Saussurea yakusimensis Masam. | |
| ヤクシマトンボ | ヤクシマトンボ | Platanthera mandarinorum Rchb.f. subsp. hachijoensis (Honda) Murata var. masamunei K.Inoue | |
| ヤクシマニガナ | ヤクシマニガナ | Ixeris parva (Kitam.) Yahara | |
| ヤクシマノガリヤス | ヤクシマノガリヤス | Calamagrostis masamunei Honda | |
| ヤクシマノギク | ヤクシマノギク | Aster yakushimensis (Kitam.) Soejima et Yahara | |
| ヤクシマノギラン | ヤクシマノギラン | Metanarthecium luteoviride Maxim. var. nutans Masam. | |
| ヤクシマノダケ | ヤクシマノダケ | Angelica yakusimensis H.Hara | |
| ヤクシマハコベ | ヤクシマハコベ | Stellaria diversiflora Maxim. var. yakumontana (Masam.) Masam. | |
| ヤクシマハシカグサ | ヤクシマハシカグサ | Neanotis hirsuta (L.f.) W.H.Lewis var. yakusimensis (Masam.) W.H.Lewis | |
| ヤクシマハチジョウシダ | ヤクシマハチジョウシダ | Pteris yakuinsularis Sa.Kurata | シダ植物 |
| ヤクシマヒヨドリ | ヤクシマヒヨドリ | Eupatorium yakushimense Masam. et Kitam. | |
| ヤクシマフウロ | ヤクシマフウロ | Geranium shikokianum Matsum. var. yoshiianum (Koidz.) H.Hara | |
| ヤクシマママコナ | ヤクシマママコナ | Melampyrum laxum Miq. var. yakusimense (Tuyama) Kitam. | |
| ヤクシマミツバツツジ | ヤクシマミツバツツジ | Rhododendron yakumontanum (T.Yamaz.) T.Yamaz. | |
| ヤクシマムグラ | ヤクシマムグラ | Galium kamtschaticum Steller ex Roem. et Schult. var. yakusimense (Masam.) T.Yamaz. | |
| ヤクシマモジゴケ | ヤクシマモジゴケ | Leiorreuma yakushimense (M.Nakan.) M.Nakan. & Kashiw. | 地衣類 |
| ヤクシマヤダケ | ヤクシマヤダケ | Pseudosasa owatarii (Makino) Makino ex Nakai | |
| ヤクシマヤマツツジ | ヤクシマヤマツツジ | Rhododendron scabrum G.Don var. yakuinsulare (Masam.) T.Yamaz. | |
| ヤクシマヤマムグラ | ヤクシマヤマムグラ | Galium pogonanthum Franch. et Sav. var. yakumontanum T.Yamaz. | |
| ヤクシマヨウラクツツジ | ヤクシマヨウラクツツジ | Menziesia yakushimensis M.Tash. et H.Hatta | |
| ヤクシマラン | ヤクシマラン | Apostasia nipponica Masam. | |
| ヤクシマリンドウ | ヤクシマリンドウ | Gentiana yakushimensis Makino | |
| ヤクタネゴヨウ | ヤクタネゴヨウ | Pinus amamiana Koidz. | |
| ヤクノヒナホシ | ヤクノヒナホシ | Oxygyne yamashitae Yahara et Tsukaya | |
| ヤクムヨウラン | ヤクムヨウラン | Lecanorchis nigricans Honda var. yakusimensis T.Hashim. | |
| ヤシャゼンマイ | ヤシャゼンマイ | Osmunda lancea Thunb. | シダ植物 |
| ヤシャダケ | ヤシャダケ | Semiarundinaria yashadake (Makino) Makino | |
| ヤシャブシ | ヤシャブシ | Alnus firma Siebold et Zucc. | |
| ヤダケ | ヤダケ | Pseudosasa japonica (Siebold et Zucc. ex Steud.) Makino ex Nakai | |
| ヤチアザミ | ヤチアザミ | Cirsium shinanense T.Shimizu | |
| ヤチトリカブト | ヤチトリカブト | Aconitum senanense Nakai subsp. paludicola (Nakai) Kadota | |
| ヤチマタイカリソウ | ヤチマタイカリソウ | Epimedium grandiflorum C.Morren var. grandiflorum | |
| ヤツガタケキンポウゲ | ヤツガタケキンポウゲ | Ranunculus yatsugatakensis Honda et Kumazawa | |
| ヤツガタケタンポポ | ヤツガタケタンポポ | Taraxacum yatsugatakense H.Koidz. | |
| ヤツガタケトウヒ | ヤツガタケトウヒ | Picea koyamae Shiras. | |
| ヤツタカネアザミ | ヤツタカネアザミ | Cirsium yatsualpicola Kadota et Y.Amano | |
| ヤドリホウネンゴケ | ヤドリホウネンゴケ | Phacopsis prolificans (M?ll.Arg.) Triebel & Rambold | 地衣類 |
| ヤドリホウネンゴケ | ヤドリホウネンゴケ | Phaeocalicium triseptatum Tibell | 地衣類 |
| ヤドリホウネンゴケ | ヤドリホウネンゴケ | Phaeographis fumarprotocetrarica M.Nakan. et al. | 地衣類 |
| ヤナギノギク | ヤナギノギク | Aster hispidus Thunb. var. leptocladus (Makino) Okuyama | |
| ヤハズアジサイ | ヤハズアジサイ | Hydrangea sikokiana Maxim. | |
| ヤハズトウヒレン | ヤハズトウヒレン | Saussurea sagitta Franch. var. sagitta | |
| ヤハズハンノキ | ヤハズハンノキ | Alnus matsumurae Callier | |
| ヤハズヒゴタイ | ヤハズヒゴタイ | Saussurea triptera Maxim. | |
| ヤハズマンネングサ | ヤハズマンネングサ | Sedum tosaense Makino | |
| ヤヒコザサ | ヤヒコザサ | Sasa yahikoensis Makino var. yahikoensis | |
| ヤブイバラ | ヤブイバラ | Rosa onoei Makino var. onoei | |
| ヤブウツギ | ヤブウツギ | Weigela floribunda (Siebold et Zucc.) K.Koch | |
| ヤブザサ | ヤブザサ | Sasaella hidaensis (Makino) Makino var. iwatekensis (Makino et Uchida) Sad.Suzuki | |
| ヤブヒョウタンボク | ヤブヒョウタンボク | Lonicera linderifolia Maxim. var. linderifolia | |
| ヤブマオ | ヤブマオ | Boehmeria japonica (L.f.) Miq. var. longispica (Steud.) Yahara | |
| ヤブムグラ | ヤブムグラ | Galium niewerthii Franch. et Sav. | |
| ヤブレガサゴケ（ヤマトパウリア） | ヤブレガサゴケ（ヤマトパウリア） | Paulia japonica Asahina | 地衣類 |
| ヤブレガサモドキ | ヤブレガサモドキ | Syneilesis tagawae (Kitam.) Kitam. var. tagawae | |
| ヤマアザミ | ヤマアザミ | Cirsium spicatum (Maxim.) Matsum. | |
| ヤマアマドコロ | ヤマアマドコロ | Polygonatum odoratum (Mill.) Druce var. thunbergii (C.Morren et Decne.) H.Hara | |
| ヤマイワカガミ | ヤマイワカガミ | Schizocodon ilicifolius Maxim. var. intercedens (Ohwi) T.Yamaz. | |
| ヤマウグイスカグラ | ヤマウグイスカグラ | Lonicera gracilipes Miq. var. gracilipes | |
| ヤマウコギ | ヤマウコギ | Eleutherococcus spinosus (L.f.) S.Y.Hu var. spinosus | |
| ヤマウスユキソウ | ヤマウスユキソウ | Leontopodium japonicum Miq. var. orogenes Hand.-Mazz. | |
| ヤマオオイトスゲ | ヤマオオイトスゲ | Carex clivorum Ohwi | |
| ヤマオオウシノケグサ | ヤマオオウシノケグサ | Festuca rubra L. var. hondoensis Ohwi | |
| ヤマオダマキ | ヤマオダマキ | Aquilegia buergeriana Siebold et Zucc. var. buergeriana | |
| ヤマグチタニイヌワラビ | ヤマグチタニイヌワラビ | Athyrium otophorum (Miq.) Koidz. var. okanum Sa.Kurata | |
| ヤマグチテンナンショウ | ヤマグチテンナンショウ | Arisaema suwoense Nakai | |
| ヤマクボスゲ | ヤマクボスゲ | Carex hymenodon Ohwi | |
| ヤマクラマゴケ | ヤマクラマゴケ | Selaginella tamamontana Seriz. | |
| ヤマクワガタ | ヤマクワガタ | Veronica japonensis Makino | |
| ヤマザクラ | ヤマザクラ | Cerasus jamasakura (Siebold ex Koidz.) H.Ohba var. jamasakura | |
| ヤマザトマムシグサ | ヤマザトマムシグサ | Arisaema galeiforme Seriz. | |
| ヤマジオウ | ヤマジオウ | Lamium humile (Miq.) Maxim. | |
| ヤマジノタツナミソウ | ヤマジノタツナミソウ | Scutellaria amabilis H.Hara | |
| ヤマジノテンナンショウ | ヤマジノテンナンショウ | Arisaema solenochlamis Nakai ex F.Maek. | |
| ヤマジノホトトギス | ヤマジノホトトギス | Tricyrtis affinis Makino | |
| ヤマシャクヤク | ヤマシャクヤク | Paeonia japonica (Makino) Miyabe et Takeda | |
| ヤマシロネコノメ | ヤマシロネコノメ | Chrysosplenium pseudopilosum Wakab. et Hir.Takah. var. divaricatistylosum Wakab. et Hir.Takah. | |
| ヤマスカシユリ | ヤマスカシユリ | Lilium maculatum Thunb. var. monticola H.Hara | |
| ヤマタイミンガサ | ヤマタイミンガサ | Parasenecio yatabei (Matsum. et Koidz.) H.Koyama var. yatabei | |
| ヤマタヌキラン | ヤマタヌキラン | Carex angustisquama Franch. | |
| ヤマタバコ | ヤマタバコ | Ligularia angusta (Nakai) Kitam. | |
| ヤマツツジ | ヤマツツジ | Rhododendron kaempferi Planch. var. kaempferi | |
| ヤマテキリスゲ | ヤマテキリスゲ | Carex flabellata H.Lév. et Vaniot | |
| ヤマトアオダモ | ヤマトアオダモ | Fraxinus longicuspis Siebold et Zucc. | |
| ヤマトアナイボゴケ（ヤマトアナツブゴケ） | ヤマトアナイボゴケ（ヤマトアナツブゴケ） | Verrucaria nipponica Zahlbr. | 地衣類 |
| ヤマトアナイボゴケ（ヤマトアナツブゴケ） | ヤマトアナイボゴケ（ヤマトアナツブゴケ） | Verrucaria praevia Nyl. | 地衣類 |
| ヤマトキホコリ | ヤマトキホコリ | Elatostema laetevirens Makino | |
| ヤマトグサ | ヤマトグサ | Theligonum japonicum Okubo et Makino | |
| ヤマトコナユキゴケモドキ | ヤマトコナユキゴケモドキ | Inoderma nipponicum Frisch et al. | 地衣類 |
| ヤマトテンナンショウ | ヤマトテンナンショウ | Arisaema longilaminum Nakai | |
| ヤマトニセゴマゴケ | ヤマトニセゴマゴケ | Anisomeridium japonicum H.Harada | 地衣類 |
| ヤマトフウロ | ヤマトフウロ | Geranium shikokianum Matsum. var. yamatense H.Hara | |
| ヤマトホシクサ | ヤマトホシクサ | Eriocaulon japonicum Koern. | |
| ヤマトムキミゴケ | ヤマトムキミゴケ | Psoroglaena japonica H.Harada | 地衣類 |
| ヤマトユキザサ | ヤマトユキザサ | Smilacina viridiflora Nakai | |
| ヤマトリカブト | ヤマトリカブト | Aconitum japonicum Thunb. subsp. japonicum | |
| ヤマトレンギョウ | ヤマトレンギョウ | Forsythia japonica Makino | |
| ヤマナシウマノミツバ | ヤマナシウマノミツバ | Sanicula kaiensis Makino et Hisauti | |
| ヤマノコギリソウ | ヤマノコギリソウ | Achillea alpina L. subsp. alpina var. discoidea (Regel) Kitam. | |
| ヤマハコベ | ヤマハコベ | Stellaria uchiyamana Makino | |
| ヤマヒョウタンボク | ヤマヒョウタンボク | Lonicera mochidzukiana Makino var. nomurana (Makino) Nakai | |
| ヤマヒヨドリバナ | ヤマヒヨドリバナ | Eupatorium variabile Makino | |
| ヤマフジ | ヤマフジ | Wisteria brachybotrys Siebold et Zucc. | |
| ヤマホオズキ | ヤマホオズキ | Physalis chamaesarachoides Makino | |
| ヤマホタルブクロ | ヤマホタルブクロ | Campanula punctata Lam. var. hondoensis (Kitam.) Ohwi | |
| ヤマミゾソバ | ヤマミゾソバ | Persicaria thunbergii (Siebold et Zucc.) H.Gross var. oreophila (Makino) Murai | |
| ヤマモミジ | ヤマモミジ | Acer amoenum Carrière var. matsumurae (Koidz.) K.Ogata | |
| ヤマモモイボゴケ | ヤマモモイボゴケ | Bacidia myricicola (Vain.) Yasuda | 地衣類 |
| ヤマヤナギ | ヤマヤナギ | Salix sieboldiana Blume | |
| ヤマユリ | ヤマユリ | Lilium auratum Lindl. var. auratum | |
| ヤマルリソウ | ヤマルリソウ | Omphalodes japonica (Thunb.) Maxim. var. japonica | |
| ヤマルリトラノオ | ヤマルリトラノオ | Pseudolysimachion ovatum (Nakai) T.Yamaz. subsp. miyabei (Nakai et Honda) T.Yamaz. var. japonicum (Miq.) T.Yamaz. | |
| ヤマワキオゴケ | ヤマワキオゴケ | Cynanchum yamanakae Ohwi et H.Ohashi | |
| ヤロード | ヤロード | Neisosperma nakaianum (Koidz.) Fosberg et Sachet | |
| ヤワラハチジョウシダ | ヤワラハチジョウシダ | Pteris natiensis Tagawa | シダ植物 |
| ヤワラミヤマカンスゲ | ヤワラミヤマカンスゲ | Carex multifolia Ohwi var. imbecillis Ohwi | |
| ヤンバルマルゴケ | ヤンバルマルゴケ | Porina yambaruensis H.Harada | 地衣類 |
| ユウガギク | ユウガギク | Aster iinumae Kitam. | |
| ユウバリカニツリ | ユウバリカニツリ | Deschampsia cespitosa (L.) P.Beauv. var. levis (Takeda) Ohwi | |
| ユウバリキタアザミ | ユウバリキタアザミ | Saussurea kudoana Tatew. et Kitam. var. yuparensis Kitam. | |
| ユウバリキンバイ | ユウバリキンバイ | Potentilla matsumurae Th.Wolf var. yuparensis (Miyabe et Tatew.) Kudô ex H.Hara | |
| ユウバリクモマグサ | ユウバリクモマグサ | Saxifraga bronchialis L. subsp. funstonii (Small) Hultén var. yuparensis (Nosaka) T.Shimizu | |
| ユウパリコザクラ | ユウパリコザクラ | Primula yuparensis Takeda | |
| ユウバリソウ | ユウバリソウ | Lagotis takedana Miyabe et Tatew. | |
| ユウバリリンドウ | ユウバリリンドウ | Gentianella yuparensis (Takeda) Satake | |
| ユキイヌノヒゲ | ユキイヌノヒゲ | Eriocaulon dimorphoelytrum T.Koyama | |
| ユキグニカンアオイ | ユキグニカンアオイ | Asarum ikegamii (F.Maek. ex Y.Maek.) T.Sugaw. var. ikegamii | |
| ユキグニハリスゲ | ユキグニハリスゲ | Carex semihyalofructa Tak.Shimizu | |
| ユキグニミツバツツジ | ユキグニミツバツツジ | Rhododendron lagopus Nakai var. niphophilum (T.Yamaz.) T.Yamaz. | |
| ユキクラヌカボ | ユキクラヌカボ | Agrostis hideoi Ohwi | |
| ユキツバキ | ユキツバキ | Camellia japonica L. var. decumbens Sugim. | |
| ユキバヒゴタイ | ユキバヒゴタイ | Saussurea chionophylla Takeda | |
| ユキミバナ | ユキミバナ | Strobilanthes wakasana Wakasugi et Naruh. | |
| ユキモチソウ | ユキモチソウ | Arisaema sikokianum Franch. et Sav. | |
| ユキヨモギ | ユキヨモギ | Artemisia momiyamae Kitam. | |
| ユキワリイチゲ | ユキワリイチゲ | Anemone keiskeana T.Itô ex Maxim. | |
| ユキワリコザクラ | ユキワリコザクラ | Primula modesta Bisset et S.Moore var. fauriei (Franch.) Takeda | |
| ユキワリソウ | ユキワリソウ | Primula modesta Bisset et S.Moore var. modesta | |
| ユクノキ | ユクノキ | Cladrastis sikokiana (Makino) Makino | |
| ユズリハワダン | ユズリハワダン | Crepidiastrum ameristophyllum (Nakai) Nakai | |
| ユビソヤナギ | ユビソヤナギ | Salix hukaoana Kimura | |
| ユモトマムシグサ | ユモトマムシグサ | Arisaema nikoense Nakai subsp. nikoense | |
| ユワンオニドコロ | ユワンオニドコロ | Dioscorea tabatae Hatus. ex Yamashita et M.N.Tamura | |
| ヨウジョウクロヒゲモドキ | ヨウジョウクロヒゲモドキ | Tricharia kashiwadanii G.Thor et al. | 地衣類 |
| ヨウラクツツジ | ヨウラクツツジ | Menziesia purpurea Maxim. | |
| ヨコグラノキ | ヨコグラノキ | Berchemiella berchemiifolia (Makino) Nakai | |
| ヨコグラブドウ | ヨコグラブドウ | Vitis saccharifera Makino var. yokogurana (Makino) Ohwi | |
| ヨコタカラタチゴケ | ヨコタカラタチゴケ | Ramalina yokotae Kashiw. & K.H.Moon | 地衣類 |
| ヨコハマダケ | ヨコハマダケ | Pleioblastus matsunoi Nakai | |
| ヨゴレネコノメ | ヨゴレネコノメ | Chrysosplenium macrostemon Maxim. var. atrandrum H.Hara | |
| ヨシナガチブサゴケ | ヨシナガチブサゴケ | Thelotrema foveolare M?ll.Arg. | 地衣類 |
| ヨシナガチブサゴケ | ヨシナガチブサゴケ | Thelotrema infundibulare Tat.Matsumoto | 地衣類 |
| ヨシノアザミ | ヨシノアザミ | Cirsium yoshinoi Nakai | |
| ヨシノヤナギ | ヨシノヤナギ | Salix yoshinoi Koidz. | |
| ヨシムラサワイボゴケ | ヨシムラサワイボゴケ | Verrucaria yoshimurae H.Harada | 地衣類 |
| ヨシムラマルゴケ | ヨシムラマルゴケ | Porina yoshimurae H.Harada | 地衣類 |
| ヨシムラマルゴケ | ヨシムラマルゴケ | Protoblastenia vakavae R?s?nen | 地衣類 |
| ヨツバシオガマ | ヨツバシオガマ | Pedicularis chamissonis Steven var. japonica (Miq.) Maxim. | |
| ヨナクニイソノギク | ヨナクニイソノギク | Aster walkeri (Kitam.) Kitam. ex Shimabuku | |
| ヨナクニカモメヅル | ヨナクニカモメヅル | Cynanchum yonakuniense Hatus. | |
| ヨナクニトキホコリ | ヨナクニトキホコリ | Elatostema yonakuniense Hatus. | |
| ヨメナ | ヨメナ | Aster yomena (Kitam.) Honda var. yomena | |
| ヨモギダコチク | ヨモギダコチク | Sasaella masamuneana (Makino) Hatus. et Muroi var. amoena (Nakai) Sad.Suzuki | |
| ラセイタソウ | ラセイタソウ | Boehmeria biloba Wedd. | |
| ラセイタタマアジサイ | ラセイタタマアジサイ | Hydrangea involucrata Siebold var. idzuensis Hayashi | |
| ランヨウアオイ | ランヨウアオイ | Asarum blumei Duch. | |
| リクチュウダケ | リクチュウダケ | Semiarundinaria kagamiana Makino | |
| リシリアザミ | リシリアザミ | Cirsium umezawanum Kadota | |
| リシリハタザオ | リシリハタザオ | Arabidopsis umezawana Kadota | |
| リシリヒナゲシ | リシリヒナゲシ | Papaver nudicaule L. var. fauriei Fedde | |
| リュウキュウアセビ | リュウキュウアセビ | Pieris koidzumiana Ohwi | |
| リュウキュウアリドオシ | リュウキュウアリドオシ | Damnacanthus biflorus (Rehder) Masam. | |
| リュウキュウイタチシダ | リュウキュウイタチシダ | Dryopteris sparsa (Buch.-Ham. ex D.Don) Kuntze var. ryukyuensis Seriz. | |
| リュウキュウウマノスズクサ | リュウキュウウマノスズクサ | Aristolochia liukiuensis Hatus. | |
| リュウキュウオオハイホラゴケ | リュウキュウオオハイホラゴケ | Vandenboschia oshimensis (H.Christ) Ebihara | シダ植物 |
| リュウキュウガシワ | リュウキュウガシワ | Cynanchum liukiuense Warb. | |
| リュウキュウカラスウリ | リュウキュウカラスウリ | Trichosanthes miyagii Hayata | |
| リュウキュウカラタチゴケ | リュウキュウカラタチゴケ | Ramalina ryukyuensis Kashiw. & K.H.Moon | 地衣類 |
| リュウキュウクロウメモドキ | リュウキュウクロウメモドキ | Rhamnus liukiuensis (E.H.Wilson) Koidz. | |
| リュウキュウコケリンドウ | リュウキュウコケリンドウ | Gentiana satsunanensis T.Yamaz. | |
| リュウキュウコスミレ | リュウキュウコスミレ | Viola yedoensis Makino var. pseudojaponica (Nakai) T.Hashim. | |
| リュウキュウコンテリギ | リュウキュウコンテリギ | Hydrangea liukiuensis Nakai | |
| リュウキュウスズカケ | リュウキュウスズカケ | Veronicastrum liukiuense (Ohwi) T.Yamaz. | |
| リュウキュウタイゲキ | リュウキュウタイゲキ | Chamaesyce liukiuensis (Hayata) H.Hara | |
| リュウキュウタチスゲ | リュウキュウタチスゲ | Carex tetsuoi Ohwi | |
| リュウキュウチク | リュウキュウチク | Pleioblastus linearis (Hack.) Nakai | |
| リュウキュウツルグミ | リュウキュウツルグミ | Elaeagnus liukiuensis Rehder | |
| リュウキュウツワブキ | リュウキュウツワブキ | Farfugium japonicum (L.) Kitam. var. luchuense (Masam.) Kitam. | |
| リュウキュウナガエサカキ | リュウキュウナガエサカキ | Adinandra ryukyuensis Masam. | |
| リュウキュウハイノキ | リュウキュウハイノキ | Symplocos okinawensis Matsum. | |
| リュウキュウハグマ | リュウキュウハグマ | Ainsliaea apiculata Sch.Bip. var. acerifolia Masam. | |
| リュウキュウハナイカダ | リュウキュウハナイカダ | Helwingia japonica (Thunb.) F.Dietr. subsp. liukiuensis (Hatus.) H.Hara et S.Kuros. | |
| リュウキュウヒエスゲ | リュウキュウヒエスゲ | Carex collifera Ohwi | |
| リュウキュウホラゴケ | リュウキュウホラゴケ | Vandenboschia liukiuensis (Y.Yabe) Tagawa | |
| リュウキュウマツ | リュウキュウマツ | Pinus luchuensis Mayr | |
| リュウキュウマユミ | リュウキュウマユミ | Euonymus lutchuensis T.Itô | |
| リュウキュウミヤマシキミ | リュウキュウミヤマシキミ | Skimmia japonica Thunb. var. lutchuensis (Nakai) Hatus. ex T.Yamaz. | |
| リュウキュウモチ | リュウキュウモチ | Ilex liukiuensis Loes. | |
| リュウキュウヤツデ | リュウキュウヤツデ | Fatsia japonica (Thunb.) Decne. et Planch. var. liukiuensis Hatus. ex H.Ohba | |
| リュウキュウワタヘリゴケ | リュウキュウワタヘリゴケ | Byssoloma discordans (Vain.) Zahlbr. var. flavescens G.Thor et al. var. flavescens G.Thor et al. | 地衣類 |
| リュウノウギク | リュウノウギク | Chrysanthemum makinoi Matsum. et Nakai var. makinoi | |
| リュウノヤブマオ | リュウノヤブマオ | Boehmeria tosaensis Miyazaki et H.Ohba | |
| リュウビンタイモドキ | リュウビンタイモドキ | Marattia boninensis Nakai | シダ植物 |
| リュウビンタイモドキ | リュウビンタイモドキ | Ptisana boninensis (Nakai) Yonek. | シダ植物 |
| リョウウアザミ | リョウウアザミ | Cirsium domonii Kadota | |
| リョウノウアザミ | リョウノウアザミ | Cirsium grandirosuliferum Kadota | |
| リョウハクトリカブト | リョウハクトリカブト | Aconitum zigzag H.Lév. et Vaniot subsp. ryohakuense Kadota | |
| リンドウ | リンドウ | Gentiana scabra Bunge var. buergeri (Miq.) Maxim. ex Franch. et Sav. | |
| ルリソウ | ルリソウ | Omphalodes krameri Franch. et Sav. | |
| ルリデライヌワラビ | ルリデライヌワラビ | Athyrium wardii (Hook.) Makino var. inadae Tagawa | |
| レイジンソウ | レイジンソウ | Aconitum loczyanum Rapaics | |
| レブンアツモリソウ | レブンアツモリソウ | Cypripedium macranthos Sw. var. rebunense (Kudô) Miyabe et Kudô | |
| レブンコザクラ | レブンコザクラ | Primula modesta Bisset et S.Moore var. matsumurae (Petitm.) Takeda | |
| レブンソウ | レブンソウ | Oxytropis megalantha H.Boissieu | |
| レブントウヒレン | レブントウヒレン | Saussurea riederi Herder var. insularis | |
| レンゲショウマ | レンゲショウマ | Anemonopsis macrophylla Siebold et Zucc. | |
| レンゲツツジ | レンゲツツジ | Rhododendron molle (Blume) G.Don subsp. japonicum (A.Gray) K.Kron | |
| ロッカクイ | ロッカクイ | Schoenoplectus mucropnatus (L.) Palla var. ishizawae K.Kohno, Iokawa et Daigobo | |
| ワカサトウヒレン | ワカサトウヒレン | Saussurea wakasugiana Kadota | |
| ワカサハマギク | ワカサハマギク | Chrysanthemum makinoi Matsum. et Nakai var. wakasaense (Shimot. ex Kitam.) Kitam. | |
| ワガトリカブト | ワガトリカブト | Aconitum okuyamae Nakai var. wagaense Kadota | |
| ワセオバナ | ワセオバナ | Saccharum spontaneum L. var. arenicola (Ohwi) Ohwi | |
| ワタゲサルオガセモドキ | ワタゲサルオガセモドキ | Usnea subintumescens Asahina | 地衣類 |
| ワダツミノキ | ワダツミノキ | Nothapodytes amamianus Nagam. et Mak.Kato | |
| ワタナベソウ | ワタナベソウ | Peltoboykinia watanabei (Yatabe) H.Hara | |
| ワタムキアザミ | ワタムキアザミ | Cirsium tashiroi Kitam. var. tashiroi | |
| ワタリスゲ | ワタリスゲ | Carex conicoides Honda | |
| ワダン | ワダン | Crepidiastrum platyphyllum (Franch. et Sav.) Kitam. | |
| ワダンノキ | ワダンノキ | Dendrocacalia crepidifolia (Nakai) Nakai |
